49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2134 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2134  Glucuronoarabinoxylan endo-1,4-beta-xylanase  100 
 
 		 413 aa  853    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.300272  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04558  xylanase  58.15 
 
 		 406 aa  493  9.999999999999999e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.992142  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  43.1 
 
 		 630 aa  308  9e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  41.99 
 
 		 629 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  42.01 
 
 		 681 aa  295  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  40.49 
 
 		 1217 aa  294  2e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  31.91 
 
 		 532 aa  177  4e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6735  glycoside hydrolase family 30  26.73 
 
 		 485 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.39769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  26.5 
 
 		 648 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2261  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  26.62 
 
 		 514 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103038  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4356  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  28.38 
 
 		 603 aa  99.8  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.641869  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2067  glycoside hydrolase family protein  23.71 
 
 		 480 aa  99  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0826948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6736  glycoside hydrolase family 30  26.57 
 
 		 485 aa  96.7  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.338177 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1287  glucosylceramidase  25 
 
 		 476 aa  95.9  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  28.67 
 
 		 695 aa  94.4  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1563  glycoside hydrolase family protein  23.36 
 
 		 487 aa  93.2  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.361336  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1562  glycoside hydrolase family protein  26.25 
 
 		 487 aa  92.4  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4153  glucosylceramidase  24.91 
 
 		 472 aa  92.8  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450582  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0296  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  26.04 
 
 		 484 aa  91.3  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6250  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  27.23 
 
 		 627 aa  89.7  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04190  glycoside hydrolase family 30  22.76 
 
 		 445 aa  89  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3362  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  25.22 
 
 		 497 aa  88.6  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5601  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  25.51 
 
 		 505 aa  88.2  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  25 
 
 		 688 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  24.89 
 
 		 726 aa  86.7  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1566  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  27.61 
 
 		 474 aa  86.7  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1106  glycoside hydrolase family protein  24.26 
 
 		 488 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0729101  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3590  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  26.16 
 
 		 486 aa  86.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00155681  hitchhiker  0.000521994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  25.82 
 
 		 603 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1268  glucosylceramidase  23.39 
 
 		 475 aa  80.5  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  27.46 
 
 		 647 aa  79.7  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0858  glycoside hydrolase family protein  23.01 
 
 		 445 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2994  glucosylceramidase  26.33 
 
 		 481 aa  76.3  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389806  hitchhiker  0.000000219808 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0445  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  26.06 
 
 		 501 aa  76.3  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0097  Glucosylceramidase  21.31 
 
 		 446 aa  73.9  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3714  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  27.18 
 
 		 666 aa  73.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00391353 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5017  glycoside hydrolase family 30  23.06 
 
 		 484 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000784671  normal  0.283576 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4708  O-Glycosyl hydrolase family 30  24.39 
 
 		 447 aa  66.6  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.319201  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34530  O-glycosyl hydrolase  21.15 
 
 		 447 aa  66.6  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0928159  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3404  glycoside hydrolase family protein  22.26 
 
 		 441 aa  65.1  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.316905  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  39.06 
 
 		 982 aa  64.3  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1833  O-glycosyl hydrolase  21.77 
 
 		 445 aa  63.9  0.000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  32.71 
 
 		 634 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4557  O-Glycosyl hydrolase-like protein  22.73 
 
 		 494 aa  58.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00623956  normal  0.0160771 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1960  hypothetical protein  23.15 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.148725  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2880  hypothetical protein  35.56 
 
 		 537 aa  46.6  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1516  glycoside hydrolase family 30  22.52 
 
 		 481 aa  46.2  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4280  beta-glycosidase  20.8 
 
 		 522 aa  44.3  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  23.96 
 
 		 803 aa  43.9  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>