17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1411 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1411  sugar-binding domain protein  100 
 
 		 2126 aa  4201    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.183423  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0545  GA module  38.22 
 
 		 2029 aa  157  2e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000025562 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0846  subtilisin-like serine protease  36.91 
 
 		 1618 aa  109  5e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1524  hypothetical protein  25.64 
 
 		 10624 aa  101  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1495  hypothetical protein  25.64 
 
 		 10624 aa  101  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2053  serine protease  31.7 
 
 		 1570 aa  97.4  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.322612  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0931  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  33.01 
 
 		 2309 aa  96.7  4e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1011  cell wall associated fibronectin-binding protein  28.89 
 
 		 10203 aa  73.6  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1258  Subtilisin-like serine protease  32.19 
 
 		 1937 aa  62.8  0.00000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.596545  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3525  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  29.37 
 
 		 1672 aa  54.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0739  YSIRK Gram-positive signal peptide  52 
 
 		 2035 aa  50.8  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0489  cell wall/surface repeat protein  30.56 
 
 		 1452 aa  50.1  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0529115  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0850  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  29.61 
 
 		 2095 aa  49.7  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.871673  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0593  lipoprotein (VmcD)  35.14 
 
 		 309 aa  46.6  0.005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4523  TPR repeat-containing protein  22.12 
 
 		 1119 aa  46.6  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0184  hyaluronidase  26.32 
 
 		 1627 aa  46.2  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0859  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  27.75 
 
 		 2095 aa  46.2  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>