47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_04190 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_04190  glycoside hydrolase family 30  100 
 
 		 445 aa  922    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1268  glucosylceramidase  47.76 
 
 		 475 aa  474  1e-132  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0097  Glucosylceramidase  49.32 
 
 		 446 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1563  glycoside hydrolase family protein  45.76 
 
 		 487 aa  458  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.361336  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1287  glucosylceramidase  46.64 
 
 		 476 aa  444  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1562  glycoside hydrolase family protein  48.55 
 
 		 487 aa  442  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6735  glycoside hydrolase family 30  45.35 
 
 		 485 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.39769 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0858  glycoside hydrolase family protein  42.19 
 
 		 445 aa  403  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3404  glycoside hydrolase family protein  46.41 
 
 		 441 aa  387  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.316905  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4708  O-Glycosyl hydrolase family 30  39.13 
 
 		 447 aa  310  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.319201  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3714  glycosy hydrolase family protein  30.17 
 
 		 567 aa  266  8e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.171767  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0296  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  34.83 
 
 		 484 aa  251  2e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3590  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  33.55 
 
 		 486 aa  246  6.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00155681  hitchhiker  0.000521994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  34.15 
 
 		 648 aa  242  9e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5601  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  33.89 
 
 		 505 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6736  glycoside hydrolase family 30  35.36 
 
 		 485 aa  239  5e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.338177 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6250  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  33.18 
 
 		 627 aa  232  8.000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0445  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  31.51 
 
 		 501 aa  224  2e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54536  predicted protein  31.21 
 
 		 859 aa  224  2e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1106  glycoside hydrolase family protein  32.81 
 
 		 488 aa  224  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0729101  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4153  glucosylceramidase  32.59 
 
 		 472 aa  218  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450582  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1566  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  33.04 
 
 		 474 aa  218  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2067  glycoside hydrolase family protein  32.31 
 
 		 480 aa  217  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0826948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3714  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  33.12 
 
 		 666 aa  213  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00391353 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2261  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  31.59 
 
 		 514 aa  206  6e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103038  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4356  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  30.36 
 
 		 603 aa  204  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.641869  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3362  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  31.69 
 
 		 497 aa  200  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  31.4 
 
 		 695 aa  197  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2994  glucosylceramidase  31.98 
 
 		 481 aa  194  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389806  hitchhiker  0.000000219808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  33.14 
 
 		 603 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  32.46 
 
 		 982 aa  190  5.999999999999999e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34530  O-glycosyl hydrolase  30.09 
 
 		 447 aa  189  9e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0928159  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5017  glycoside hydrolase family 30  30.73 
 
 		 484 aa  178  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000784671  normal  0.283576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  29.83 
 
 		 634 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  29.93 
 
 		 647 aa  172  6.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1833  O-glycosyl hydrolase  29.93 
 
 		 445 aa  157  3e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1516  glycoside hydrolase family 30  28.08 
 
 		 481 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2134  Glucuronoarabinoxylan endo-1,4-beta-xylanase  22.76 
 
 		 413 aa  90.9  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.300272  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  23.51 
 
 		 532 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04558  xylanase  23.49 
 
 		 406 aa  77.8  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.992142  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  23.03 
 
 		 982 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  25.49 
 
 		 726 aa  57.4  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1486  glycoside hydrolase family 30  21.52 
 
 		 544 aa  57.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  21.02 
 
 		 681 aa  57.4  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  25 
 
 		 688 aa  54.3  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  20.18 
 
 		 630 aa  51.6  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  24.76 
 
 		 629 aa  51.6  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>