124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4280 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4280  Ricin B lectin  100 
 
 		 494 aa  998    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.104165 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  42 
 
 		 489 aa  323  4e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  38.12 
 
 		 469 aa  307  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  36.57 
 
 		 491 aa  291  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  35.96 
 
 		 497 aa  260  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3804  Ricin B lectin  36.82 
 
 		 497 aa  234  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404288  normal  0.817018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  49.61 
 
 		 558 aa  118  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  37.14 
 
 		 801 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  43.24 
 
 		 368 aa  107  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  47.86 
 
 		 801 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  47.69 
 
 		 500 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  40.15 
 
 		 490 aa  103  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  44.62 
 
 		 547 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  45.6 
 
 		 374 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  47.11 
 
 		 468 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  42.03 
 
 		 493 aa  99  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  44.88 
 
 		 535 aa  97.8  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  41.94 
 
 		 472 aa  96.7  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  43.9 
 
 		 489 aa  95.1  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  37.9 
 
 		 497 aa  94.4  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  42.74 
 
 		 498 aa  94.4  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  42.74 
 
 		 461 aa  93.6  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  40.8 
 
 		 451 aa  93.2  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  43.33 
 
 		 492 aa  91.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  41.13 
 
 		 568 aa  89  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  39.23 
 
 		 589 aa  89.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  39.52 
 
 		 380 aa  84  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  41.18 
 
 		 603 aa  83.2  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  37.12 
 
 		 548 aa  81.3  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  40.83 
 
 		 634 aa  81.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  38.97 
 
 		 567 aa  80.5  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  38.58 
 
 		 516 aa  77.4  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  35.83 
 
 		 488 aa  75.5  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  42.5 
 
 		 574 aa  75.1  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  34.44 
 
 		 482 aa  73.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.78 
 
 		 531 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  35 
 
 		 522 aa  71.6  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  34.27 
 
 		 492 aa  71.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  34.43 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  32.79 
 
 		 391 aa  68.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  36.07 
 
 		 426 aa  69.3  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.71 
 
 		 933 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  38.64 
 
 		 479 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5166  Ricin B lectin  35.71 
 
 		 642 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400775  normal  0.0878066 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  33.63 
 
 		 709 aa  67.8  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 496 aa  67.8  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  36.89 
 
 		 597 aa  67  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  37.31 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.59 
 
 		 1072 aa  67  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  34.56 
 
 		 801 aa  66.6  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  33.86 
 
 		 803 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  34.55 
 
 		 436 aa  65.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  39.85 
 
 		 824 aa  64.7  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  29.03 
 
 		 890 aa  64.7  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  33.76 
 
 		 1016 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  27.46 
 
 		 1567 aa  62  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  35.43 
 
 		 465 aa  62.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  30.3 
 
 		 672 aa  61.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  29.63 
 
 		 427 aa  60.8  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  36.45 
 
 		 627 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0324  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.36 
 
 		 580 aa  58.9  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0179568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  36.59 
 
 		 452 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  31.09 
 
 		 1128 aa  58.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  33.61 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.21 
 
 		 756 aa  58.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6745  hypothetical protein  29.37 
 
 		 653 aa  57.4  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419034  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  30.92 
 
 		 794 aa  56.6  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  35.48 
 
 		 732 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  31.09 
 
 		 1207 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6063  Ricin B lectin  28.8 
 
 		 524 aa  54.3  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  30.15 
 
 		 806 aa  53.5  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  30.15 
 
 		 806 aa  53.5  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  30.15 
 
 		 806 aa  53.5  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  30.15 
 
 		 806 aa  53.5  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  40.26 
 
 		 446 aa  53.5  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  30.15 
 
 		 806 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  28.68 
 
 		 982 aa  52.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  30.15 
 
 		 806 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  30.15 
 
 		 806 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  33.06 
 
 		 417 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  32.48 
 
 		 384 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3775  Ricin B lectin  30.6 
 
 		 275 aa  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776108 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6568  hypothetical protein  32.94 
 
 		 165 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  hitchhiker  0.00578077 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  30.15 
 
 		 806 aa  51.6  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  26.47 
 
 		 863 aa  50.1  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  28.68 
 
 		 476 aa  49.7  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49706  predicted protein  28.89 
 
 		 1222 aa  49.7  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3537  Ricin B lectin  29.37 
 
 		 358 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0768059  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  33.87 
 
 		 494 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  30.5 
 
 		 487 aa  48.5  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1280  YD repeat-containing protein  29.69 
 
 		 2615 aa  47.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0638094 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1212  hypothetical protein  28.68 
 
 		 178 aa  48.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359922  normal  0.337815 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  30.16 
 
 		 2073 aa  47.8  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  31.21 
 
 		 644 aa  47.4  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4926  Ricin B lectin  27.61 
 
 		 748 aa  47.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164927  normal  0.377281 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1368  galactose oxidase-related protein  23.84 
 
 		 858 aa  47  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0445018  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1597  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  23.84 
 
 		 858 aa  47  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3632  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  37.04 
 
 		 468 aa  47  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1758  lectin repeat-containing protein  23.84 
 
 		 807 aa  47  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02510  hypothetical protein  32.29 
 
 		 591 aa  47  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>