45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_34530 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_34530  O-glycosyl hydrolase  100 
 
 		 447 aa  931    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0928159  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1833  O-glycosyl hydrolase  57.08 
 
 		 445 aa  559  1e-158  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0097  Glucosylceramidase  32.14 
 
 		 446 aa  192  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4153  glucosylceramidase  31.57 
 
 		 472 aa  181  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450582  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  30.72 
 
 		 648 aa  180  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1268  glucosylceramidase  30.16 
 
 		 475 aa  180  5.999999999999999e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04190  glycoside hydrolase family 30  30.09 
 
 		 445 aa  179  8e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1287  glucosylceramidase  30.35 
 
 		 476 aa  176  8e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2067  glycoside hydrolase family protein  31.47 
 
 		 480 aa  172  9e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0826948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0858  glycoside hydrolase family protein  30.61 
 
 		 445 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2261  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  29.97 
 
 		 514 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103038  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6736  glycoside hydrolase family 30  28.81 
 
 		 485 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.338177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3590  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  29.44 
 
 		 486 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00155681  hitchhiker  0.000521994 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6250  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  31.02 
 
 		 627 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1566  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  29.11 
 
 		 474 aa  162  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5601  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  27.8 
 
 		 505 aa  159  8e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6735  glycoside hydrolase family 30  28.74 
 
 		 485 aa  156  8e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.39769 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0296  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  27.34 
 
 		 484 aa  154  2e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  27.93 
 
 		 634 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1563  glycoside hydrolase family protein  27.23 
 
 		 487 aa  154  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.361336  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3404  glycoside hydrolase family protein  28.64 
 
 		 441 aa  153  5.9999999999999996e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.316905  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3714  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  29.06 
 
 		 666 aa  153  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00391353 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5017  glycoside hydrolase family 30  30.39 
 
 		 484 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000784671  normal  0.283576 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0445  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  28.24 
 
 		 501 aa  136  9e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1106  glycoside hydrolase family protein  27.91 
 
 		 488 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0729101  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4708  O-Glycosyl hydrolase family 30  26.89 
 
 		 447 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.319201  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2994  glucosylceramidase  27.87 
 
 		 481 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389806  hitchhiker  0.000000219808 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3362  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  27.4 
 
 		 497 aa  130  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1562  glycoside hydrolase family protein  25.47 
 
 		 487 aa  127  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  28.26 
 
 		 603 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4356  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  25.76 
 
 		 603 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.641869  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  27.5 
 
 		 982 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3714  glycosy hydrolase family protein  23.2 
 
 		 567 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.171767  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  26.29 
 
 		 647 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  28.4 
 
 		 695 aa  106  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54536  predicted protein  23.63 
 
 		 859 aa  101  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  24.46 
 
 		 532 aa  95.9  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1516  glycoside hydrolase family 30  26.41 
 
 		 481 aa  93.2  8e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2134  Glucuronoarabinoxylan endo-1,4-beta-xylanase  21.15 
 
 		 413 aa  66.6  0.0000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.300272  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  22.77 
 
 		 630 aa  54.7  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  21.44 
 
 		 688 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04558  xylanase  23.32 
 
 		 406 aa  51.6  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.992142  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  21.66 
 
 		 726 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1486  glycoside hydrolase family 30  23.46 
 
 		 544 aa  44.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  22.79 
 
 		 629 aa  44.3  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>