22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0184 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0184  hyaluronidase  100 
 
 
1627 aa  3311    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1487  putative hyaluronoglucosaminidase  35.42 
 
 
1172 aa  504  1e-141  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0052  Hyalurononglucosaminidase  27.52 
 
 
953 aa  214  1e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.110511  normal  0.10576 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0875  putative hyaluronoglucosaminidase  23.32 
 
 
1296 aa  200  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.316601  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1442  putative hyaluronidase  27.88 
 
 
1001 aa  181  8e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.980629  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2451  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.27 
 
 
581 aa  155  5.9999999999999996e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0235141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5708  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.36 
 
 
664 aa  141  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0472  hyalurononglucosaminidase  25.44 
 
 
561 aa  139  5e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.779925  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03654  hypothetical protein  25.14 
 
 
661 aa  137  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0148  Hyaluronidase  24.95 
 
 
431 aa  128  9e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1842  hyaluronoglucosaminidase domain-containing protein  41.61 
 
 
248 aa  101  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0116  Hyaluronidase  27.21 
 
 
474 aa  98.6  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3474  hyaluronidase  24.09 
 
 
355 aa  65.1  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1258  Subtilisin-like serine protease  26.32 
 
 
1937 aa  64.7  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.596545  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  57.14 
 
 
1479 aa  62.4  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1649  hyaluronidase  24.19 
 
 
355 aa  55.5  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0839085  normal  0.600926 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0859  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  25.76 
 
 
2095 aa  53.5  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0850  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  26.3 
 
 
2095 aa  52.8  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.871673  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  47.17 
 
 
932 aa  51.2  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.18 
 
 
1264 aa  48.9  0.0009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1411  sugar-binding domain protein  26.32 
 
 
2126 aa  46.2  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.183423  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3390  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.87 
 
 
1246 aa  45.8  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.032281  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>