More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3013 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 843 aa  1700    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0145  MscS Mechanosensitive ion channel  36.32 
 
 		 795 aa  259  1e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3172  MscS Mechanosensitive ion channel  45.21 
 
 		 784 aa  238  3e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  45.63 
 
 		 806 aa  228  3e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3447  mechanosensitive ion channel family protein  48.44 
 
 		 816 aa  226  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.597927  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  40.33 
 
 		 864 aa  225  2e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1587  MscS mechanosensitive ion channel  43.56 
 
 		 807 aa  226  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  39.64 
 
 		 981 aa  206  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  40.07 
 
 		 874 aa  205  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  42.41 
 
 		 299 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  41.83 
 
 		 685 aa  202  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  38.69 
 
 		 825 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0384  mechanosensitive ion channel  31.84 
 
 		 752 aa  199  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1465  hypothetical protein  32.49 
 
 		 753 aa  196  1e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3407  MscS mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 		 832 aa  194  6e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  34.68 
 
 		 842 aa  194  6e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3390  MscS mechanosensitive ion channel  41.51 
 
 		 861 aa  192  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0397  potassium efflux protein KefA  41.11 
 
 		 1120 aa  191  4e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0555  potassium efflux protein KefA  41.11 
 
 		 1118 aa  191  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0508  potassium efflux protein KefA  41.11 
 
 		 1120 aa  191  4e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000540502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0500  potassium efflux protein KefA  41.11 
 
 		 1120 aa  191  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527944  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00416  fused conserved protein  41.11 
 
 		 1120 aa  191  5e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  41.11 
 
 		 1120 aa  191  5e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3151  potassium efflux protein KefA  41.11 
 
 		 1120 aa  191  5e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.800258  normal  0.703774 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3064  potassium efflux protein KefA  41.54 
 
 		 1120 aa  191  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3204  potassium efflux protein KefA  41.54 
 
 		 1120 aa  191  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2883  potassium efflux protein KefA  41.54 
 
 		 1120 aa  191  5e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0991479 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0541  potassium efflux protein KefA  41.11 
 
 		 1120 aa  191  5e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00421  hypothetical protein  41.11 
 
 		 1120 aa  191  5e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0538  potassium efflux protein KefA  41.83 
 
 		 1118 aa  190  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  39.37 
 
 		 291 aa  189  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0528  potassium efflux protein KefA  41.83 
 
 		 1120 aa  190  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0581  potassium efflux protein KefA  41.83 
 
 		 1118 aa  190  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.467495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0522  potassium efflux protein KefA  41.83 
 
 		 1118 aa  190  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0519  potassium efflux protein KefA  41.83 
 
 		 1120 aa  190  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0935  MscS mechanosensitive ion channel  36.36 
 
 		 845 aa  189  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3045  potassium efflux protein KefA  39.11 
 
 		 1133 aa  188  4e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  41.74 
 
 		 636 aa  187  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  40.08 
 
 		 1111 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  41.81 
 
 		 637 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0168  potassium efflux protein KefA  42.15 
 
 		 1110 aa  185  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2646  MscS mechanosensitive ion channel  37.09 
 
 		 322 aa  184  4.0000000000000006e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  41.32 
 
 		 636 aa  184  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  35.5 
 
 		 1115 aa  184  7e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1013  potassium efflux protein KefA  41 
 
 		 1128 aa  184  8.000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0501  potassium efflux protein KefA  35.35 
 
 		 1134 aa  183  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4892  MscS Mechanosensitive ion channel  42.62 
 
 		 560 aa  183  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3304  MscS Mechanosensitive ion channel  39.11 
 
 		 1235 aa  182  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5024  potassium efflux system protein KefA, putative  35.02 
 
 		 1134 aa  182  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0445  potassium efflux protein KefA  35.14 
 
 		 1117 aa  181  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.953711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1632  MscS mechanosensitive ion channel  26.09 
 
