47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0445 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0445  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  100 
 
 		 501 aa  1050    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5601  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  34.07 
 
 		 505 aa  292  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3590  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  37.08 
 
 		 486 aa  289  6e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00155681  hitchhiker  0.000521994 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1566  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  34.9 
 
 		 474 aa  276  8e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6736  glycoside hydrolase family 30  36.31 
 
 		 485 aa  273  7e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.338177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4356  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  33.87 
 
 		 603 aa  268  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.641869  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6250  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  35.13 
 
 		 627 aa  268  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2994  glucosylceramidase  34.62 
 
 		 481 aa  264  3e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389806  hitchhiker  0.000000219808 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2261  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  34.47 
 
 		 514 aa  263  6e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103038  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  34.26 
 
 		 648 aa  251  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4153  glucosylceramidase  33.33 
 
 		 472 aa  246  6.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450582  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2067  glycoside hydrolase family protein  30.58 
 
 		 480 aa  233  6e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0826948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3714  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  33.56 
 
 		 666 aa  230  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00391353 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  35.05 
 
 		 695 aa  225  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1106  glycoside hydrolase family protein  32.49 
 
 		 488 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0729101  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3362  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  31.72 
 
 		 497 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0097  Glucosylceramidase  29.86 
 
 		 446 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0296  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  29.21 
 
 		 484 aa  211  2e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04190  glycoside hydrolase family 30  30.57 
 
 		 445 aa  212  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  31.04 
 
 		 647 aa  210  5e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3404  glycoside hydrolase family protein  31.69 
 
 		 441 aa  201  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.316905  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  31.19 
 
 		 634 aa  196  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1268  glucosylceramidase  28.94 
 
 		 475 aa  190  4e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1563  glycoside hydrolase family protein  27.95 
 
 		 487 aa  190  4e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.361336  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6735  glycoside hydrolase family 30  30.04 
 
 		 485 aa  188  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.39769 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5017  glycoside hydrolase family 30  29.01 
 
 		 484 aa  188  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000784671  normal  0.283576 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0858  glycoside hydrolase family protein  30.3 
 
 		 445 aa  186  7e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1287  glucosylceramidase  28.37 
 
 		 476 aa  177  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1516  glycoside hydrolase family 30  27.51 
 
 		 481 aa  172  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1562  glycoside hydrolase family protein  26.78 
 
 		 487 aa  167  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4708  O-Glycosyl hydrolase family 30  25.93 
 
 		 447 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.319201  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  31.76 
 
 		 603 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  25.05 
 
 		 982 aa  147  6e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34530  O-glycosyl hydrolase  28.24 
 
 		 447 aa  135  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0928159  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3714  glycosy hydrolase family protein  25.25 
 
 		 567 aa  133  6e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.171767  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1833  O-glycosyl hydrolase  26.09 
 
 		 445 aa  110  4.0000000000000004e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54536  predicted protein  25.61 
 
 		 859 aa  99  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2134  Glucuronoarabinoxylan endo-1,4-beta-xylanase  26.06 
 
 		 413 aa  75.5  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.300272  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  24.82 
 
 		 726 aa  74.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  24.82 
 
 		 688 aa  72.4  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  23.95 
 
 		 532 aa  70.9  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04558  xylanase  21.72 
 
 		 406 aa  68.6  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.992142  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  24.76 
 
 		 630 aa  57  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  21.74 
 
 		 1217 aa  56.6  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  20.88 
 
 		 982 aa  49.7  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  25.67 
 
 		 629 aa  48.9  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  23.81 
 
 		 681 aa  43.5  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>