More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0452 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0452  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 853 aa  1681    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3222  MscS mechanosensitive ion channel  44.33 
 
 		 866 aa  650    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4556  MscS Mechanosensitive ion channel  41.03 
 
 		 883 aa  509  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0198839  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5378  MscS Mechanosensitive ion channel  41.91 
 
 		 909 aa  504  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.287309  normal  0.723398 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4833  MscS mechanosensitive ion channel  39.53 
 
 		 947 aa  503  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.882104  normal  0.702316 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5300  MscS Mechanosensitive ion channel  39.64 
 
 		 909 aa  505  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3059  MscS mechanosensitive ion channel  39.47 
 
 		 879 aa  504  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0365719  normal  0.0542576 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4343  MscS mechanosensitive ion channel  39.26 
 
 		 910 aa  495  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  36.41 
 
 		 874 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  31.35 
 
 		 859 aa  335  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3407  MscS mechanosensitive ion channel  33.68 
 
 		 832 aa  333  6e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4139  MscS Mechanosensitive ion channel  33.87 
 
 		 815 aa  331  4e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0935  MscS mechanosensitive ion channel  33.46 
 
 		 845 aa  316  9.999999999999999e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03384  small-conductance mechanosensitive channel  32.25 
 
 		 803 aa  306  1.0000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.670806  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2730  potassium efflux system KEFA  30.27 
 
 		 825 aa  301  3e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668875  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  30.19 
 
 		 844 aa  301  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275364 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5470  MscS mechanosensitive ion channel  31.17 
 
 		 835 aa  295  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2163  MscS Mechanosensitive ion channel  30.14 
 
 		 843 aa  292  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257742  normal  0.626494 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  30.39 
 
 		 825 aa  288  2e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  38.35 
 
 		 860 aa  286  8e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3758  MscS Mechanosensitive ion channel  31.64 
 
 		 809 aa  278  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.992907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2215  MscS mechanosensitive ion channel  30.4 
 
 		 820 aa  279  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.311174 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0786  MscS Mechanosensitive ion channel  29.83 
 
 		 840 aa  278  4e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0857  MscS mechanosensitive ion channel  29.83 
 
 		 840 aa  276  1.0000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  28.1 
 
 		 867 aa  276  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3656  MscS mechanosensitive ion channel  29.35 
 
 		 856 aa  268  5e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.570339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0381  MscS mechanosensitive ion channel  29.73 
 
 		 815 aa  265  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0741  MscS mechanosensitive ion channel  29.55 
 
 		 803 aa  257  5e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2528  MscS mechanosensitive ion channel  27.74 
 
 		 817 aa  250  7e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.290655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4476  MscS mechanosensitive ion channel  29.94 
 
 		 799 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.878237 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5154  MscS mechanosensitive ion channel  28.41 
 
 		 814 aa  248  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0457644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0707  MscS mechanosensitive ion channel  29.64 
 
 		 855 aa  247  6e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.441898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2264  mechanosensitive ion channel family protein  29.84 
 
 		 809 aa  247  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2125  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  29.84 
 
 		 809 aa  247  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0467602  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0986  mechanosensitive ion channel family protein  30.86 
 
 		 808 aa  247  8e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.722323  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1293  MscS Mechanosensitive ion channel  26.52 
 
 		 814 aa  246  9e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2070  mechanosensitive ion channel family protein  29.84 
 
 		 809 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563687  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2869  MscS Mechanosensitive ion channel  27.32 
 
 		 815 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266209  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4029  putative mechanosensitive ion channel  29.25 
 
 		 832 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4629  MscS mechanosensitive ion channel  28.84 
 
 		 832 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0740  MscS mechanosensitive ion channel  29.29 
 
 		 803 aa  245  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2316  mechanosensitive ion channel family protein  29.84 
 
 		 773 aa  243  7e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3452  MscS mechanosensitive ion channel  29.64 
 
 		 816 aa  244  7e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00203474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46240  hypothetical protein  29.6 
 
 		 807 aa  242  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.566889  normal  0.0303227 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1404  MscS Mechanosensitive ion channel  28.05 
 
 		 817 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3482  MscS mechanosensitive ion channel  33.27 
 
 		 813 aa  240  9e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144458  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3100  MscS mechanosensitive ion channel  29.54 
 
 		 820 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.416731  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5267  MscS mechanosensitive ion channel  29.54 
 
