50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1287 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1287  glucosylceramidase  100 
 
 		 476 aa  994    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6735  glycoside hydrolase family 30  58.93 
 
 		 485 aa  590  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.39769 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1563  glycoside hydrolase family protein  53.57 
 
 		 487 aa  522  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.361336  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1562  glycoside hydrolase family protein  54.39 
 
 		 487 aa  513  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1268  glucosylceramidase  50 
 
 		 475 aa  437  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0097  Glucosylceramidase  46.05 
 
 		 446 aa  431  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04190  glycoside hydrolase family 30  46.64 
 
 		 445 aa  428  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0858  glycoside hydrolase family protein  40.29 
 
 		 445 aa  355  1e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3404  glycoside hydrolase family protein  39.52 
 
 		 441 aa  343  5.999999999999999e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.316905  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4708  O-Glycosyl hydrolase family 30  35.86 
 
 		 447 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.319201  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3714  glycosy hydrolase family protein  30.12 
 
 		 567 aa  238  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.171767  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0296  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  32.76 
 
 		 484 aa  224  2e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  35.22 
 
 		 648 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3590  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  32.11 
 
 		 486 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00155681  hitchhiker  0.000521994 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4153  glucosylceramidase  35.75 
 
 		 472 aa  213  9e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450582  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5601  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  32.48 
 
 		 505 aa  210  5e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6736  glycoside hydrolase family 30  31.44 
 
 		 485 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.338177 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2067  glycoside hydrolase family protein  33.98 
 
 		 480 aa  208  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0826948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6250  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  31.6 
 
 		 627 aa  206  5e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1106  glycoside hydrolase family protein  33.92 
 
 		 488 aa  202  9e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0729101  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54536  predicted protein  31.01 
 
 		 859 aa  201  1.9999999999999998e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1566  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  30.93 
 
 		 474 aa  198  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3714  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  32.07 
 
 		 666 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00391353 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2261  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  30.02 
 
 		 514 aa  184  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103038  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1833  O-glycosyl hydrolase  31.04 
 
 		 445 aa  182  1e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  35.69 
 
 		 603 aa  179  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0445  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  28.37 
 
 		 501 aa  177  3e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5017  glycoside hydrolase family 30  29.54 
 
 		 484 aa  176  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000784671  normal  0.283576 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34530  O-glycosyl hydrolase  30.35 
 
 		 447 aa  176  9e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0928159  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2994  glucosylceramidase  30.62 
 
 		 481 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389806  hitchhiker  0.000000219808 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4356  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  27.52 
 
 		 603 aa  173  5.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.641869  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3362  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  30.7 
 
 		 497 aa  169  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  30.66 
 
 		 647 aa  168  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  29.7 
 
 		 634 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  29.3 
 
 		 695 aa  166  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  28.18 
 
 		 982 aa  156  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1516  glycoside hydrolase family 30  28.92 
 
 		 481 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  23.54 
 
 		 532 aa  100  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2134  Glucuronoarabinoxylan endo-1,4-beta-xylanase  25 
 
 		 413 aa  95.9  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.300272  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  23.51 
 
 		 726 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  23.51 
 
 		 688 aa  84.7  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04558  xylanase  27.04 
 
 		 406 aa  82.4  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.992142  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  23.37 
 
 		 982 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  24.44 
 
 		 1217 aa  67.4  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  24.92 
 
 		 630 aa  67.4  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  25.93 
 
 		 681 aa  64.3  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  23.77 
 
 		 629 aa  62.8  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4557  O-Glycosyl hydrolase-like protein  42.37 
 
 		 494 aa  53.5  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00623956  normal  0.0160771 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1486  glycoside hydrolase family 30  26.32 
 
 		 544 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1960  hypothetical protein  23.12 
 
 		 428 aa  45.8  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.148725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>