188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7221 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  100 
 
 
634 aa  1302    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5017  glycoside hydrolase family 30  53.72 
 
 
484 aa  526  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000784671  normal  0.283576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  40.98 
 
 
648 aa  384  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6250  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  43.55 
 
 
627 aa  369  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4153  glucosylceramidase  42.13 
 
 
472 aa  331  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450582  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5601  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  37.35 
 
 
505 aa  331  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0296  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  40 
 
 
484 aa  324  3e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3714  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  42.24 
 
 
666 aa  323  4e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00391353 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2067  glycoside hydrolase family protein  38.33 
 
 
480 aa  323  7e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0826948  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  37.19 
 
 
695 aa  311  2.9999999999999997e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1106  glycoside hydrolase family protein  38.74 
 
 
488 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0729101  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6736  glycoside hydrolase family 30  38.6 
 
 
485 aa  296  6e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.338177 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2261  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  35.27 
 
 
514 aa  291  3e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103038  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3590  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  38.05 
 
 
486 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00155681  hitchhiker  0.000521994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4356  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  35.35 
 
 
603 aa  280  5e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.641869  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1566  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  33.77 
 
 
474 aa  271  2e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3362  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  36.4 
 
 
497 aa  270  7e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183475  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  33.76 
 
 
647 aa  266  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2994  glucosylceramidase  33.13 
 
 
481 aa  249  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389806  hitchhiker  0.000000219808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  41.59 
 
 
603 aa  246  8e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1516  glycoside hydrolase family 30  33.2 
 
 
481 aa  213  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0445  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  31.19 
 
 
501 aa  195  2e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  68.85 
 
 
1072 aa  172  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  27.14 
 
 
982 aa  169  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1287  glucosylceramidase  29.7 
 
 
476 aa  168  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04190  glycoside hydrolase family 30  29.16 
 
 
445 aa  167  5.9999999999999996e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  63.64 
 
 
516 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  61.83 
 
 
492 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1268  glucosylceramidase  26.62 
 
 
475 aa  158  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  60.71 
 
 
384 aa  157  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1563  glycoside hydrolase family protein  25.59 
 
 
487 aa  156  8e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.361336  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34530  O-glycosyl hydrolase  27.93 
 
 
447 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0928159  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0097  Glucosylceramidase  27.96 
 
 
446 aa  154  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3404  glycoside hydrolase family protein  26.36 
 
 
441 aa  153  8e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.316905  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  57.81 
 
 
732 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  60.32 
 
 
417 aa  147  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  58.54 
 
 
452 aa  146  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.33 
 
 
933 aa  144  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  43.96 
 
 
1207 aa  144  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  51.22 
 
 
426 aa  144  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6735  glycoside hydrolase family 30  26.91 
 
 
485 aa  143  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.39769 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1833  O-glycosyl hydrolase  27.81 
 
 
445 aa  142  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  55.56 
 
 
801 aa  140  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4708  O-Glycosyl hydrolase family 30  24.55 
 
 
447 aa  136  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.319201  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  55.65 
 
 
803 aa  134  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  49.63 
 
 
890 aa  130  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3714  glycosy hydrolase family protein  25.93 
 
 
567 aa  128  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.171767  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  51.3 
 
 
414 aa  127  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  51.15 
 
 
479 aa  127  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  47.02 
 
 
574 aa  126  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  48 
 
 
1128 aa  125  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  37.56 
 
 
558 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  51.72 
 
 
446 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  51.75 
 
 
489 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0858  glycoside hydrolase family protein  24.76 
 
 
445 aa  122  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  49.15 
 
 
373 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  49.57 
 
 
423 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  45.45 
 
 
488 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  44.8 
 
 
492 aa  115  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  47.5 
 
 
498 aa  114  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  44.7 
 
 
522 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  27.94 
 
 
532 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  47.83 
 
 
374 aa  110  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  41.38 
 
 
368 aa  110  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  45.83 
 
 
472 aa  110  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  45.83 
 
 
801 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  42.86 
 
 
490 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1562  glycoside hydrolase family protein  25.27 
 
 
487 aa  109  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  48.8 
 
 
627 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  42.31 
 
 
493 aa  108  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  44.63 
 
 
709 aa  105  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  44.78 
 
 
391 aa  106  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  42.5 
 
 
496 aa  104  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  45.83 
 
 
461 aa  104  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  43.86 
 
 
469 aa  104  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  43.86 
 
 
801 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  45.83 
 
 
451 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  34.31 
 
 
589 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  43.8 
 
 
497 aa  100  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  37.58 
 
 
548 aa  100  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  41.67 
 
 
568 aa  99.4  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  43.9 
 
 
468 aa  99.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  42.5 
 
 
380 aa  98.2  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  26.22 
 
 
726 aa  98.2  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.67 
 
 
815 aa  96.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  39.84 
 
 
567 aa  96.3  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  27.99 
 
 
688 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  40.34 
 
 
489 aa  94.4  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  42.5 
 
 
500 aa  94.4  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  40.32 
 
 
547 aa  93.2  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  39.55 
 
 
531 aa  88.2  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  40.65 
 
 
535 aa  84.7  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5166  Ricin B lectin  30.54 
 
 
642 aa  82.4  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400775  normal  0.0878066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6568  hypothetical protein  43.24 
 
 
165 aa  79.7  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  hitchhiker  0.00578077 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54536  predicted protein  26.76 
 
 
859 aa  76.6  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1280  YD repeat-containing protein  32.98 
 
 
2615 aa  73.6  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0638094 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0324  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  32.35 
 
 
580 aa  73.9  0.000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0179568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4280  Ricin B lectin  36.67 
 
 
494 aa  72.8  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.104165 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3537  Ricin B lectin  36.04 
 
 
358 aa  72.4  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0768059  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3632  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  45 
 
 
468 aa  71.2  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705031  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>