More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2094 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 860 aa  1691    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3059  MscS mechanosensitive ion channel  34.51 
 
 		 879 aa  416  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0365719  normal  0.0542576 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4556  MscS Mechanosensitive ion channel  34.99 
 
 		 883 aa  412  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0198839  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5300  MscS Mechanosensitive ion channel  35.81 
 
 		 909 aa  405  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4833  MscS mechanosensitive ion channel  37.15 
 
 		 947 aa  404  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.882104  normal  0.702316 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4343  MscS mechanosensitive ion channel  35.87 
 
 		 910 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5378  MscS Mechanosensitive ion channel  37.02 
 
 		 909 aa  395  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.287309  normal  0.723398 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3222  MscS mechanosensitive ion channel  32.88 
 
 		 866 aa  382  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0452  MscS Mechanosensitive ion channel  34.3 
 
 		 853 aa  370  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  34.41 
 
 		 874 aa  365  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3407  MscS mechanosensitive ion channel  32.51 
 
 		 832 aa  338  2.9999999999999997e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  32.29 
 
 		 859 aa  336  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0935  MscS mechanosensitive ion channel  32.07 
 
 		 845 aa  335  3e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2730  potassium efflux system KEFA  31.03 
 
 		 825 aa  311  4e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668875  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4139  MscS Mechanosensitive ion channel  31.77 
 
 		 815 aa  309  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2163  MscS Mechanosensitive ion channel  29.99 
 
 		 843 aa  298  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257742  normal  0.626494 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  28.45 
 
 		 867 aa  296  8e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  30.18 
 
 		 844 aa  290  8e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275364 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5470  MscS mechanosensitive ion channel  31.77 
 
 		 835 aa  289  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2215  MscS mechanosensitive ion channel  32.67 
 
 		 820 aa  289  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.311174 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  31.23 
 
 		 825 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03384  small-conductance mechanosensitive channel  31.02 
 
 		 803 aa  276  9e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.670806  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3758  MscS Mechanosensitive ion channel  29.73 
 
 		 809 aa  275  3e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.992907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3482  MscS mechanosensitive ion channel  31.4 
 
 		 813 aa  271  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144458  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3656  MscS mechanosensitive ion channel  30.04 
 
 		 856 aa  267  8e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.570339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2528  MscS mechanosensitive ion channel  29.34 
 
 		 817 aa  264  4.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.290655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0786  MscS Mechanosensitive ion channel  31.42 
 
 		 840 aa  262  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0857  MscS mechanosensitive ion channel  30.76 
 
 		 840 aa  258  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1608  MscS mechanosensitive ion channel  30.01 
 
 		 868 aa  257  7e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  32.57 
 
 		 840 aa  257  7e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4029  putative mechanosensitive ion channel  31.4 
 
 		 832 aa  256  9e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1293  MscS Mechanosensitive ion channel  29.21 
 
 		 814 aa  253  9.000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5154  MscS mechanosensitive ion channel  28.85 
 
 		 814 aa  252  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0457644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1404  MscS Mechanosensitive ion channel  29.51 
 
 		 817 aa  252  3e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2869  MscS Mechanosensitive ion channel  27.39 
 
 		 815 aa  250  8e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266209  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4629  MscS mechanosensitive ion channel  28.66 
 
 		 832 aa  249  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0381  MscS mechanosensitive ion channel  27.82 
 
 		 815 aa  243  9e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2392  MscS mechanosensitive ion channel  28.55 
 
 		 794 aa  239  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.211304  hitchhiker  0.00331512 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3100  MscS mechanosensitive ion channel  29.12 
 
 		 820 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.416731  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5267  MscS mechanosensitive ion channel  29.12 
 
 		 820 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.269062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4476  MscS mechanosensitive ion channel  32.46 
 
 		 799 aa  238  3e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.878237 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3452  MscS mechanosensitive ion channel  29.74 
 
 		 816 aa  238  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00203474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3931  hypothetical protein  29.92 
 
 		 806 aa  238  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.604151  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5006  MscS mechanosensitive ion channel  28.7 
 
 		 814 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46240  hypothetical protein  29.77 
 
 		 807 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.566889  normal  0.0303227 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2264  mechanosensitive ion channel family protein  30.05 
 
 		 809 aa  230  9e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2125  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  30.05 
 
