49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2261 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2261  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  100 
 
 		 514 aa  1052    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103038  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6736  glycoside hydrolase family 30  58.31 
 
 		 485 aa  534  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.338177 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1566  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  56.28 
 
 		 474 aa  515  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2994  glucosylceramidase  56.4 
 
 		 481 aa  487  1e-136  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389806  hitchhiker  0.000000219808 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5601  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  42.83 
 
 		 505 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4356  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  44.8 
 
 		 603 aa  396  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.641869  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6250  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  44.42 
 
 		 627 aa  369  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2067  glycoside hydrolase family protein  43.34 
 
 		 480 aa  363  3e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0826948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3590  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  43.54 
 
 		 486 aa  362  1e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00155681  hitchhiker  0.000521994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  42.19 
 
 		 648 aa  350  3e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  44.8 
 
 		 695 aa  345  1e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0296  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  42.01 
 
 		 484 aa  329  6e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4153  glucosylceramidase  43.17 
 
 		 472 aa  327  3e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450582  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1106  glycoside hydrolase family protein  39.76 
 
 		 488 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0729101  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3714  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  38.13 
 
 		 666 aa  309  6.999999999999999e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00391353 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3362  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  39.91 
 
 		 497 aa  307  3e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  35.06 
 
 		 634 aa  289  8e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0445  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  34.82 
 
 		 501 aa  263  6.999999999999999e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1516  glycoside hydrolase family 30  37.31 
 
 		 481 aa  246  6.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5017  glycoside hydrolase family 30  36.79 
 
 		 484 aa  238  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000784671  normal  0.283576 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1268  glucosylceramidase  34.62 
 
 		 475 aa  218  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  40 
 
 		 603 aa  213  7e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  32.06 
 
 		 647 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04190  glycoside hydrolase family 30  30.91 
 
 		 445 aa  195  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0097  Glucosylceramidase  32.36 
 
 		 446 aa  191  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1563  glycoside hydrolase family protein  29.86 
 
 		 487 aa  186  8e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.361336  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1287  glucosylceramidase  30.02 
 
 		 476 aa  184  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4708  O-Glycosyl hydrolase family 30  27.32 
 
 		 447 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.319201  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6735  glycoside hydrolase family 30  31.24 
 
 		 485 aa  181  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.39769 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  29.33 
 
 		 982 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1562  glycoside hydrolase family protein  31.79 
 
 		 487 aa  173  5.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3404  glycoside hydrolase family protein  28.76 
 
 		 441 aa  172  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.316905  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34530  O-glycosyl hydrolase  29.97 
 
 		 447 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0928159  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0858  glycoside hydrolase family protein  29.59 
 
 		 445 aa  160  4e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1833  O-glycosyl hydrolase  29.59 
 
 		 445 aa  149  1.0000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3714  glycosy hydrolase family protein  26.62 
 
 		 567 aa  124  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.171767  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  27.09 
 
 		 532 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54536  predicted protein  24.58 
 
 		 859 aa  105  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2134  Glucuronoarabinoxylan endo-1,4-beta-xylanase  26.62 
 
 		 413 aa  100  7e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.300272  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  25.69 
 
 		 726 aa  97.8  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  25.69 
 
 		 688 aa  97.1  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04558  xylanase  26.53 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.992142  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  25.54 
 
 		 629 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  23.21 
 
 		 1217 aa  63.5  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  24.32 
 
 		 630 aa  62  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4557  O-Glycosyl hydrolase-like protein  25.8 
 
 		 494 aa  53.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00623956  normal  0.0160771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  24.66 
 
 		 681 aa  50.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  22.74 
 
 		 982 aa  47.8  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1486  glycoside hydrolase family 30  28.64 
 
 		 544 aa  47.4  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.291924 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>