47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1563 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1562  glycoside hydrolase family protein  63.77 
 
 		 487 aa  648    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1563  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 487 aa  1011    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.361336  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6735  glycoside hydrolase family 30  56.91 
 
 		 485 aa  591  1e-168  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.39769 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1287  glucosylceramidase  53.57 
 
 		 476 aa  522  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04190  glycoside hydrolase family 30  45.76 
 
 		 445 aa  443  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0097  Glucosylceramidase  44.79 
 
 		 446 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1268  glucosylceramidase  43.5 
 
 		 475 aa  400  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0858  glycoside hydrolase family protein  41.37 
 
 		 445 aa  357  2.9999999999999997e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3404  glycoside hydrolase family protein  39.23 
 
 		 441 aa  313  3.9999999999999997e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.316905  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4708  O-Glycosyl hydrolase family 30  33.71 
 
 		 447 aa  266  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.319201  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3714  glycosy hydrolase family protein  31.72 
 
 		 567 aa  236  9e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.171767  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0296  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  32.78 
 
 		 484 aa  231  2e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  32.24 
 
 		 648 aa  217  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6736  glycoside hydrolase family 30  30.88 
 
 		 485 aa  212  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.338177 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4153  glucosylceramidase  31.76 
 
 		 472 aa  206  6e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450582  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5601  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  30.12 
 
 		 505 aa  203  5e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6250  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  31.26 
 
 		 627 aa  199  9e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54536  predicted protein  27.4 
 
 		 859 aa  199  1.0000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3590  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  30.86 
 
 		 486 aa  197  5.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00155681  hitchhiker  0.000521994 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1106  glycoside hydrolase family protein  28.8 
 
 		 488 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0729101  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0445  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  28.57 
 
 		 501 aa  191  2.9999999999999997e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1566  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  29.73 
 
 		 474 aa  187  5e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2261  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  29.57 
 
 		 514 aa  186  8e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103038  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2067  glycoside hydrolase family protein  28.01 
 
 		 480 aa  180  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0826948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4356  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  29.36 
 
 		 603 aa  179  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.641869  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  29.49 
 
 		 647 aa  173  5e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3714  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  28.38 
 
 		 666 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00391353 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  32.95 
 
 		 603 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5017  glycoside hydrolase family 30  28.48 
 
 		 484 aa  164  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000784671  normal  0.283576 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3362  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  28.76 
 
 		 497 aa  162  9e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  27.39 
 
 		 982 aa  158  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2994  glucosylceramidase  30.09 
 
 		 481 aa  157  5.0000000000000005e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389806  hitchhiker  0.000000219808 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  29.65 
 
 		 695 aa  156  6e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  25.59 
 
 		 634 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1833  O-glycosyl hydrolase  28.82 
 
 		 445 aa  155  2e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34530  O-glycosyl hydrolase  27.23 
 
 		 447 aa  154  5e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0928159  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1516  glycoside hydrolase family 30  24.28 
 
 		 481 aa  139  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2134  Glucuronoarabinoxylan endo-1,4-beta-xylanase  23.36 
 
 		 413 aa  93.2  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.300272  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  21.02 
 
 		 726 aa  87  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  20.79 
 
 		 688 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04558  xylanase  23.76 
 
 		 406 aa  84.3  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.992142  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  28.84 
 
 		 532 aa  76.6  0.0000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  19.88 
 
 		 630 aa  56.6  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  21.38 
 
 		 629 aa  53.9  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  21.18 
 
 		 982 aa  53.5  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1486  glycoside hydrolase family 30  23.62 
 
 		 544 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4557  O-Glycosyl hydrolase-like protein  22.55 
 
 		 494 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00623956  normal  0.0160771 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>