More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B4625 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_04029  predicted mechanosensitive channel  89.17 
 
 
1107 aa  1998    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.475668  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3831  MscS Mechanosensitive ion channel  89.17 
 
 
1107 aa  1998    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.915765  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4744  hypothetical protein  100 
 
 
1108 aa  2232    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3934  hypothetical protein  68.87 
 
 
1107 aa  1515    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3851  hypothetical protein  89.08 
 
 
1107 aa  1998    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332968 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5675  hypothetical protein  89.17 
 
 
1107 aa  1998    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00234961  normal  0.548719 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0711  hypothetical protein  70.57 
 
 
1113 aa  1487    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.871081  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4708  hypothetical protein  100 
 
 
1108 aa  2232    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.749013  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0473  hypothetical protein  67.09 
 
 
1104 aa  1463    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3811  hypothetical protein  70.59 
 
 
1113 aa  1490    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.408276  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4401  hypothetical protein  89.26 
 
 
1107 aa  1999    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.199255  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4765  hypothetical protein  100 
 
 
1108 aa  2232    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.514219  normal  0.17769 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3756  hypothetical protein  69.95 
 
 
1107 aa  1516    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0345  hypothetical protein  86.73 
 
 
1103 aa  1933    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.742298  unclonable  0.00000473028 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4616  hypothetical protein  100 
 
 
1108 aa  2232    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.115019  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0421  hypothetical protein  69.38 
 
 
1115 aa  1533    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.693078  hitchhiker  0.0000017841 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4630  hypothetical protein  89.08 
 
 
1107 aa  1999    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.250026  normal  0.0442574 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0384  hypothetical protein  68.37 
 
 
1107 aa  1481    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.207125  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4716  hypothetical protein  89.17 
 
 
1107 aa  1998    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00612141  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03991  hypothetical protein  89.17 
 
 
1107 aa  1998    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.391275  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4625  hypothetical protein  100 
 
 
1108 aa  2232    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.288253  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4691  hypothetical protein  89.08 
 
 
1107 aa  1996    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00421616  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3664  hypothetical protein  70.59 
 
 
1113 aa  1490    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.907056  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3036  transporter, putative  38.5 
 
 
1080 aa  568  1e-160  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0415629  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4182  MscS mechanosensitive ion channel  37.07 
 
 
1070 aa  538  1e-151  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588  transporter, putative  35.8 
 
 
1067 aa  535  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3721  MscS Mechanosensitive ion channel  36.05 
 
 
1072 aa  534  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0547  MscS mechanosensitive ion channel  35.95 
 
 
1067 aa  534  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3904  MscS mechanosensitive ion channel  36.05 
 
 
1072 aa  535  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3778  MscS mechanosensitive ion channel  36.05 
 
 
1072 aa  535  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0586  MscS mechanosensitive ion channel  37.91 
 
 
1067 aa  532  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0875624 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0587  MscS mechanosensitive ion channel  37.91 
 
 
1067 aa  531  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0226105 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3443  MscS mechanosensitive ion channel  37.8 
 
 
1067 aa  528  1e-148  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3321  MscS mechanosensitive ion channel  36.53 
 
 
1078 aa  515  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.660513  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3291  MscS mechanosensitive ion channel  36.58 
 
 
1068 aa  511  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.563171  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0786  MscS mechanosensitive ion channel  33.06 
 
 
1066 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.213544  hitchhiker  0.000495101 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0555  MscS mechanosensitive ion channel  36.49 
 
 
1060 aa  504  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0475901  normal  0.179203 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3551  MscS mechanosensitive ion channel  35.58 
 
 
1062 aa  474  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2151  MscS mechanosensitive ion channel  28.38 
 
 
1158 aa  392  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3045  potassium efflux protein KefA  30.52 
 
 
1133 aa  381  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  30.87 
 
 
1111 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2883  potassium efflux protein KefA  28.71 
 
 
1120 aa  371  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0991479 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3204  potassium efflux protein KefA  28.71 
 
 
1120 aa  371  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3064  potassium efflux protein KefA  28.71 
 
 
1120 aa  371  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3390  MscS mechanosensitive ion channel  30.67 
 
 
861 aa  368  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0445  potassium efflux protein KefA  29.51 
 
 
1117 aa  369  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.953711  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5117  potassium efflux protein KefA  29.04 
 
