26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1524 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1011  cell wall associated fibronectin-binding protein  41.74 
 
 
10203 aa  2439    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1524  hypothetical protein  100 
 
 
10624 aa  21180    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1495  hypothetical protein  100 
 
 
10624 aa  21180    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1846  cell wall anchor domain-containing protein  28.45 
 
 
2186 aa  139  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1811  cell wall anchor domain-containing protein  28.45 
 
 
2186 aa  139  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0931  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  33.85 
 
 
2309 aa  138  6e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1316  cell wall surface anchor family protein  25.54 
 
 
3692 aa  110  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2192  cell wall anchor domain-containing protein  26.97 
 
 
2481 aa  107  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2230  cell wall anchor domain-containing protein  26.97 
 
 
2481 aa  107  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0545  GA module  26.13 
 
 
2029 aa  99.8  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000025562 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1411  sugar-binding domain protein  29.23 
 
 
2126 aa  99  5e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.183423  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5675  hypothetical protein  22.52 
 
 
1107 aa  53.5  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00234961  normal  0.548719 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4691  hypothetical protein  22.52 
 
 
1107 aa  53.5  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00421616  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4401  hypothetical protein  22.55 
 
 
1107 aa  52.8  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.199255  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4630  hypothetical protein  22 
 
 
1107 aa  52.4  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.250026  normal  0.0442574 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0345  hypothetical protein  23.02 
 
 
1103 aa  52.4  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.742298  unclonable  0.00000473028 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3851  hypothetical protein  22.3 
 
 
1107 aa  52.4  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332968 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3831  MscS Mechanosensitive ion channel  22.3 
 
 
1107 aa  52  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.915765  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03991  hypothetical protein  22.3 
 
 
1107 aa  52  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.391275  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4716  hypothetical protein  22.3 
 
 
1107 aa  52  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00612141  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04029  predicted mechanosensitive channel  22.3 
 
 
1107 aa  52  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.475668  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0599  cell wall anchor domain-containing protein  31.79 
 
 
1337 aa  50.8  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0585  cell wall anchor domain-containing protein  31.79 
 
 
1337 aa  50.8  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0846  subtilisin-like serine protease  27.23 
 
 
1618 aa  49.7  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0654  RecA-superfamily ATPase implicated in signal transduction-like protein  24.15 
 
 
593 aa  49.7  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0894  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  27.69 
 
 
716 aa  48.1  0.008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>