 		 877 aa  180  9e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253181  normal  0.172693 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1934  mechanosensitive ion channel family protein  38.62 
 
 		 287 aa  179  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117079  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0101  putative AefA  44.57 
 
 		 338 aa  179  3e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.0000000159695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 		 472 aa  178  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1632  mechanosensitive ion channel family protein  46.11 
 
 		 782 aa  177  6e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274059  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  38.43 
 
 		 298 aa  177  8e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1447  MscS mechanosensitive ion channel  36.78 
 
 		 1166 aa  177  8e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5117  potassium efflux protein KefA  35.03 
 
 		 1102 aa  177  8e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1130  potassium efflux protein KefA  40.46 
 
 		 1130 aa  176  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000811569 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0399  potassium efflux protein KefA  35.05 
 
 		 1102 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2163  MscS Mechanosensitive ion channel  32.53 
 
 		 843 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257742  normal  0.626494 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  36.27 
 
 		 840 aa  176  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  33.98 
 
 		 867 aa  176  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  32.44 
 
 		 844 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275364 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  36.33 
 
 		 1144 aa  175  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1453  MscS mechanosensitive ion channel  40.08 
 
 		 1105 aa  175  3.9999999999999995e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2151  MscS mechanosensitive ion channel  39.39 
 
 		 1158 aa  174  5e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3392  MscS Mechanosensitive ion channel  39.07 
 
 		 833 aa  172  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  35.69 
 
 		 847 aa  171  8e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  34.47 
 
 		 847 aa  170  8e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  34.98 
 
 		 849 aa  171  8e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  36.88 
 
 		 860 aa  170  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3012  MscS mechanosensitive ion channel  42.08 
 
 		 297 aa  170  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  36.34 
 
 		 859 aa  169  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45100  potassium efflux protein KefA  37.86 
 
 		 1117 aa  169  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.534635  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1608  MscS mechanosensitive ion channel  39.02 
 
 		 868 aa  169  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1206  potassium efflux protein KefA  38.17 
 
 		 1098 aa  169  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1518  hypothetical protein  34.33 
 
 		 732 aa  169  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  37.58 
 
 		 796 aa  168  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2829  MscS mechanosensitive ion channel  36.84 
 
 		 294 aa  167  5e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3910  hypothetical protein  41.4 
 
 		 301 aa  167  6.9999999999999995e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2730  potassium efflux system KEFA  34.89 
 
 		 825 aa  166  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668875  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1712  MscS mechanosensitive ion channel  43 
 
 		 291 aa  165  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2257  MscS mechanosensitive ion channel  39.59 
 
 		 1110 aa  164  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371999  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1903  MscS Mechanosensitive ion channel  43.53 
 
 		 303 aa  163  1e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5067  potassium efflux protein KefA  35.05 
 
 		 1102 aa  162  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4940  potassium efflux protein KefA  35.05 
 
 		 1102 aa  161  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1784  mechanosensitive ion channel family protein  34.1 
 
 		 891 aa  161  5e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1606  MscS mechanosensitive ion channel  38.63 
 
 		 307 aa  161  5e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.696801  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5759  potassium efflux protein KefA  35.04 
 
 		 1118 aa  161  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738971  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66400  potassium efflux protein KefA  35.04 
 
 		 1118 aa  161  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1461  MscS Mechanosensitive ion channel  34.1 
 
 		 785 aa  160  9e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  38.31 
 
 		 830 aa  158  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  36.15 
 
 		 1127 aa  157  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3826  MscS Mechanosensitive ion channel  33.81 
 
 		 444 aa  157  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4182  MscS mechanosensitive ion channel  30.33 
 
 		 1070 aa  157  8e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3343  mechanosensitive ion channel protein  32.52 
 
 		 813 aa  156  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.183155 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  32.18 
 
 		 270 aa  155  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1599  MscS Mechanosensitive ion channel  33.94 
 
 		 862 aa  154  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  34.65 
 
 		 280 aa  154  7e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>