46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B4708 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B4708  O-Glycosyl hydrolase family 30  100 
 
 		 447 aa  936    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.319201  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3404  glycoside hydrolase family protein  47.28 
 
 		 441 aa  420  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.316905  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0858  glycoside hydrolase family protein  40.41 
 
 		 445 aa  373  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0097  Glucosylceramidase  37.17 
 
 		 446 aa  311  1e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04190  glycoside hydrolase family 30  39.13 
 
 		 445 aa  298  1e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6735  glycoside hydrolase family 30  36.75 
 
 		 485 aa  286  5e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.39769 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1287  glucosylceramidase  35.86 
 
 		 476 aa  275  1.0000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1268  glucosylceramidase  34.35 
 
 		 475 aa  268  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1563  glycoside hydrolase family protein  33.71 
 
 		 487 aa  266  4e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.361336  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1562  glycoside hydrolase family protein  35.48 
 
 		 487 aa  265  1e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0296  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  30.57 
 
 		 484 aa  201  1.9999999999999998e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  29.35 
 
 		 648 aa  186  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3590  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  29.93 
 
 		 486 aa  186  6e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00155681  hitchhiker  0.000521994 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2067  glycoside hydrolase family protein  30.9 
 
 		 480 aa  185  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0826948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6736  glycoside hydrolase family 30  28.02 
 
 		 485 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.338177 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2261  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  27.32 
 
 		 514 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103038  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5601  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  28.89 
 
 		 505 aa  179  5.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3714  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  28.83 
 
 		 666 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00391353 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6250  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  28.73 
 
 		 627 aa  168  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0445  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  25.93 
 
 		 501 aa  167  4e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3362  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  31.35 
 
 		 497 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4153  glucosylceramidase  27.59 
 
 		 472 aa  165  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450582  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54536  predicted protein  27.12 
 
 		 859 aa  162  1e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4356  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  27.29 
 
 		 603 aa  162  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.641869  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3714  glycosy hydrolase family protein  24.54 
 
 		 567 aa  160  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.171767  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  30.56 
 
 		 695 aa  160  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2994  glucosylceramidase  28.91 
 
 		 481 aa  160  6e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389806  hitchhiker  0.000000219808 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1566  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  27.06 
 
 		 474 aa  158  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1106  glycoside hydrolase family protein  27.54 
 
 		 488 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0729101  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  27.71 
 
 		 647 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1833  O-glycosyl hydrolase  27.43 
 
 		 445 aa  146  6e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  27.62 
 
 		 603 aa  139  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1516  glycoside hydrolase family 30  25.78 
 
 		 481 aa  137  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  24.55 
 
 		 634 aa  137  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5017  glycoside hydrolase family 30  25.86 
 
 		 484 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000784671  normal  0.283576 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34530  O-glycosyl hydrolase  26.89 
 
 		 447 aa  133  5e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0928159  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  25.61 
 
 		 982 aa  117  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2134  Glucuronoarabinoxylan endo-1,4-beta-xylanase  24.39 
 
 		 413 aa  66.6  0.0000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.300272  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  21.96 
 
 		 532 aa  60.8  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  24.48 
 
 		 726 aa  57  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04558  xylanase  26.7 
 
 		 406 aa  56.2  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.992142  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  24.48 
 
 		 688 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  24.91 
 
 		 630 aa  47.8  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  21.7 
 
 		 982 aa  47  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  35.29 
 
 		 629 aa  45.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  33.33 
 
 		 681 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>