99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4412 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4412  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  100 
 
 		 578 aa  1174    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4887  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  84.36 
 
 		 581 aa  993    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.825597 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  47.3 
 
 		 674 aa  449  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  58.39 
 
 		 987 aa  306  7e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  59.66 
 
 		 962 aa  287  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  62.03 
 
 		 1158 aa  273  6e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  43.81 
 
 		 850 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  50.8 
 
 		 588 aa  241  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  59 
 
 		 815 aa  229  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  45.92 
 
 		 752 aa  226  8e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  44.79 
 
 		 1581 aa  189  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  44.09 
 
 		 1441 aa  187  4e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  68.55 
 
 		 1007 aa  171  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.32 
 
 		 1564 aa  171  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  64.89 
 
 		 755 aa  167  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  43.08 
 
 		 4013 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.15 
 
 		 915 aa  160  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1480  coagulation factor 5/8 type domain protein  57.59 
 
 		 722 aa  157  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  53.8 
 
 		 433 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  66.67 
 
 		 940 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.32 
 
 		 1362 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  69.17 
 
 		 639 aa  137  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  51.94 
 
 		 637 aa  137  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  37.72 
 
 		 1028 aa  137  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  39.54 
 
 		 578 aa  135  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3723  hypothetical protein  61.65 
 
 		 449 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  31.37 
 
 		 1471 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  58.13 
 
 		 999 aa  134  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  50.6 
 
 		 571 aa  134  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.83 
 
 		 756 aa  130  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  54.84 
 
 		 819 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6675  coagulation factor 5/8 type domain protein  49.18 
 
 		 929 aa  117  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  52.38 
 
 		 1321 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  49.22 
 
 		 953 aa  114  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2893  Alkaline phosphatase  60.95 
 
 		 452 aa  113  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.21156  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  40 
 
 		 801 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  46.46 
 
 		 392 aa  109  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  49.61 
 
 		 1070 aa  107  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1444  extracellular solute-binding protein  33.09 
 
 		 1184 aa  107  8e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.913527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0379  protein of unknown function DUF291  38.51 
 
 		 732 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.58 
 
 		 729 aa  105  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  57.41 
 
 		 1338 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8724  Protein related to penicillin acylase-like protein  47.14 
 
 		 1059 aa  97.8  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  42.11 
 
 		 971 aa  96.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4824  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  45.86 
 
 		 1117 aa  96.7  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.90345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2861  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.8 
 
 		 984 aa  95.1  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00229986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3212  peptidase S45 penicillin amidase  46.61 
 
 		 1103 aa  94.4  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0203581  normal  0.139028 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4786  protein of unknown function DUF1111  42.52 
 
 		 879 aa  92.8  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  46.03 
 
 		 1332 aa  92  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0821  coagulation factor 5/8 type-like protein  40.94 
 
 		 558 aa  91.7  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000172205  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5195  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  51.35 
 
 		 480 aa  90.5  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.68 
 
 		 1448 aa  89.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  43.09 
 
 		 1059 aa  90.1  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5087  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  50.45 
 
 		 487 aa  89.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.800108 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3281  coagulation factor 5/8 type-like  50.45 
 
 		 487 aa  89.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0569  putative secreted protein  51.85 
 
 		 470 aa  89  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3544  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  47.62 
 
 		 471 aa  89.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4855  coagulation factor 5/8 type domain protein  50 
 
 		 472 aa  87.4  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3778  coagulation factor 5/8 type domain protein  50 
 
 		 472 aa  87.4  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0933074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4979  coagulation factor 5/8 type domain protein  46.4 
 
 		 1060 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00350881  normal  0.0761827 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  28.35 
 
 		 884 aa  85.5  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1525  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  46.23 
 
 		 695 aa  81.6  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.299502  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5024  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  49.07 
 
 		 470 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2796  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.14 
 
 		 1139 aa  80.9  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.151007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4499  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  48.15 
 
 		 470 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03685  signal peptide protein  49.11 
 
 		 475 aa  79.3  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal  0.498425 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3709  hypothetical protein  31.21 
 
 		 818 aa  72.8  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.156868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  25 
 
 		 726 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.23 
 
 		 820 aa  68.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  35.25 
 
 		 722 aa  65.9  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26040  hypothetical protein  40 
 
 		 396 aa  66.2  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.378992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1775  S-layer domain-containing protein  34.44 
 
 		 2117 aa  65.1  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.83614  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4760  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  26.26 
 
 		 393 aa  65.1  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.68587  normal  0.425556 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5224  Carbohydrate binding family 6  26.42 
 
 		 566 aa  63.9  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.19 
 
 		 478 aa  62  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1702  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.81 
 
 		 1038 aa  61.2  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00354  putative RHS-related transmembrane protein  30.95 
 
 		 1368 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.48 
 
 		 531 aa  58.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0034  hypothetical protein  27.35 
 
 		 768 aa  57.4  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0812  hypothetical protein  36.54 
 
 		 1200 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6989  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.81 
 
 		 396 aa  55.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.632525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1190  glycoside hydrolase family protein  35 
 
 		 807 aa  53.9  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.112997  normal  0.725074 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3972  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.77 
 
 		 929 aa  53.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.443016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1083  glycoside hydrolase family protein  35 
 
 		 807 aa  53.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148049 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0324  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.78 
 
 		 580 aa  52.4  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0179568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7141  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.3 
 
 		 538 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174227  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4863  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  37.72 
 
 		 112 aa  53.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483102  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4739  hypothetical protein  30.3 
 
 		 791 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448945 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  28.48 
 
 		 912 aa  50.8  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  0.0000146968 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.59 
 
 		 1212 aa  50.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  34.38 
 
 		 644 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.73 
 
 		 933 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0197  endo-beta-N-acetylglucosaminidase D  29.29 
 
 		 927 aa  48.5  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0373  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.09 
 
 		 795 aa  47.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634884  normal  0.96557 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0553  discoidin domain-containing protein  31.1 
 
 		 1061 aa  47.4  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326441  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4999  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase  32.39 
 
 		 834 aa  45.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.517089  normal  0.335211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.86 
 
 		 1109 aa  44.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  29.46 
 
 		 986 aa  43.9  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3845  hypothetical protein  24.81 
 
 		 557 aa  43.5  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>