 
1102 aa  362  3e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666166  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1013  potassium efflux protein KefA  30.95 
 
 
1128 aa  357  5.999999999999999e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2257  MscS mechanosensitive ion channel  28.99 
 
 
1110 aa  355  2e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371999  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5067  potassium efflux protein KefA  29.63 
 
 
1102 aa  354  5e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4940  potassium efflux protein KefA  29.68 
 
 
1102 aa  353  7e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310149  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  28.61 
 
 
1115 aa  350  1e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0555  potassium efflux protein KefA  28.12 
 
 
1118 aa  347  8.999999999999999e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364262  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00416  fused conserved protein  28.12 
 
 
1120 aa  347  1e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  28.12 
 
 
1120 aa  347  1e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3151  potassium efflux protein KefA  28.12 
 
 
1120 aa  347  1e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.800258  normal  0.703774 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00421  hypothetical protein  28.12 
 
 
1120 aa  347  1e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0541  potassium efflux protein KefA  28.12 
 
 
1120 aa  347  1e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0508  potassium efflux protein KefA  28.12 
 
 
1120 aa  346  1e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000540502  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0397  potassium efflux protein KefA  28.74 
 
 
1120 aa  345  2e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0500  potassium efflux protein KefA  28.12 
 
 
1120 aa  346  2e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527944  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0399  potassium efflux protein KefA  28.47 
 
 
1102 aa  345  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5024  potassium efflux system protein KefA, putative  28.89 
 
 
1134 aa  337  9e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0501  potassium efflux protein KefA  28.57 
 
 
1134 aa  335  4e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1447  MscS mechanosensitive ion channel  30.06 
 
 
1166 aa  333  9e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  28.68 
 
 
1144 aa  332  2e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1130  potassium efflux protein KefA  29.81 
 
 
1130 aa  328  2.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000811569 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5759  potassium efflux protein KefA  28.67 
 
 
1118 aa  328  3e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738971  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0538  potassium efflux protein KefA  28.73 
 
 
1118 aa  328  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0519  potassium efflux protein KefA  28.72 
 
 
1120 aa  327  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0581  potassium efflux protein KefA  28.62 
 
 
1118 aa  327  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.467495  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0528  potassium efflux protein KefA  28.62 
 
 
1120 aa  327  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0522  potassium efflux protein KefA  28.73 
 
 
1118 aa  327  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97346  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66400  potassium efflux protein KefA  28.85 
 
 
1118 aa  326  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  32.86 
 
 
1127 aa  323  9.999999999999999e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45100  potassium efflux protein KefA  30.15 
 
 
1117 aa  320  7.999999999999999e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.534635  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3304  MscS Mechanosensitive ion channel  26.01 
 
 
1235 aa  311  4e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1453  MscS mechanosensitive ion channel  25 
 
 
1105 aa  305  4.0000000000000003e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1206  potassium efflux protein KefA  26.43 
 
 
1098 aa  301  3e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0168  potassium efflux protein KefA  36.03 
 
 
1110 aa  269  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  33.7 
 
 
806 aa  165  5.0000000000000005e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  36.49 
 
 
860 aa  162  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  36.08 
 
 
299 aa  156  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1632  MscS mechanosensitive ion channel  31.92 
 
 
877 aa  150  9e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253181  normal  0.172693 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  32.67 
 
 
843 aa  149  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  33.33 
 
 
291 aa  145  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0452  MscS Mechanosensitive ion channel  26.89 
 
 
853 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0786  MscS Mechanosensitive ion channel  33.47 
 
 
840 aa  143  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  34.26 
 
 
844 aa  143  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.275364 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  29.52 
 
 
840 aa  143  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0857  MscS mechanosensitive ion channel  33.47 
 
 
840 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2163  MscS Mechanosensitive ion channel  34.26 
 
 
843 aa  141  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257742  normal  0.626494 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  30.04 
 
 
847 aa  141  7e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  30.04 
 
 
847 aa  141  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5470  MscS mechanosensitive ion channel  33.47 
 
 
835 aa  140  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3407  MscS mechanosensitive ion channel  32.95 
 
 
832 aa  140  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4139  MscS Mechanosensitive ion channel  37.16 
 
 
815 aa  140  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  33.89 
 
 
636 aa  139  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4343  MscS mechanosensitive ion channel  30.28 
 
 
910 aa  138  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  29.83 
 
 
849 aa  138  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>