30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1486 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1486  glycoside hydrolase family 30  100 
 
 		 544 aa  1126    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4557  O-Glycosyl hydrolase-like protein  50.29 
 
 		 494 aa  526  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00623956  normal  0.0160771 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3872  hypothetical protein  43.74 
 
 		 538 aa  390  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.875392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2880  hypothetical protein  40.15 
 
 		 537 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4280  beta-glycosidase  39.29 
 
 		 522 aa  345  2e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  28.36 
 
 		 982 aa  136  9e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1600  hypothetical protein  25.12 
 
 		 519 aa  100  9e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2560  Ricin B lectin  24.43 
 
 		 656 aa  86.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.257771  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  23.68 
 
 		 532 aa  84  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  26.39 
 
 		 726 aa  80.1  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  26.34 
 
 		 688 aa  76.6  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04290  putative carbohydrate-binding protein with Ig-like domain, F5/8 type C domain and ricin-type beta-trefoil lectin domain  24.88 
 
 		 1410 aa  71.2  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  24.3 
 
 		 630 aa  62  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1730  Ig domain protein  21.73 
 
 		 1170 aa  60.1  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.07641 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6735  glycoside hydrolase family 30  23.9 
 
 		 485 aa  54.3  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.39769 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04190  glycoside hydrolase family 30  21.52 
 
 		 445 aa  51.6  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3404  glycoside hydrolase family protein  24.36 
 
 		 441 aa  50.8  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.316905  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04558  xylanase  23.23 
 
 		 406 aa  50.8  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.992142  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0858  glycoside hydrolase family protein  21.79 
 
 		 445 aa  50.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1563  glycoside hydrolase family protein  23.62 
 
 		 487 aa  48.5  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.361336  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2261  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  28.64 
 
 		 514 aa  47.4  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103038  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3590  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  35.71 
 
 		 486 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00155681  hitchhiker  0.000521994 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1566  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  29.19 
 
 		 474 aa  46.6  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1287  glucosylceramidase  26.32 
 
 		 476 aa  46.6  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1268  glucosylceramidase  22.65 
 
 		 475 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  23.02 
 
 		 1217 aa  45.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  23.14 
 
 		 629 aa  44.7  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34530  O-glycosyl hydrolase  23.46 
 
 		 447 aa  44.7  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0928159  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  23.26 
 
 		 648 aa  44.3  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  26.54 
 
 		 681 aa  43.5  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>