49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1566 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1566  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  100 
 
 		 474 aa  976    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6736  glycoside hydrolase family 30  55.61 
 
 		 485 aa  518  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.338177 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2261  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  56.28 
 
 		 514 aa  515  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103038  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2994  glucosylceramidase  50.43 
 
 		 481 aa  458  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389806  hitchhiker  0.000000219808 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5601  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  44.67 
 
 		 505 aa  394  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6250  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  45.35 
 
 		 627 aa  392  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4356  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  44.98 
 
 		 603 aa  390  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.641869  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2067  glycoside hydrolase family protein  42.02 
 
 		 480 aa  369  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0826948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  43.4 
 
 		 648 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3590  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  42.76 
 
 		 486 aa  361  1e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00155681  hitchhiker  0.000521994 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1106  glycoside hydrolase family protein  35.73 
 
 		 488 aa  335  9e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0729101  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  44.09 
 
 		 695 aa  335  2e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0296  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  42.76 
 
 		 484 aa  329  8e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3362  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  37.32 
 
 		 497 aa  322  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4153  glucosylceramidase  43.45 
 
 		 472 aa  320  3e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450582  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3714  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  35.03 
 
 		 666 aa  305  8.000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00391353 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0445  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  37.17 
 
 		 501 aa  277  4e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 634 aa  269  8e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5017  glycoside hydrolase family 30  34.49 
 
 		 484 aa  256  6e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000784671  normal  0.283576 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1516  glycoside hydrolase family 30  33.12 
 
 		 481 aa  245  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  37.61 
 
 		 603 aa  231  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  31.65 
 
 		 647 aa  225  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04190  glycoside hydrolase family 30  33.04 
 
 		 445 aa  207  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0097  Glucosylceramidase  34.55 
 
 		 446 aa  205  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1268  glucosylceramidase  31.65 
 
 		 475 aa  200  3.9999999999999996e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1287  glucosylceramidase  30.93 
 
 		 476 aa  198  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1563  glycoside hydrolase family protein  29.45 
 
 		 487 aa  191  4e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.361336  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0858  glycoside hydrolase family protein  30.88 
 
 		 445 aa  173  6.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3404  glycoside hydrolase family protein  29.11 
 
 		 441 aa  172  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.316905  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1562  glycoside hydrolase family protein  30.47 
 
 		 487 aa  172  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6735  glycoside hydrolase family 30  30.02 
 
 		 485 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.39769 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34530  O-glycosyl hydrolase  29.11 
 
 		 447 aa  161  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0928159  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4708  O-Glycosyl hydrolase family 30  27.06 
 
 		 447 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.319201  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  27.95 
 
 		 982 aa  151  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1833  O-glycosyl hydrolase  28.35 
 
 		 445 aa  149  1.0000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3714  glycosy hydrolase family protein  27.75 
 
 		 567 aa  127  5e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.171767  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  27.16 
 
 		 532 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54536  predicted protein  26.1 
 
 		 859 aa  100  7e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04558  xylanase  24.24 
 
 		 406 aa  88.2  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.992142  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2134  Glucuronoarabinoxylan endo-1,4-beta-xylanase  27.61 
 
 		 413 aa  87  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.300272  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  23.88 
 
 		 688 aa  82.4  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  23.88 
 
 		 726 aa  80.9  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  26.35 
 
 		 629 aa  64.3  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  24.83 
 
 		 630 aa  53.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  25.84 
 
 		 982 aa  52.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  24.52 
 
 		 1217 aa  51.2  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  24.81 
 
 		 681 aa  47.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1486  glycoside hydrolase family 30  29.19 
 
 		 544 aa  47  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4557  O-Glycosyl hydrolase-like protein  28.12 
 
 		 494 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00623956  normal  0.0160771 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>