More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0345 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_04029  predicted mechanosensitive channel  87.8 
 
 
1107 aa  1973    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.475668  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3831  MscS Mechanosensitive ion channel  87.8 
 
 
1107 aa  1973    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.915765  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0711  hypothetical protein  70.48 
 
 
1113 aa  1475    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.871081  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5675  hypothetical protein  87.71 
 
 
1107 aa  1971    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00234961  normal  0.548719 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4630  hypothetical protein  87.71 
 
 
1107 aa  1975    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.250026  normal  0.0442574 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4744  hypothetical protein  86.73 
 
 
1108 aa  1930    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4625  hypothetical protein  86.73 
 
 
1108 aa  1930    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.288253  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4691  hypothetical protein  87.62 
 
 
1107 aa  1969    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00421616  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3664  hypothetical protein  70.66 
 
 
1113 aa  1479    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.907056  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3934  hypothetical protein  68.77 
 
 
1107 aa  1507    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3756  hypothetical protein  69.67 
 
 
1107 aa  1508    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0473  hypothetical protein  66.37 
 
 
1104 aa  1439    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4401  hypothetical protein  87.9 
 
 
1107 aa  1976    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.199255  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3851  hypothetical protein  87.71 
 
 
1107 aa  1972    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332968 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0384  hypothetical protein  66.67 
 
 
1107 aa  1457    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.207125  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03991  hypothetical protein  87.8 
 
 
1107 aa  1973    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.391275  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4765  hypothetical protein  86.73 
 
 
1108 aa  1930    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.514219  normal  0.17769 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4716  hypothetical protein  87.8 
 
 
1107 aa  1973    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00612141  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3811  hypothetical protein  70.66 
 
 
1113 aa  1479    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.408276  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4708  hypothetical protein  86.73 
 
 
1108 aa  1930    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.749013  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0345  hypothetical protein  100 
 
 
1103 aa  2229    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.742298  unclonable  0.00000473028 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0421  hypothetical protein  70.42 
 
 
1115 aa  1560    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.693078  hitchhiker  0.0000017841 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4616  hypothetical protein  86.73 
 
 
1108 aa  1930    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.115019  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3036  transporter, putative  37.19 
 
 
1080 aa  570  1e-161  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0415629  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4182  MscS mechanosensitive ion channel  35.27 
 
 
1070 aa  550  1e-155  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588  transporter, putative  36.13 
 
 
1067 aa  533  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0586  MscS mechanosensitive ion channel  36.22 
 
 
1067 aa  530  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0875624 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0786  MscS mechanosensitive ion channel  35.61 
 
 
1066 aa  528  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.213544  hitchhiker  0.000495101 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0587  MscS mechanosensitive ion channel  35.72 
 
 
1067 aa  528  1e-148  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0226105 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3443  MscS mechanosensitive ion channel  35.82 
 
 
1067 aa  528  1e-148  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3904  MscS mechanosensitive ion channel  35.08 
 
 
1072 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3778  MscS mechanosensitive ion channel  35.08 
 
 
1072 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0555  MscS mechanosensitive ion channel  35.77 
 
 
1060 aa  521  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0475901  normal  0.179203 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3721  MscS Mechanosensitive ion channel  35.08 
 
 
1072 aa  521  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0547  MscS mechanosensitive ion channel  34.98 
 
 
1067 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3321  MscS mechanosensitive ion channel  33.36 
 
 
1078 aa  522  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.660513  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3291  MscS mechanosensitive ion channel  36.33 
 
 
1068 aa  503  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.563171  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3551  MscS mechanosensitive ion channel  34.37 
 
 
1062 aa  487  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2151  MscS mechanosensitive ion channel  28.2 
 
 
1158 aa  382  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  30.32 
 
 
1111 aa  378  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3204  potassium efflux protein KefA  29.15 
 
 
1120 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2883  potassium efflux protein KefA  29.15 
 
 
1120 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0991479 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3064  potassium efflux protein KefA  29.15 
 
 
1120 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3045  potassium efflux protein KefA  29.34 
 
 
1133 aa  371  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0445  potassium efflux protein KefA  28.56 
 
 
1117 aa  366  1e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.953711  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3390  MscS mechanosensitive ion channel  31.7 
 
 
861 aa  365  3e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5117  potassium efflux protein KefA  28.91 
 
 
1102 aa  360  7e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666166  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0397  potassium efflux protein KefA  28.8 
 
