105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0324 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0324  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  100 
 
 		 580 aa  1160    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0179568 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  56.06 
 
 		 531 aa  612  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6989  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  40.66 
 
 		 396 aa  239  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.632525  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4760  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  39.78 
 
 		 393 aa  231  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.68587  normal  0.425556 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26040  hypothetical protein  32.24 
 
 		 396 aa  139  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.378992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  53.97 
 
 		 522 aa  131  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5224  Carbohydrate binding family 6  29.78 
 
 		 566 aa  130  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  52.38 
 
 		 488 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  54.03 
 
 		 496 aa  125  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  25 
 
 		 884 aa  122  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2627  hypothetical protein  32.12 
 
 		 396 aa  114  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2956  hypothetical protein  26.75 
 
 		 411 aa  109  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.629615  normal  0.5936 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4739  hypothetical protein  29.9 
 
 		 791 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448945 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  42.99 
 
 		 709 aa  92  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  40.71 
 
 		 391 aa  91.3  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.71 
 
 		 933 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  25.39 
 
 		 726 aa  84.7  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  32.62 
 
 		 469 aa  84.3  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  36.59 
 
 		 426 aa  83.6  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  37.69 
 
 		 497 aa  82  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  37.25 
 
 		 479 aa  81.6  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  33.87 
 
 		 801 aa  81.3  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  33.33 
 
 		 492 aa  80.5  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  31.54 
 
 		 489 aa  79.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  35.58 
 
 		 803 aa  75.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  33.98 
 
 		 603 aa  75.1  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  30.65 
 
 		 492 aa  74.7  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  32.06 
 
 		 468 aa  72.8  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  32.35 
 
 		 634 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  32.31 
 
 		 548 aa  71.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  35.51 
 
 		 516 aa  72  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  39.81 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  31.71 
 
 		 801 aa  71.2  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  34.31 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  34.34 
 
 		 446 aa  70.5  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  43.24 
 
 		 414 aa  70.1  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  35 
 
 		 1207 aa  69.7  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  33.33 
 
 		 890 aa  70.1  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  33.33 
 
 		 380 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  29.63 
 
 		 368 aa  68.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.86 
 
 		 1072 aa  68.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  28.68 
 
 		 498 aa  68.9  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  33.67 
 
 		 452 aa  68.2  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  32.08 
 
 		 567 aa  67.4  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  29.2 
 
 		 461 aa  67.8  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  32.31 
 
 		 472 aa  67.4  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  35.24 
 
 		 373 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  35.92 
 
 		 627 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  33.01 
 
 		 558 aa  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  29.1 
 
 		 801 aa  66.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  35.58 
 
 		 417 aa  66.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  44.74 
 
 		 794 aa  64.7  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  29.1 
 
 		 493 aa  63.9  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  33.59 
 
 		 490 aa  63.9  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  33.67 
 
 		 384 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  30.83 
 
 		 500 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  32.97 
 
 		 547 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 732 aa  62  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  30.48 
 
 		 489 aa  61.6  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  27.68 
 
 		 451 aa  61.6  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4828  Ricin B lectin  32.2 
 
 		 576 aa  61.2  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  32.52 
 
 		 1128 aa  60.5  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  31.41 
 
 		 476 aa  59.7  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  35.45 
 
 		 568 aa  60.1  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3775  Ricin B lectin  37.11 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3537  Ricin B lectin  34.34 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0768059  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  26.62 
 
 		 589 aa  58.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  31.78 
 
 		 535 aa  58.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  44 
 
 		 487 aa  57.8  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5166  Ricin B lectin  28.91 
 
 		 642 aa  57.4  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400775  normal  0.0878066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.79 
 
 		 815 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6568  hypothetical protein  32.11 
 
 		 165 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  hitchhiker  0.00578077 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  31.53 
 
 		 672 aa  55.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  35.14 
 
 		 436 aa  55.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  29.77 
 
 		 597 aa  55.1  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  28.57 
 
 		 644 aa  53.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  41.33 
 
 		 474 aa  53.5  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4412  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  34.78 
 
 		 578 aa  52.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  28.07 
 
 		 1567 aa  52.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2054  Ricin B lectin  33.93 
 
 		 459 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4887  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  36.17 
 
 		 581 aa  52  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.825597 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  27.27 
 
 		 648 aa  51.6  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  31.03 
 
 		 482 aa  51.2  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.57 
 
 		 507 aa  50.8  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  31.48 
 
 		 618 aa  50.4  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  30.7 
 
 		 1139 aa  49.7  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  27.68 
 
 		 497 aa  48.5  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  35.9 
 
 		 494 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4280  Ricin B lectin  30.36 
 
 		 494 aa  48.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.104165 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  29.2 
 
 		 695 aa  47.8  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3632  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  36 
 
 		 468 aa  47  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  29.25 
 
 		 507 aa  46.6  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.79 
 
 		 756 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  27.36 
 
 		 507 aa  47  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  31.87 
 
 		 569 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1395  galactose oxidase  26.57 
 
 		 1100 aa  45.4  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.610012  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.45 
 
 		 520 aa  45.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3165  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 2031 aa  44.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144153 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  29.31 
 
 		 691 aa  45.1  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01820  conserved hypothetical protein  28.18 
 
 		 571 aa  44.7  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>