42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1833 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1833  O-glycosyl hydrolase  100 
 
 
445 aa  930    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34530  O-glycosyl hydrolase  57.08 
 
 
447 aa  559  1e-158  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0928159  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0097  Glucosylceramidase  32.45 
 
 
446 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1287  glucosylceramidase  31.04 
 
 
476 aa  182  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6735  glycoside hydrolase family 30  30.95 
 
 
485 aa  170  4e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.39769 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0296  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  30.6 
 
 
484 aa  165  2.0000000000000002e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0858  glycoside hydrolase family protein  31.28 
 
 
445 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4153  glucosylceramidase  28.94 
 
 
472 aa  164  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450582  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5601  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  29.25 
 
 
505 aa  160  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6736  glycoside hydrolase family 30  28.93 
 
 
485 aa  159  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.338177 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1268  glucosylceramidase  29.29 
 
 
475 aa  158  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3590  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  28.44 
 
 
486 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00155681  hitchhiker  0.000521994 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2067  glycoside hydrolase family protein  28.38 
 
 
480 aa  157  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0826948  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1562  glycoside hydrolase family protein  29.84 
 
 
487 aa  157  5.0000000000000005e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3714  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  29.47 
 
 
666 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00391353 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1563  glycoside hydrolase family protein  28.82 
 
 
487 aa  155  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.361336  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3404  glycoside hydrolase family protein  29.02 
 
 
441 aa  154  4e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.316905  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  30.2 
 
 
648 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1566  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  28.61 
 
 
474 aa  149  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2261  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  29.59 
 
 
514 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103038  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04190  glycoside hydrolase family 30  29.65 
 
 
445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4708  O-Glycosyl hydrolase family 30  27.43 
 
 
447 aa  146  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.319201  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  27.81 
 
 
634 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1106  glycoside hydrolase family protein  28.08 
 
 
488 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0729101  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5017  glycoside hydrolase family 30  29.37 
 
 
484 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000784671  normal  0.283576 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6250  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  27.12 
 
 
627 aa  139  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3362  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  27.58 
 
 
497 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183475  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  28.84 
 
 
603 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2994  glucosylceramidase  28.57 
 
 
481 aa  125  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389806  hitchhiker  0.000000219808 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  29.07 
 
 
695 aa  122  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4356  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  25.49 
 
 
603 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.641869  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0445  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  25.34 
 
 
501 aa  111  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  26.22 
 
 
982 aa  110  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  26.54 
 
 
647 aa  109  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3714  glycosy hydrolase family protein  27 
 
 
567 aa  106  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.171767  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1516  glycoside hydrolase family 30  24.55 
 
 
481 aa  97.1  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54536  predicted protein  23.01 
 
 
859 aa  86.3  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  29.44 
 
 
532 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2134  Glucuronoarabinoxylan endo-1,4-beta-xylanase  21.77 
 
 
413 aa  63.9  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.300272  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  22.35 
 
 
726 aa  57  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  22.58 
 
 
688 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04558  xylanase  24.82 
 
 
406 aa  54.3  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.992142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>