 		 820 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.269062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3931  hypothetical protein  29.2 
 
 		 806 aa  239  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.604151  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5006  MscS mechanosensitive ion channel  29.54 
 
 		 814 aa  238  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1852  mechanosensitive ion channel family protein  29.78 
 
 		 804 aa  235  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0601787  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  47.92 
 
 		 840 aa  234  3e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2392  MscS mechanosensitive ion channel  28.53 
 
 		 794 aa  230  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.211304  hitchhiker  0.00331512 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3549  MscS mechanosensitive ion channel  28.26 
 
 		 803 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.566467  normal  0.27975 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  44.91 
 
 		 847 aa  213  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  44.91 
 
 		 847 aa  213  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  43.01 
 
 		 849 aa  211  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  42.11 
 
 		 830 aa  208  4e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1608  MscS mechanosensitive ion channel  35.08 
 
 		 868 aa  206  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  36.65 
 
 		 796 aa  193  9e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1784  mechanosensitive ion channel family protein  32.98 
 
 		 891 aa  184  8.000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1461  MscS Mechanosensitive ion channel  32.98 
 
 		 785 aa  182  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0384  mechanosensitive ion channel  29.38 
 
 		 752 aa  179  2e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1518  hypothetical protein  33.16 
 
 		 732 aa  172  3e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  38.96 
 
 		 806 aa  171  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1465  hypothetical protein  33.16 
 
 		 753 aa  170  8e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1632  MscS mechanosensitive ion channel  36.72 
 
 		 877 aa  166  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253181  normal  0.172693 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  42.52 
 
 		 981 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0145  MscS Mechanosensitive ion channel  35.37 
 
 		 795 aa  161  5e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1587  MscS mechanosensitive ion channel  33.67 
 
 		 807 aa  153  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3064  potassium efflux protein KefA  34.89 
 
 		 1120 aa  152  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3204  potassium efflux protein KefA  34.89 
 
 		 1120 aa  152  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2883  potassium efflux protein KefA  34.89 
 
 		 1120 aa  152  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0991479 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0445  potassium efflux protein KefA  35.16 
 
 		 1117 aa  150  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.953711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  36.48 
 
 		 1111 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3934  hypothetical protein  31.35 
 
 		 1107 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  35.71 
 
 		 299 aa  148  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  33.82 
 
 		 864 aa  148  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0399  potassium efflux protein KefA  34.92 
 
 		 1102 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5117  potassium efflux protein KefA  35.37 
 
 		 1102 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0501  potassium efflux protein KefA  33.56 
 
 		 1134 aa  148  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3447  mechanosensitive ion channel family protein  39.5 
 
 		 816 aa  148  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.597927  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45100  potassium efflux protein KefA  32.25 
 
 		 1117 aa  148  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.534635  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5024  potassium efflux system protein KefA, putative  32.88 
 
 		 1134 aa  147  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00416  fused conserved protein  36.56 
 
 		 1120 aa  147  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  36.56 
 
 		 1120 aa  147  8.000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0397  potassium efflux protein KefA  36.56 
 
 		 1120 aa  147  8.000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0500  potassium efflux protein KefA  36.56 
 
 		 1120 aa  147  8.000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527944  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00421  hypothetical protein  36.56 
 
 		 1120 aa  147  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3151  potassium efflux protein KefA  36.56 
 
 		 1120 aa  147  8.000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.800258  normal  0.703774 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0541  potassium efflux protein KefA  36.56 
 
 		 1120 aa  147  8.000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0555  potassium efflux protein KefA  36.56 
 
 		 1118 aa  147  9e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0508  potassium efflux protein KefA  36.56 
 
 		 1120 aa  147  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000540502  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04029  predicted mechanosensitive channel  30.82 
 
 		 1107 aa  144  7e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.475668  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5675  hypothetical protein  30.82 
 
 		 1107 aa  144  7e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00234961  normal  0.548719 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3756  hypothetical protein  30.72 
 
 		 1107 aa  144  7e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4401  hypothetical protein  30.82 
 
 		 1107 aa  144  7e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.199255  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03991  hypothetical protein  30.82 
 
 		 1107 aa  144  7e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.391275  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4716  hypothetical protein  30.82 
 
 		 1107 aa  144  7e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00612141  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4691  hypothetical protein  30.82 
 
 		 1107 aa  144  7e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00421616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>