More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0110 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  58.52 
 
 		 1207 aa  1333    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  100 
 
 		 1128 aa  2262    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1956  glycoside hydrolase family protein  31.44 
 
 		 927 aa  314  4.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.289429  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0133  glycoside hydrolase family 31  35.09 
 
 		 798 aa  298  3e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1877  glycoside hydrolase family protein  30.27 
 
 		 797 aa  295  3e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0196  alpha-glucosidase  32.14 
 
 		 829 aa  295  3e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.193664  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1316  alpha-glucosidase  31.34 
 
 		 845 aa  284  9e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.168857  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15100  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  36.66 
 
 		 816 aa  282  2e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4758  glycoside hydrolase family 31  36.04 
 
 		 761 aa  278  3e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0765  alpha-glucosidase  32.6 
 
 		 739 aa  278  5e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1288  glycosyl hydrolase, family 31  32.13 
 
 		 915 aa  268  4e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10935  hypothetical protein  31.99 
 
 		 813 aa  246  9.999999999999999e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  26.34 
 
 		 770 aa  191  7e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00115  alpha-xylosidase  29 
 
 		 969 aa  186  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.732111  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  29.79 
 
 		 765 aa  184  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  30.28 
 
 		 749 aa  178  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  28.75 
 
 		 803 aa  177  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  29.77 
 
 		 760 aa  176  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  25.65 
 
 		 801 aa  175  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1292  glycoside hydrolase family protein  27.1 
 
 		 944 aa  172  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0279218  normal  0.0671724 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0898  Alpha-glucosidase  26.74 
 
 		 783 aa  171  7e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532752  normal  0.374184 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  28.99 
 
 		 765 aa  170  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  26.16 
 
 		 828 aa  169  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4927  glycoside hydrolase family 31  29.09 
 
 		 777 aa  168  5e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.99 
 
 		 1072 aa  161  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  27.63 
 
 		 771 aa  160  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  28.22 
 
 		 779 aa  160  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  28.99 
 
 		 804 aa  159  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  27.27 
 
 		 779 aa  159  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2500  Holliday junction DNA helicase RuvB  23.83 
 
 		 973 aa  159  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.297419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  27.53 
 
 		 775 aa  157  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  29.14 
 
 		 779 aa  157  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03670  glycoside hydrolase family 31  22.95 
 
 		 1024 aa  155  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.510709  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6865  glycoside hydrolase family 31  27.78 
 
 		 1016 aa  154  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1004  glycoside hydrolase family 31  23.79 
 
 		 791 aa  152  5e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.667554  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  24.56 
 
 		 799 aa  152  5e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0983  glycosy hydrolase family protein  24.88 
 
 		 836 aa  150  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  23.11 
 
 		 836 aa  150  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  29.05 
 
 		 760 aa  150  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  27.87 
 
 		 785 aa  149  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09480  glycoside hydrolase family 31  24.44 
 
 		 840 aa  150  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000232453  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2455  alpha-xylosidase YicI  24.85 
 
 		 770 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623882  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10130  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  29.46 
 
 		 766 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0724432  normal  0.362992 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  27.06 
 
 		 779 aa  148  5e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1246  alpha-xylosidase YicI  27.05 
 
 		 774 aa  146  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.758952  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  23.47 
 
 		 752 aa  146  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  38.35 
 
 		 627 aa  145  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  25.56 
 
 		 764 aa  142  3e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  26.44 
 
 		 681 aa  142  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  25 
 
 		 797 aa  142  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5548  Alpha-glucosidase  24.28 
 
 		 951 aa  142  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.426673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1870  Alpha-glucosidase  27.83 
 
 		 798 aa  141  4.999999999999999e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.785633  normal  0.641991 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1752  alpha-xylosidase YicI  27.96 
 
 		 775 aa  141  4.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  24.02 
 
 		 746 aa  141  6e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  25.35 
 
 		 764 aa  141  7.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  26.5 
 
 		 839 aa  139  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03950  glycosyl hydrolase, family 31  25.46 
 
 		 821 aa  137  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4015  Alpha-glucosidase  27.27 
 
 		 845 aa  136  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1244  alpha-xylosidase YicI  26.21 
 
 		 712 aa  136  3e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.669712  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  25.9 
 
 		 757 aa  135  3.9999999999999996e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1081  glucosidase protein  27.05 
 
 		 803 aa  135  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00242883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0413  alpha-xylosidase YicI  28.54 
 
 		 763 aa  135  5e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  30.23 
 
 		 794 aa  134  9e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07505  Alpha-xylosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AW25]  23.93 
 
 		 780 aa  134  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0387  Alpha-glucosidase  28.37 
 
 		 806 aa  133  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.44264 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1763  alpha-xylosidase YicI  26.84 
 
 		 760 aa  133  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.983763  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_429  predicted protein  23.84 
 
 		 815 aa  133  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0318632  normal  0.136701 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  27.51 
 
 		 777 aa  131  6e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  28.57 
 
 		 776 aa  131  6e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  24.31 
 
 		 772 aa  131  8.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1794  Alpha-glucosidase  28.14 
 
 		 687 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.761488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2626  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  26.53 
 
 		 788 aa  129  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3217  Alpha-glucosidase  27.2 
 
 		 821 aa  129  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  24.61 
 
 		 775 aa  129  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32530  Alpha-glucosidase II; Alpha-xylosidase  24.78 
 
 		 823 aa  128  5e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.725216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2352  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  26.26 
 
 		 788 aa  128  7e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  22.99 
 
 		 821 aa  127  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5029  alpha-xylosidase YicI  24.52 
 
 		 772 aa  126  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0071  alpha-xylosidase YicI  24.22 
 
 		 772 aa  126  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.290357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1643  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  26.1 
 
 		 791 aa  125  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0705  glycoside hydrolase family protein  27.47 
 
 		 778 aa  125  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.149362  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2608  glycoside hydrolase family 31  27.27 
 
 		 695 aa  125  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805177  normal  0.759517 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3127  glycoside hydrolase family protein  25.68 
 
 		 813 aa  125  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03514  predicted alpha-glucosidase  24.3 
 
 		 772 aa  124  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.485788  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0049  glycoside hydrolase family 31  24.3 
 
 		 772 aa  124  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0019  glycosy hydrolase family protein  25.16 
 
 		 679 aa  124  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0278482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0055  alpha-xylosidase YicI  24.3 
 
 		 772 aa  124  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.353636 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03466  hypothetical protein  24.3 
 
 		 772 aa  124  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.498351  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1312  glucan 1,3-alpha-glucosidase  26.28 
 
 		 787 aa  124  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3867  alpha-xylosidase YicI  24.3 
 
 		 772 aa  124  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4208  glycoside hydrolase family protein  26.21 
 
 		 806 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0739255  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4158  glycoside hydrolase family protein  26.21 
 
 		 806 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00315991 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2044  Alpha-glucosidase  27.61 
 
 		 685 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1612  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  25.51 
 
 		 788 aa  123  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3358  Alpha-glucosidase  26.21 
 
 		 806 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4160  alpha-xylosidase YicI  24.3 
 
 		 772 aa  123  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1872  Alpha-glucosidase  25.81 
 
 		 806 aa  122  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00900175  normal  0.24419 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3999  alpha-xylosidase YicI  24.08 
 
 		 772 aa  122  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0218  alpha-xylosidase YicI  23.66 
 
 		 780 aa  122  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0948  glycoside hydrolase family 31  25.41 
 
 		 803 aa  122  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0874171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>