60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3845 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3845  hypothetical protein  100 
 
 		 557 aa  1125    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  27.95 
 
 		 578 aa  99.4  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49133  predicted protein  47.06 
 
 		 590 aa  95.1  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50523  predicted protein  43.14 
 
 		 366 aa  87  8e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1818  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  36.23 
 
 		 477 aa  85.5  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000535261  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_40280  predicted protein  42.99 
 
 		 329 aa  81.3  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  29.53 
 
 		 873 aa  78.6  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3714  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  36.04 
 
 		 666 aa  78.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00391353 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_50586  predicted protein  43.69 
 
 		 362 aa  78.2  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.616621  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  23.76 
 
 		 752 aa  77  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  39.69 
 
 		 673 aa  74.7  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0859  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  27.03 
 
 		 2095 aa  73.9  0.000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.44 
 
 		 674 aa  73.6  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  27.04 
 
 		 850 aa  72.4  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  24.71 
 
 		 1158 aa  69.7  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0850  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  31.16 
 
 		 2095 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.871673  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.78 
 
 		 815 aa  67.8  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0034  hypothetical protein  26.32 
 
 		 768 aa  65.1  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  34.96 
 
 		 1070 aa  65.1  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38076  predicted protein  42.5 
 
 		 446 aa  64.3  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  26.64 
 
 		 1471 aa  63.9  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  25.89 
 
 		 801 aa  62.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  29.18 
 
 		 1581 aa  62.4  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.42 
 
 		 962 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  24.33 
 
 		 1441 aa  61.2  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  26.51 
 
 		 4013 aa  60.8  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1052  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.8 
 
 		 1362 aa  60.5  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.5 
 
 		 756 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.58 
 
 		 953 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0478  GTP-binding protein TypA  28.47 
 
 		 1028 aa  56.2  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  31.06 
 
 		 433 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3508  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  30.56 
 
 		 764 aa  54.7  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0541197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6675  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.39 
 
 		 929 aa  53.5  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4788  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.43 
 
 		 1564 aa  52.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6558  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.23 
 
 		 687 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00192951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7911  hypothetical protein  33.33 
 
 		 392 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.47 
 
 		 915 aa  51.2  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8724  Protein related to penicillin acylase-like protein  33.04 
 
 		 1059 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0825  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.62 
 
 		 478 aa  51.2  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.752393  normal  0.358271 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0553  discoidin domain-containing protein  29.51 
 
 		 1061 aa  50.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326441  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3212  peptidase S45 penicillin amidase  30.09 
 
 		 1103 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0203581  normal  0.139028 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7366  phospholipase C, phosphocholine-specific  30.34 
 
 		 805 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  25.62 
 
 		 588 aa  48.9  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4887  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  29.93 
 
 		 581 aa  48.5  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.825597 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0846  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.65 
 
 		 704 aa  47.4  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1525  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  30 
 
 		 695 aa  47  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.299502  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.05 
 
 		 1448 aa  47  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  30.91 
 
 		 571 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  29.93 
 
 		 1059 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  30 
 
 		 999 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.25 
 
 		 755 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4979  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.57 
 
 		 1060 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00350881  normal  0.0761827 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3709  hypothetical protein  25.25 
 
 		 818 aa  45.8  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.156868 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  25.71 
 
 		 637 aa  45.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  23.1 
 
 		 987 aa  45.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1775  S-layer domain-containing protein  26.32 
 
 		 2117 aa  45.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.83614  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3723  hypothetical protein  29.63 
 
 		 449 aa  44.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.788097  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.67 
 
 		 1264 aa  44.3  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0285  endo-beta-N-acetylglucosaminidase  28.04 
 
 		 1135 aa  43.9  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4412  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  24.81 
 
 		 578 aa  43.5  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.835766 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>