69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0850 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0850  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  100 
 
 
2095 aa  4258    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.871673  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0859  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  96.28 
 
 
2095 aa  4103    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3125  Alpha-N-acetylglucosaminidase  36.04 
 
 
728 aa  431  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.759885  normal  0.381547 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3785  Alpha-N-acetylglucosaminidase  35.55 
 
 
735 aa  424  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3401  Alpha-N-acetylglucosaminidase  32.67 
 
 
749 aa  394  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00825517  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3402  Alpha-N-acetylglucosaminidase  33.14 
 
 
734 aa  390  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0013857  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3686  Alpha-N-acetylglucosaminidase  30.74 
 
 
734 aa  369  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0400659  normal  0.332912 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1220  Alpha-N-acetylglucosaminidase  32.62 
 
 
852 aa  358  3.9999999999999996e-97  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.257398 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5043  Alpha-N-acetylglucosaminidase  32.72 
 
 
696 aa  352  4e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.424507 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0060  Alpha-N-acetylglucosaminidase  28.79 
 
 
848 aa  268  1e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.741522  normal  0.0337012 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05050  Alpha-N-acetylglucosaminidase (NAGLU)  26.42 
 
 
768 aa  263  4e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.958928  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3128  Alpha-N-acetylglucosaminidase  26.97 
 
 
723 aa  246  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0404413  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0303  Alpha-N-acetylglucosaminidase  27.21 
 
 
751 aa  242  6.999999999999999e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  63.12 
 
 
1471 aa  189  7e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1472  putative alpha-N-acetylgalactosaminidase  43.8 
 
 
1588 aa  158  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1442  putative hyaluronidase  75.27 
 
 
1001 aa  152  6e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.980629  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1248  fibronectin type III domain-containing protein  74.19 
 
 
205 aa  152  9e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0687  fibronectin type III domain-containing protein  74.73 
 
 
159 aa  147  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1301  glycosyl hydrolase family 31 protein  61.9 
 
 
1965 aa  142  7.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.449133  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0685  fibronectin type III domain-containing protein  72.62 
 
 
1686 aa  132  6e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0532  putative exo-alpha-sialidase  56.99 
 
 
1173 aa  115  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0815  glycosy hydrolase family protein  37.32 
 
 
1127 aa  105  7e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1885  S-layer domain protein  40.29 
 
 
591 aa  98.6  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.726885  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7366  phospholipase C, phosphocholine-specific  36.43 
 
 
805 aa  81.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  34.68 
 
 
1264 aa  76.6  0.000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  32.56 
 
 
1289 aa  74.3  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3845  hypothetical protein  31.16 
 
 
557 aa  69.3  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4992  hypothetical protein  30.6 
 
 
597 aa  68.6  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0723152  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1008  glycoside hydrolase family 31  29.94 
 
 
1311 aa  63.9  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.590426  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  36.63 
 
 
850 aa  62.8  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0392  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.91 
 
 
709 aa  61.6  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0195  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  31.3 
 
 
1329 aa  60.1  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  25.77 
 
 
1441 aa  59.7  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6558  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.88 
 
 
687 aa  58.9  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00192951  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  29.37 
 
 
644 aa  58.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0475  Beta-glucosidase-related glycosidases-like  27.78 
 
 
1581 aa  58.2  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.811095  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  30.57 
 
 
850 aa  57  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.78 
 
 
1158 aa  56.6  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  23.78 
 
 
752 aa  55.5  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2028  Alpha-L-fucosidase  30 
 
 
704 aa  55.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  29.89 
 
 
1164 aa  55.1  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1686  Beta-galactosidase  32.41 
 
 
780 aa  53.9  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00233252  normal  0.321684 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0803  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.81 
 
 
712 aa  53.9  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.969227  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0184  hyaluronidase  26.3 
 
 
1627 aa  52.8  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  30.12 
 
 
598 aa  52  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  34.48 
 
 
637 aa  51.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1073  discoidin domain-containing protein  25.66 
 
 
2142 aa  51.6  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.742063  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1415  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.04 
 
 
698 aa  51.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  25 
 
 
464 aa  50.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0102  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.08 
 
 
1781 aa  50.4  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.432951 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1258  Subtilisin-like serine protease  31.29 
 
 
1937 aa  50.8  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.596545  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.33 
 
 
809 aa  49.7  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1411  sugar-binding domain protein  29.61 
 
 
2126 aa  49.7  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.183423  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0373  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.32 
 
 
795 aa  49.3  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634884  normal  0.96557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  22.02 
 
 
674 aa  49.3  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  27.4 
 
 
465 aa  48.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0285  endo-beta-N-acetylglucosaminidase  31.65 
 
 
1135 aa  47.8  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6675  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.23 
 
 
929 aa  47.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.75 
 
 
1109 aa  47.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0846  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.85 
 
 
704 aa  47  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0980  purple acid phosphatase/fibronectin domain protein  28.8 
 
 
819 aa  47  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0113  alpha-glucosidase  27.1 
 
 
1019 aa  47  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  6.5746e-16 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1751  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  22.81 
 
 
1088 aa  46.6  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.865218  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.02 
 
 
962 aa  46.6  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0869  purple acid phosphatase/fibronectin domain protein  29.61 
 
 
819 aa  46.6  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4824  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  25.93 
 
 
1117 aa  46.2  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.90345 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0034  hypothetical protein  30 
 
 
768 aa  46.6  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3390  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.71 
 
 
1246 aa  46.2  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.032281  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  23.44 
 
 
1448 aa  46.2  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>