 		 809 aa  230  9e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0467602  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  40.91 
 
 		 849 aa  229  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0986  mechanosensitive ion channel family protein  30.05 
 
 		 808 aa  229  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.722323  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0740  MscS mechanosensitive ion channel  29.53 
 
 		 803 aa  228  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0741  MscS mechanosensitive ion channel  29.27 
 
 		 803 aa  228  4e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2070  mechanosensitive ion channel family protein  29.96 
 
 		 809 aa  228  4e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563687  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1852  mechanosensitive ion channel family protein  28.31 
 
 		 804 aa  225  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0601787  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  41.09 
 
 		 847 aa  225  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  40 
 
 		 847 aa  226  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0707  MscS mechanosensitive ion channel  29.51 
 
 		 855 aa  225  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.441898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2316  mechanosensitive ion channel family protein  29.8 
 
 		 773 aa  225  4e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  40.21 
 
 		 830 aa  221  3.9999999999999997e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3549  MscS mechanosensitive ion channel  27.83 
 
 		 803 aa  211  5e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.566467  normal  0.27975 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  37.58 
 
 		 796 aa  210  9e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1518  hypothetical protein  38.59 
 
 		 732 aa  199  3e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1465  hypothetical protein  38.26 
 
 		 753 aa  199  3e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  40.16 
 
 		 806 aa  197  6e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0384  mechanosensitive ion channel  32.88 
 
 		 752 aa  192  2e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1461  MscS Mechanosensitive ion channel  38.33 
 
 		 785 aa  189  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1784  mechanosensitive ion channel family protein  38.33 
 
 		 891 aa  189  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  30.94 
 
 		 1144 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  38.4 
 
 		 1127 aa  181  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  35.81 
 
 		 843 aa  181  7e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  34.92 
 
 		 299 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0145  MscS Mechanosensitive ion channel  32.17 
 
 		 795 aa  174  5e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  39.73 
 
 		 472 aa  174  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3304  MscS Mechanosensitive ion channel  35.06 
 
 		 1235 aa  173  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3172  MscS Mechanosensitive ion channel  38.66 
 
 		 784 aa  167  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  36.76 
 
 		 291 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45100  potassium efflux protein KefA  30.96 
 
 		 1117 aa  165  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.534635  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3756  hypothetical protein  32.35 
 
 		 1107 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1453  MscS mechanosensitive ion channel  38.87 
 
 		 1105 aa  164  6e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0421  hypothetical protein  34.47 
 
 		 1115 aa  164  7e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.693078  hitchhiker  0.0000017841 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1447  MscS mechanosensitive ion channel  31.07 
 
 		 1166 aa  164  7e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4744  hypothetical protein  34.09 
 
 		 1108 aa  164  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4616  hypothetical protein  34.09 
 
 		 1108 aa  164  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.115019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4625  hypothetical protein  34.09 
 
 		 1108 aa  164  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.288253  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4708  hypothetical protein  34.09 
 
 		 1108 aa  164  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.749013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4765  hypothetical protein  34.09 
 
 		 1108 aa  164  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.514219  normal  0.17769 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2883  potassium efflux protein KefA  38.91 
 
 		 1120 aa  163  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0991479 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3204  potassium efflux protein KefA  38.91 
 
 		 1120 aa  163  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3447  mechanosensitive ion channel family protein  40 
 
 		 816 aa  163  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.597927  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3064  potassium efflux protein KefA  38.91 
 
 		 1120 aa  163  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00416  fused conserved protein  32.38 
 
 		 1120 aa  162  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  32.38 
 
 		 1120 aa  162  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0508  potassium efflux protein KefA  32.38 
 
 		 1120 aa  162  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000540502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3934  hypothetical protein  31.99 
 
 		 1107 aa  162  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  36.36 
 
 		 298 aa  162  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00421  hypothetical protein  32.38 
 
 		 1120 aa  162  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0541  potassium efflux protein KefA  32.38 
 
 		 1120 aa  162  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0397  potassium efflux protein KefA  32.38 
 
 		 1120 aa  162  3e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0500  potassium efflux protein KefA  32.38 
 
 		 1120 aa  162  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527944  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3151  potassium efflux protein KefA  32.38 
 
 		 1120 aa  162  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.800258  normal  0.703774 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0555  potassium efflux protein KefA  32.38 
 
 		 1118 aa  162  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364262  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>