70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4356 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4356  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  100 
 
 		 603 aa  1233    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.641869  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6250  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  47.12 
 
 		 627 aa  498  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  48.91 
 
 		 695 aa  475  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6736  glycoside hydrolase family 30  44.96 
 
 		 485 aa  414  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.338177 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2261  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  44.8 
 
 		 514 aa  396  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103038  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1566  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  44.98 
 
 		 474 aa  390  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2994  glucosylceramidase  42.4 
 
 		 481 aa  344  2.9999999999999997e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389806  hitchhiker  0.000000219808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  41.96 
 
 		 648 aa  332  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5601  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  41.32 
 
 		 505 aa  323  6e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0296  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  38.77 
 
 		 484 aa  301  3e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2067  glycoside hydrolase family protein  38.12 
 
 		 480 aa  292  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0826948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3362  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  38.53 
 
 		 497 aa  288  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3714  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  36.51 
 
 		 666 aa  286  8e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00391353 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3590  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  37.23 
 
 		 486 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00155681  hitchhiker  0.000521994 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1106  glycoside hydrolase family protein  36.14 
 
 		 488 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0729101  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  35.35 
 
 		 634 aa  278  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4153  glucosylceramidase  36.11 
 
 		 472 aa  272  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450582  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0445  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  33.87 
 
 		 501 aa  266  1e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  32.9 
 
 		 647 aa  238  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1516  glycoside hydrolase family 30  35.73 
 
 		 481 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5017  glycoside hydrolase family 30  31.66 
 
 		 484 aa  211  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000784671  normal  0.283576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  36.72 
 
 		 603 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0097  Glucosylceramidase  29.64 
 
 		 446 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04190  glycoside hydrolase family 30  30.36 
 
 		 445 aa  194  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6735  glycoside hydrolase family 30  28.89 
 
 		 485 aa  189  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.39769 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  68.46 
 
 		 409 aa  184  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1563  glycoside hydrolase family protein  29.36 
 
 		 487 aa  179  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.361336  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1287  glucosylceramidase  27.52 
 
 		 476 aa  174  5e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1268  glucosylceramidase  29.31 
 
 		 475 aa  168  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4164  hypothetical protein  58.52 
 
 		 552 aa  166  8e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.124418  normal  0.0303167 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  28.01 
 
 		 982 aa  166  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4708  O-Glycosyl hydrolase family 30  27.53 
 
 		 447 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.319201  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  62.81 
 
 		 639 aa  160  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  58.59 
 
 		 1115 aa  157  7e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0858  glycoside hydrolase family protein  28.1 
 
 		 445 aa  154  5.9999999999999996e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3404  glycoside hydrolase family protein  27.27 
 
 		 441 aa  153  7e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.316905  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1562  glycoside hydrolase family protein  26.98 
 
 		 487 aa  153  8e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34530  O-glycosyl hydrolase  25.76 
 
 		 447 aa  122  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0928159  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  27.68 
 
 		 688 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  27.68 
 
 		 726 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1833  O-glycosyl hydrolase  25.49 
 
 		 445 aa  114  4.0000000000000004e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3714  glycosy hydrolase family protein  28.26 
 
 		 567 aa  114  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.171767  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  25.97 
 
 		 532 aa  106  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2134  Glucuronoarabinoxylan endo-1,4-beta-xylanase  28.38 
 
 		 413 aa  99.8  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.300272  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04558  xylanase  27.39 
 
 		 406 aa  98.6  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.992142  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54536  predicted protein  23.59 
 
 		 859 aa  94.4  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4507  hypothetical protein  42.31 
 
 		 1010 aa  90.5  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293914  normal  0.98839 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0282  metallophosphoesterase  33.33 
 
 		 459 aa  82.8  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4460  hypothetical protein  41.38 
 
 		 438 aa  80.5  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1518  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  39.39 
 
 		 734 aa  78.2  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000763318  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5219  hypothetical protein  34.68 
 
 		 1176 aa  78.2  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1999  protease-like protein  36.59 
 
 		 682 aa  77.8  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4972  Xylan 1,4-beta-xylosidase  38.26 
 
 		 632 aa  74.7  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122581  normal  0.3032 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4178  hypothetical protein  35.71 
 
 		 358 aa  74.3  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0714985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5221  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.13 
 
 		 1357 aa  74.3  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0332695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5220  hypothetical protein  37.07 
 
 		 723 aa  72.8  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.840911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7478  Xylan 1,4-beta-xylosidase  34.96 
 
 		 635 aa  67.4  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  26.28 
 
 		 629 aa  65.5  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  26.62 
 
 		 630 aa  65.1  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5218  lipolytic protein G-D-S-L family  29.92 
 
 		 542 aa  63.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0704  hypothetical protein  34.15 
 
 		 384 aa  62.4  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  24.92 
 
 		 1217 aa  62  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  20.89 
 
 		 982 aa  58.9  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6701  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.94 
 
 		 558 aa  55.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1696  hypothetical protein  33.6 
 
 		 182 aa  52  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000261124 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3286  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  50.4  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3051  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  50.4  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.123826  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3277  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4557  O-Glycosyl hydrolase-like protein  20.83 
 
 		 494 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00623956  normal  0.0160771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  27.01 
 
 		 803 aa  43.9  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>