179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1905 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  100 
 
 
695 aa  1411    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4356  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  49.37 
 
 
603 aa  520  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.641869  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6736  glycoside hydrolase family 30  46.95 
 
 
485 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.338177 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2261  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  45.02 
 
 
514 aa  389  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103038  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1566  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  44.55 
 
 
474 aa  383  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6250  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  43.91 
 
 
627 aa  370  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  38.35 
 
 
648 aa  370  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  37.06 
 
 
634 aa  346  7e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2994  glucosylceramidase  42.25 
 
 
481 aa  343  5e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389806  hitchhiker  0.000000219808 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5601  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  40.27 
 
 
505 aa  331  3e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2067  glycoside hydrolase family protein  37.98 
 
 
480 aa  312  1e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0826948  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3590  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  39.87 
 
 
486 aa  306  8.000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00155681  hitchhiker  0.000521994 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4153  glucosylceramidase  38.39 
 
 
472 aa  305  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450582  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0296  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  40.22 
 
 
484 aa  305  2.0000000000000002e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3714  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  38.69 
 
 
666 aa  302  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00391353 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1106  glycoside hydrolase family protein  36.73 
 
 
488 aa  301  3e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0729101  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3362  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  36.75 
 
 
497 aa  295  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183475  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  33.51 
 
 
647 aa  288  2.9999999999999996e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0445  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  35.81 
 
 
501 aa  269  1e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0097  Glucosylceramidase  31.39 
 
 
446 aa  241  4e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5017  glycoside hydrolase family 30  34.09 
 
 
484 aa  236  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000784671  normal  0.283576 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1516  glycoside hydrolase family 30  33.48 
 
 
481 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1268  glucosylceramidase  31.32 
 
 
475 aa  229  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04190  glycoside hydrolase family 30  31.78 
 
 
445 aa  221  5e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1287  glucosylceramidase  29.74 
 
 
476 aa  204  5e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6735  glycoside hydrolase family 30  32.02 
 
 
485 aa  201  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.39769 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1563  glycoside hydrolase family protein  30.75 
 
 
487 aa  199  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.361336  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  38.08 
 
 
603 aa  198  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4708  O-Glycosyl hydrolase family 30  30.56 
 
 
447 aa  193  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.319201  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0858  glycoside hydrolase family protein  31.19 
 
 
445 aa  186  9e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3404  glycoside hydrolase family protein  29.23 
 
 
441 aa  183  9.000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.316905  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  29.94 
 
 
982 aa  179  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1562  glycoside hydrolase family protein  30.6 
 
 
487 aa  174  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1833  O-glycosyl hydrolase  29.07 
 
 
445 aa  156  1e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34530  O-glycosyl hydrolase  28.67 
 
 
447 aa  146  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0928159  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3714  glycosy hydrolase family protein  30.63 
 
 
567 aa  125  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.171767  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  26.19 
 
 
726 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54536  predicted protein  23.76 
 
 
859 aa  115  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  38.89 
 
 
1139 aa  115  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  28.57 
 
 
688 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  43.07 
 
 
412 aa  106  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  38.51 
 
 
491 aa  104  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  26.6 
 
 
532 aa  103  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  39.72 
 
 
472 aa  100  7e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2134  Glucuronoarabinoxylan endo-1,4-beta-xylanase  25.88 
 
 
413 aa  99.8  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.300272  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.29 
 
 
474 aa  95.1  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  36.88 
 
 
566 aa  94.4  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04558  xylanase  25 
 
 
406 aa  94  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.992142  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  38.57 
 
 
563 aa  93.6  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  40.71 
 
 
495 aa  91.7  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  36.81 
 
 
503 aa  91.7  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.43 
 
 
507 aa  92  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  34.53 
 
 
1413 aa  90.5  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  37.84 
 
 
411 aa  90.5  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  35.71 
 
 
401 aa  86.7  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4332  Ricin B lectin  28.74 
 
 
615 aa  86.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.817761  normal  0.0720026 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  34.53 
 
 
691 aa  85.1  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.37 
 
 
466 aa  84  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  35.51 
 
 
537 aa  82.8  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.13 
 
 
520 aa  82  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  29.11 
 
 
943 aa  82  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  35.25 
 
 
571 aa  81.3  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  36.36 
 
 
430 aa  81.3  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  36.17 
 
 
582 aa  81.3  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  30.08 
 
 
1187 aa  81.3  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5674  Ricin B lectin  39.88 
 
 
425 aa  80.9  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.510311 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  34.51 
 
 
884 aa  79.7  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  31.9 
 
 
497 aa  79.7  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  35.29 
 
 
2073 aa  79  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  35.56 
 
 
507 aa  78.2  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  42.53 
 
 
569 aa  77  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  33.81 
 
 
503 aa  75.1  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  28.27 
 
 
672 aa  74.7  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  33.33 
 
 
507 aa  74.3  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  32.39 
 
 
957 aa  73.6  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  41.09 
 
 
498 aa  71.6  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  32 
 
 
436 aa  71.2  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  32.28 
 
 
494 aa  70.1  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  34.85 
 
 
476 aa  69.3  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  31.21 
 
 
510 aa  69.3  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  25.66 
 
 
963 aa  68.9  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  29.22 
 
 
737 aa  68.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  34.62 
 
 
490 aa  68.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  37.33 
 
 
493 aa  68.2  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  37.8 
 
 
468 aa  68.2  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1703  hypothetical protein  29.93 
 
 
392 aa  68.2  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.595343 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1461  Ricin B lectin  35.66 
 
 
560 aa  67.8  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.25 
 
 
507 aa  67.4  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  27.84 
 
 
1259 aa  67  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0859  Ricin B lectin  31.25 
 
 
483 aa  66.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  34.23 
 
 
801 aa  65.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  33.86 
 
 
492 aa  64.7  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0329  Pectate lyase  33.1 
 
 
445 aa  64.7  0.000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0745769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  33.33 
 
 
461 aa  64.7  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  24.64 
 
 
629 aa  64.3  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  34.84 
 
 
824 aa  63.9  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  30.94 
 
 
474 aa  63.9  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  31.62 
 
 
514 aa  63.9  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  34.88 
 
 
472 aa  63.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4959  Ricin B lectin  29.95 
 
 
576 aa  63.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.572354  normal  0.851755 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>