49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6735 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6735  glycoside hydrolase family 30  100 
 
 		 485 aa  1010    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.39769 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1562  glycoside hydrolase family protein  63.76 
 
 		 487 aa  598  1e-170  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1563  glycoside hydrolase family protein  56.91 
 
 		 487 aa  591  1e-168  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.361336  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1287  glucosylceramidase  58.93 
 
 		 476 aa  590  1e-167  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0097  Glucosylceramidase  46.05 
 
 		 446 aa  424  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04190  glycoside hydrolase family 30  45.35 
 
 		 445 aa  421  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1268  glucosylceramidase  45.51 
 
 		 475 aa  402  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0858  glycoside hydrolase family protein  41.99 
 
 		 445 aa  357  2.9999999999999997e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3404  glycoside hydrolase family protein  41.12 
 
 		 441 aa  329  7e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.316905  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4708  O-Glycosyl hydrolase family 30  36.75 
 
 		 447 aa  286  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.319201  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0296  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  36.12 
 
 		 484 aa  242  1e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3714  glycosy hydrolase family protein  30.92 
 
 		 567 aa  229  6e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.171767  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3590  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  32.36 
 
 		 486 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00155681  hitchhiker  0.000521994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  35.1 
 
 		 648 aa  210  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4153  glucosylceramidase  34.34 
 
 		 472 aa  204  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450582  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6736  glycoside hydrolase family 30  31.45 
 
 		 485 aa  202  8e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.338177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5601  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  31.61 
 
 		 505 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2067  glycoside hydrolase family protein  31.36 
 
 		 480 aa  193  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0826948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54536  predicted protein  29.02 
 
 		 859 aa  192  1e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6250  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  31.36 
 
 		 627 aa  191  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4356  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  28.89 
 
 		 603 aa  189  8e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.641869  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0445  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  30.75 
 
 		 501 aa  188  2e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1106  glycoside hydrolase family protein  31.11 
 
 		 488 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0729101  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2261  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  31.24 
 
 		 514 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103038  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  34.78 
 
 		 603 aa  180  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3714  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  30.62 
 
 		 666 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00391353 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1833  O-glycosyl hydrolase  30.95 
 
 		 445 aa  170  4e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1566  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  30.02 
 
 		 474 aa  167  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  30.77 
 
 		 695 aa  166  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  28.15 
 
 		 647 aa  164  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3362  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  29.95 
 
 		 497 aa  158  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34530  O-glycosyl hydrolase  28.74 
 
 		 447 aa  156  9e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0928159  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2994  glucosylceramidase  31.11 
 
 		 481 aa  155  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389806  hitchhiker  0.000000219808 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  28.88 
 
 		 982 aa  150  4e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5017  glycoside hydrolase family 30  29.09 
 
 		 484 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000784671  normal  0.283576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  26.91 
 
 		 634 aa  144  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1516  glycoside hydrolase family 30  27.15 
 
 		 481 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2134  Glucuronoarabinoxylan endo-1,4-beta-xylanase  26.73 
 
 		 413 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.300272  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  24.25 
 
 		 726 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  24.02 
 
 		 688 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  24.06 
 
 		 532 aa  89  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04558  xylanase  23.84 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.992142  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  21.95 
 
 		 982 aa  62.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  24.68 
 
 		 630 aa  62.4  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  23.75 
 
 		 629 aa  60.5  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  24.32 
 
 		 1217 aa  55.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1486  glycoside hydrolase family 30  23.9 
 
 		 544 aa  54.3  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4557  O-Glycosyl hydrolase-like protein  20.96 
 
 		 494 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00623956  normal  0.0160771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  22.76 
 
 		 681 aa  43.5  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>