 
1120 aa  356  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0555  potassium efflux protein KefA  28.8 
 
 
1118 aa  354  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364262  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1013  potassium efflux protein KefA  30.09 
 
 
1128 aa  354  5.9999999999999994e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0508  potassium efflux protein KefA  28.8 
 
 
1120 aa  354  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000540502  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00416  fused conserved protein  28.73 
 
 
1120 aa  353  7e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  28.73 
 
 
1120 aa  353  7e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3151  potassium efflux protein KefA  28.73 
 
 
1120 aa  353  7e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.800258  normal  0.703774 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00421  hypothetical protein  28.73 
 
 
1120 aa  353  7e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0541  potassium efflux protein KefA  28.73 
 
 
1120 aa  353  7e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5067  potassium efflux protein KefA  28.83 
 
 
1102 aa  353  1e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0500  potassium efflux protein KefA  28.73 
 
 
1120 aa  352  2e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527944  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4940  potassium efflux protein KefA  28.65 
 
 
1102 aa  352  3e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310149  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  28.01 
 
 
1115 aa  349  2e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0399  potassium efflux protein KefA  28.1 
 
 
1102 aa  348  3e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2257  MscS mechanosensitive ion channel  28.47 
 
 
1110 aa  345  2.9999999999999997e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371999  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0501  potassium efflux protein KefA  28.34 
 
 
1134 aa  342  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5024  potassium efflux system protein KefA, putative  28.39 
 
 
1134 aa  337  5.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1130  potassium efflux protein KefA  29.13 
 
 
1130 aa  334  4e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000811569 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1447  MscS mechanosensitive ion channel  29.86 
 
 
1166 aa  330  1.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0581  potassium efflux protein KefA  27.99 
 
 
1118 aa  329  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.467495  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0538  potassium efflux protein KefA  27.99 
 
 
1118 aa  329  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0528  potassium efflux protein KefA  27.99 
 
 
1120 aa  328  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  27.26 
 
 
1144 aa  328  3e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0522  potassium efflux protein KefA  27.99 
 
 
1118 aa  328  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97346  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0519  potassium efflux protein KefA  29.61 
 
 
1120 aa  328  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45100  potassium efflux protein KefA  30.34 
 
 
1117 aa  325  3e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.534635  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5759  potassium efflux protein KefA  28.18 
 
 
1118 aa  322  3e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738971  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66400  potassium efflux protein KefA  28.32 
 
 
1118 aa  319  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  30.9 
 
 
1127 aa  317  9e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1206  potassium efflux protein KefA  25.98 
 
 
1098 aa  307  7e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1453  MscS mechanosensitive ion channel  24.75 
 
 
1105 aa  304  6.000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3304  MscS Mechanosensitive ion channel  25.69 
 
 
1235 aa  291  4e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0168  potassium efflux protein KefA  30.04 
 
 
1110 aa  291  6e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  31.99 
 
 
806 aa  175  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  35.06 
 
 
860 aa  157  7e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  36.84 
 
 
299 aa  158  7e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  32.27 
 
 
843 aa  147  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1632  MscS mechanosensitive ion channel  31.44 
 
 
877 aa  146  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253181  normal  0.172693 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4476  MscS mechanosensitive ion channel  32.89 
 
 
799 aa  142  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.878237 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0857  MscS mechanosensitive ion channel  32.65 
 
 
840 aa  141  6e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0786  MscS Mechanosensitive ion channel  32.65 
 
 
840 aa  141  6e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2163  MscS Mechanosensitive ion channel  33.88 
 
 
843 aa  141  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257742  normal  0.626494 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3407  MscS mechanosensitive ion channel  32.43 
 
 
832 aa  140  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4139  MscS Mechanosensitive ion channel  35.51 
 
 
815 aa  140  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0452  MscS Mechanosensitive ion channel  26.05 
 
 
853 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  35.48 
 
 
844 aa  139  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.275364 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5470  MscS mechanosensitive ion channel  32.65 
 
 
835 aa  139  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0741  MscS mechanosensitive ion channel  36.2 
 
 
803 aa  138  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  29.28 
 
 
842 aa  138  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0707  MscS mechanosensitive ion channel  33.71 
 
 
855 aa  138  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.441898  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  28.71 
 
 
840 aa  138  7.000000000000001e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  35.21 
 
 
291 aa  137  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  35.6 
 
 
298 aa  137  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>