48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2067 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2067  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 480 aa  980    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0826948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1106  glycoside hydrolase family protein  54.28 
 
 		 488 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0729101  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4153  glucosylceramidase  46.52 
 
 		 472 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450582  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3590  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  43.61 
 
 		 486 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00155681  hitchhiker  0.000521994 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0296  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  43.68 
 
 		 484 aa  404  1e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5601  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  43.6 
 
 		 505 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  44.52 
 
 		 648 aa  400  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6250  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  46.5 
 
 		 627 aa  393  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6736  glycoside hydrolase family 30  40.86 
 
 		 485 aa  369  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.338177 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1566  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  41.27 
 
 		 474 aa  369  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2261  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  42.92 
 
 		 514 aa  366  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103038  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3714  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  41.05 
 
 		 666 aa  332  6e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00391353 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3362  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  40.39 
 
 		 497 aa  323  4e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  37.35 
 
 		 634 aa  323  6e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2994  glucosylceramidase  39.87 
 
 		 481 aa  319  6e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389806  hitchhiker  0.000000219808 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4356  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  36.38 
 
 		 603 aa  293  6e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.641869  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5017  glycoside hydrolase family 30  36.31 
 
 		 484 aa  286  8e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000784671  normal  0.283576 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1516  glycoside hydrolase family 30  39.69 
 
 		 481 aa  281  2e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  36.7 
 
 		 695 aa  269  7e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  37.92 
 
 		 647 aa  259  8e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  41.3 
 
 		 603 aa  246  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0445  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  31.25 
 
 		 501 aa  232  1e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1268  glucosylceramidase  34.74 
 
 		 475 aa  225  1e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0097  Glucosylceramidase  33.97 
 
 		 446 aa  219  7e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1287  glucosylceramidase  33.98 
 
 		 476 aa  208  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04190  glycoside hydrolase family 30  32.39 
 
 		 445 aa  205  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3404  glycoside hydrolase family protein  29.93 
 
 		 441 aa  194  4e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.316905  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6735  glycoside hydrolase family 30  31.36 
 
 		 485 aa  193  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.39769 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  31.9 
 
 		 982 aa  191  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4708  O-Glycosyl hydrolase family 30  31.06 
 
 		 447 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.319201  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1563  glycoside hydrolase family protein  27.79 
 
 		 487 aa  180  4.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.361336  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0858  glycoside hydrolase family protein  28.54 
 
 		 445 aa  177  4e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34530  O-glycosyl hydrolase  31.47 
 
 		 447 aa  172  7.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0928159  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1562  glycoside hydrolase family protein  30.22 
 
 		 487 aa  169  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1833  O-glycosyl hydrolase  28.38 
 
 		 445 aa  157  5.0000000000000005e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3714  glycosy hydrolase family protein  24.38 
 
 		 567 aa  124  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.171767  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54536  predicted protein  24.53 
 
 		 859 aa  103  6e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  27.53 
 
 		 688 aa  99.8  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  27.53 
 
 		 726 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2134  Glucuronoarabinoxylan endo-1,4-beta-xylanase  24.64 
 
 		 413 aa  98.6  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.300272  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  22.49 
 
 		 532 aa  97.1  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04558  xylanase  26.6 
 
 		 406 aa  96.3  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.992142  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  24.64 
 
 		 629 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  25.84 
 
 		 630 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  22.64 
 
 		 1217 aa  54.3  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  21.27 
 
 		 982 aa  53.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4557  O-Glycosyl hydrolase-like protein  24.2 
 
 		 494 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00623956  normal  0.0160771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  26.42 
 
 		 681 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>