47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5601 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5601  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  100 
 
 		 505 aa  1046    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3590  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  51.09 
 
 		 486 aa  490  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00155681  hitchhiker  0.000521994 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6250  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  52.17 
 
 		 627 aa  478  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1106  glycoside hydrolase family protein  47.23 
 
 		 488 aa  443  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0729101  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6736  glycoside hydrolase family 30  45.49 
 
 		 485 aa  431  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.338177 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2261  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  42.83 
 
 		 514 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103038  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2067  glycoside hydrolase family protein  43.6 
 
 		 480 aa  403  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0826948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1566  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  44.67 
 
 		 474 aa  394  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0296  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  43.86 
 
 		 484 aa  390  1e-107  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4153  glucosylceramidase  45.37 
 
 		 472 aa  382  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450582  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  43.56 
 
 		 648 aa  375  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2994  glucosylceramidase  43.17 
 
 		 481 aa  367  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389806  hitchhiker  0.000000219808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3714  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  43.68 
 
 		 666 aa  366  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00391353 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3362  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  41.1 
 
 		 497 aa  340  2.9999999999999998e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  37.35 
 
 		 634 aa  331  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4356  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  41.32 
 
 		 603 aa  323  5e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.641869  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1516  glycoside hydrolase family 30  37.86 
 
 		 481 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  40.27 
 
 		 695 aa  294  2e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0445  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  34.9 
 
 		 501 aa  285  1.0000000000000001e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5017  glycoside hydrolase family 30  34.25 
 
 		 484 aa  281  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000784671  normal  0.283576 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  33.84 
 
 		 647 aa  234  3e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1268  glucosylceramidase  33.93 
 
 		 475 aa  233  5e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0097  Glucosylceramidase  32.9 
 
 		 446 aa  233  8.000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04190  glycoside hydrolase family 30  33.89 
 
 		 445 aa  229  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  37.94 
 
 		 603 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1287  glucosylceramidase  32.48 
 
 		 476 aa  210  5e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1563  glycoside hydrolase family protein  30.12 
 
 		 487 aa  203  5e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.361336  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6735  glycoside hydrolase family 30  31.61 
 
 		 485 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.39769 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  29.96 
 
 		 982 aa  198  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3404  glycoside hydrolase family protein  31.29 
 
 		 441 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.316905  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0858  glycoside hydrolase family protein  30.24 
 
 		 445 aa  187  4e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1562  glycoside hydrolase family protein  30.74 
 
 		 487 aa  186  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4708  O-Glycosyl hydrolase family 30  28.89 
 
 		 447 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.319201  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1833  O-glycosyl hydrolase  29.25 
 
 		 445 aa  160  4e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34530  O-glycosyl hydrolase  27.8 
 
 		 447 aa  159  9e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0928159  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3714  glycosy hydrolase family protein  27.46 
 
 		 567 aa  155  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.171767  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  26.04 
 
 		 532 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54536  predicted protein  28.07 
 
 		 859 aa  108  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  25.23 
 
 		 688 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  24.59 
 
 		 726 aa  97.4  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2134  Glucuronoarabinoxylan endo-1,4-beta-xylanase  25.51 
 
 		 413 aa  88.2  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.300272  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  27.91 
 
 		 629 aa  73.6  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04558  xylanase  24.56 
 
 		 406 aa  73.2  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.992142  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  25.82 
 
 		 630 aa  63.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  25.6 
 
 		 1217 aa  57.8  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  24.49 
 
 		 681 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  21.14 
 
 		 982 aa  44.7  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>