49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3590 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3590  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  100 
 
 		 486 aa  1020    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00155681  hitchhiker  0.000521994 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5601  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  51.09 
 
 		 505 aa  490  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1106  glycoside hydrolase family protein  46.02 
 
 		 488 aa  427  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0729101  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6250  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  46.17 
 
 		 627 aa  422  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2067  glycoside hydrolase family protein  43.61 
 
 		 480 aa  403  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0826948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6736  glycoside hydrolase family 30  45.05 
 
 		 485 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.338177 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4153  glucosylceramidase  45.95 
 
 		 472 aa  385  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450582  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  43.67 
 
 		 648 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2261  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  43.47 
 
 		 514 aa  364  1e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103038  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0296  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  40.52 
 
 		 484 aa  364  2e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1566  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  42.76 
 
 		 474 aa  361  1e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3714  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  39.68 
 
 		 666 aa  348  1e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00391353 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2994  glucosylceramidase  42.36 
 
 		 481 aa  332  1e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389806  hitchhiker  0.000000219808 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3362  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  37.39 
 
 		 497 aa  313  4.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0445  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  37.08 
 
 		 501 aa  290  3e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4356  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  36.63 
 
 		 603 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.641869  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  37.64 
 
 		 634 aa  285  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1516  glycoside hydrolase family 30  36.53 
 
 		 481 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  39.87 
 
 		 695 aa  263  4.999999999999999e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5017  glycoside hydrolase family 30  36.77 
 
 		 484 aa  256  5e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000784671  normal  0.283576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  41.14 
 
 		 603 aa  243  7.999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  33.81 
 
 		 647 aa  239  9e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04190  glycoside hydrolase family 30  33.55 
 
 		 445 aa  235  2.0000000000000002e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0097  Glucosylceramidase  33.84 
 
 		 446 aa  228  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1268  glucosylceramidase  33.92 
 
 		 475 aa  223  7e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6735  glycoside hydrolase family 30  32.36 
 
 		 485 aa  213  7e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.39769 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1287  glucosylceramidase  32.11 
 
 		 476 aa  213  7e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1563  glycoside hydrolase family protein  30.86 
 
 		 487 aa  196  5.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.361336  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0858  glycoside hydrolase family protein  31.15 
 
 		 445 aa  195  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3404  glycoside hydrolase family protein  30.71 
 
 		 441 aa  192  9e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.316905  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  30.3 
 
 		 982 aa  188  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4708  O-Glycosyl hydrolase family 30  29.93 
 
 		 447 aa  187  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.319201  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1562  glycoside hydrolase family protein  31.59 
 
 		 487 aa  177  4e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34530  O-glycosyl hydrolase  29.74 
 
 		 447 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0928159  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1833  O-glycosyl hydrolase  28.44 
 
 		 445 aa  157  4e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3714  glycosy hydrolase family protein  27.66 
 
 		 567 aa  157  5.0000000000000005e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.171767  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54536  predicted protein  31 
 
 		 859 aa  111  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  25.78 
 
 		 726 aa  107  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  25.78 
 
 		 688 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  25.12 
 
 		 532 aa  103  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2134  Glucuronoarabinoxylan endo-1,4-beta-xylanase  26.16 
 
 		 413 aa  86.3  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.300272  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04558  xylanase  22.46 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.992142  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  21.71 
 
 		 982 aa  62.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  24.41 
 
 		 629 aa  56.6  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  25.57 
 
 		 630 aa  52.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4557  O-Glycosyl hydrolase-like protein  22.71 
 
 		 494 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00623956  normal  0.0160771 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  23.7 
 
 		 1217 aa  48.1  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  30.34 
 
 		 681 aa  47.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1486  glycoside hydrolase family 30  35.71 
 
 		 544 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.291924 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>