74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0859 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0850  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  96.28 
 
 		 2095 aa  4103    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.871673  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0859  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  100 
 
 		 2095 aa  4256    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3125  Alpha-N-acetylglucosaminidase  36.05 
 
 		 728 aa  431  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.759885  normal  0.381547 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3785  Alpha-N-acetylglucosaminidase  35.55 
 
 		 735 aa  423  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3401  Alpha-N-acetylglucosaminidase  32.67 
 
 		 749 aa  393  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00825517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3402  Alpha-N-acetylglucosaminidase  33 
 
 		 734 aa  385  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0013857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3686  Alpha-N-acetylglucosaminidase  30.74 
 
 		 734 aa  371  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0400659  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1220  Alpha-N-acetylglucosaminidase  32.97 
 
 		 852 aa  362  4e-98  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.257398 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5043  Alpha-N-acetylglucosaminidase  33.04 
 
 		 696 aa  352  4e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.424507 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0060  Alpha-N-acetylglucosaminidase  28.57 
 
 		 848 aa  264  1e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.741522  normal  0.0337012 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05050  Alpha-N-acetylglucosaminidase (NAGLU)  26.33 
 
 		 768 aa  263  3e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.958928  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3128  Alpha-N-acetylglucosaminidase  26.63 
 
 		 723 aa  245  7e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0404413  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0303  Alpha-N-acetylglucosaminidase  26.96 
 
 		 751 aa  236  4.0000000000000004e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  56.14 
 
 		 1471 aa  190  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1442  putative hyaluronidase  75.27 
 
 		 1001 aa  150  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.980629  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1248  fibronectin type III domain-containing protein  74.19 
 
 		 205 aa  150  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1472  putative alpha-N-acetylgalactosaminidase  34.21 
 
 		 1588 aa  147  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0687  fibronectin type III domain-containing protein  74.73 
 
 		 159 aa  145  7e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1301  glycosyl hydrolase family 31 protein  61.9 
 
 		 1965 aa  140  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.449133  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0685  fibronectin type III domain-containing protein  72.62 
 
 		 1686 aa  131  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0532  putative exo-alpha-sialidase  36.44 
 
 		 1173 aa  117  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0815  glycosy hydrolase family protein  38.03 
 
 		 1127 aa  107  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1885  S-layer domain protein  40.91 
 
 		 591 aa  97.8  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.726885  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7366  phospholipase C, phosphocholine-specific  36.43 
 
 		 805 aa  83.2  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  36.29 
 
 		 1264 aa  81.3  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  32.39 
 
 		 1289 aa  77.4  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3845  hypothetical protein  27.03 
 
 		 557 aa  73.9  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4992  hypothetical protein  30.6 
 
 		 597 aa  69.3  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0723152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1008  glycoside hydrolase family 31  32.54 
 
 		 1311 aa  67.4  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.590426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0392  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.12 
 
 		 709 aa  67.4  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  36.63 
 
 		 850 aa  65.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0195  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  28.09 
 
 		 1329 aa  63.2  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6558  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.71 
 
 		 687 aa  62  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00192951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  25.97 
 
 		 1441 aa  60.8  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2028  Alpha-L-fucosidase  24.58 
 
 		 704 aa  57.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  27.78 
 
 		 644 aa  57.4  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  32.59 
 
 		 850 aa  57  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.78 
 
 		 1158 aa  56.6  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1415  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.45 
 
 		 698 aa  55.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  24.56 
 
 		 752 aa  54.7  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1686  Beta-galactosidase  32.11 
 
 		 780 aa  53.9  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00233252  normal  0.321684 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  30.67 
 
 		 1164 aa  54.3  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0803  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.81 
 
 		 712 aa  53.9  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.969227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  26.85 
 
 		 1581 aa  53.9  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0184  hyaluronidase  25.76 
 
 		 1627 aa  53.5  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  31.33 
 
 		 598 aa  53.5  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1073  discoidin domain-containing protein  26.55 
 
 		 2142 aa  53.1  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.742063  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.33 
 
 		 809 aa  50.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  26.92 
 
 		 464 aa  50.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  22.38 
 
 		 674 aa  50.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.14 
 
 		 1781 aa  50.8  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.88 
 
 		 1448 aa  50.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1258  Subtilisin-like serine protease  30.61 
 
 		 1937 aa  50.4  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.596545  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0113  alpha-glucosidase  28.04 
 
 		 1019 aa  50.1  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.5746e-16 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6675  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.93 
 
 		 929 aa  49.7  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0373  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.81 
 
 		 795 aa  49.3  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634884  normal  0.96557 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  25.64 
 
 		 465 aa  49.3  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0285  endo-beta-N-acetylglucosaminidase  32.91 
 
 		 1135 aa  48.9  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  32.76 
 
 		 637 aa  48.9  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1751  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  23.48 
 
 		 1088 aa  48.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.865218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3894  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.93 
 
 		 688 aa  47.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0846  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.34 
 
 		 704 aa  47.8  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.72 
 
 		 933 aa  47  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  35.48 
 
 		 722 aa  47  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0826  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.78 
 
 		 159 aa  47  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0155823  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4811  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.26 
 
 		 971 aa  46.6  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000406891  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1817  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.64 
 
 		 1787 aa  46.6  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.29404 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3390  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.47 
 
 		 1246 aa  46.6  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.032281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4824  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  25.93 
 
 		 1117 aa  46.2  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.90345 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1411  sugar-binding domain protein  27.75 
 
 		 2126 aa  46.2  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.183423  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0610  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.31 
 
 		 159 aa  46.2  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.02 
 
 		 962 aa  45.8  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.5 
 
 		 1109 aa  45.4  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0034  hypothetical protein  31.34 
 
 		 768 aa  45.4  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>