More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3064 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00416  fused conserved protein  60.04 
 
 
1120 aa  1327    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  60.04 
 
 
1120 aa  1327    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5067  potassium efflux protein KefA  43.03 
 
 
1102 aa  810    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  60.33 
 
 
1115 aa  1345    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0397  potassium efflux protein KefA  59.95 
 
 
1120 aa  1326    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5024  potassium efflux system protein KefA, putative  42.11 
 
 
1134 aa  798    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0538  potassium efflux protein KefA  60.13 
 
 
1118 aa  1310    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5759  potassium efflux protein KefA  44.09 
 
 
1118 aa  813    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738971  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1013  potassium efflux protein KefA  66.1 
 
 
1128 aa  1420    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0501  potassium efflux protein KefA  41.32 
 
 
1134 aa  787    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45100  potassium efflux protein KefA  41.28 
 
 
1117 aa  761    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.534635  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0445  potassium efflux protein KefA  42.87 
 
 
1117 aa  825    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.953711  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5117  potassium efflux protein KefA  42.99 
 
 
1102 aa  818    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666166  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0528  potassium efflux protein KefA  60.13 
 
 
1120 aa  1311    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0500  potassium efflux protein KefA  59.95 
 
 
1120 aa  1325    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527944  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0581  potassium efflux protein KefA  60.13 
 
 
1118 aa  1310    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.467495  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0541  potassium efflux protein KefA  60.04 
 
 
1120 aa  1327    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0555  potassium efflux protein KefA  59.95 
 
 
1118 aa  1325    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364262  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0399  potassium efflux protein KefA  43.54 
 
 
1102 aa  806    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  43.37 
 
 
1111 aa  812    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4940  potassium efflux protein KefA  43.35 
 
 
1102 aa  810    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310149  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0519  potassium efflux protein KefA  60.22 
 
 
1120 aa  1312    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0168  potassium efflux protein KefA  43.92 
 
 
1110 aa  753    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1447  MscS mechanosensitive ion channel  41.44 
 
 
1166 aa  682    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3045  potassium efflux protein KefA  68.43 
 
 
1133 aa  1481    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1130  potassium efflux protein KefA  71.38 
 
 
1130 aa  1531    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000811569 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3204  potassium efflux protein KefA  100 
 
 
1120 aa  2265    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3064  potassium efflux protein KefA  100 
 
 
1120 aa  2265    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1206  potassium efflux protein KefA  36.88 
 
 
1098 aa  654    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3151  potassium efflux protein KefA  60.04 
 
 
1120 aa  1327    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.800258  normal  0.703774 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2883  potassium efflux protein KefA  100 
 
 
1120 aa  2265    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0991479 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0522  potassium efflux protein KefA  60.04 
 
 
1118 aa  1306    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97346  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00421  hypothetical protein  60.04 
 
 
1120 aa  1327    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66400  potassium efflux protein KefA  44.15 
 
 
1118 aa  790    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0508  potassium efflux protein KefA  59.85 
 
 
1120 aa  1325    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000540502  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2151  MscS mechanosensitive ion channel  30.78 
 
 
1158 aa  427  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4182  MscS mechanosensitive ion channel  31.42 
 
 
1070 aa  388  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04029  predicted mechanosensitive channel  28.89 
 
 
1107 aa  378  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.475668  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3831  MscS Mechanosensitive ion channel  28.89 
 
 
1107 aa  378  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.915765  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4716  hypothetical protein  28.89 
 
 
1107 aa  378  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00612141  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3036  transporter, putative  31.06 
 
 
1080 aa  379  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0415629  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03991  hypothetical protein  28.89 
 
 
1107 aa  378  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.391275  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4691  hypothetical protein  28.89 
 
 
1107 aa  378  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00421616  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5675  hypothetical protein  28.81 
 
 
1107 aa  377  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00234961  normal  0.548719 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4630  hypothetical protein  29.43 
 
 
1107 aa  378  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.250026  normal  0.0442574 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4401  hypothetical protein  28.89 
 
 
1107 aa  378  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.199255  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3851  hypothetical protein  28.89 
 
 
1107 aa  379  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332968 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3721  MscS Mechanosensitive ion channel  32.22 
 
 
1072 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0555  MscS mechanosensitive ion channel  32.12 
 
 
1060 aa  377  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0475901  normal  0.179203 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0345  hypothetical protein  29.43 
 
 
1103 aa  375  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.742298  unclonable  0.00000473028 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3778  MscS mechanosensitive ion channel  32.22 
 
 
1072 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3904  MscS mechanosensitive ion channel  32.22 
 
 
1072 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2257  MscS mechanosensitive ion channel  29.51 
 
 
1110 aa  375  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371999  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0587  MscS mechanosensitive ion channel  32.64 
 
 
1067 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0226105 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3443  MscS mechanosensitive ion channel  32.4 
 
 
1067 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588  transporter, putative  32.4 
 
 
1067 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  32.4 
 
 
1144 aa  371  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0547  MscS mechanosensitive ion channel  32.11 
 
 
1067 aa  373  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0586  MscS mechanosensitive ion channel  32.4 
 
 
1067 aa  370  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0875624 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0786  MscS mechanosensitive ion channel  29.99 
 
 
1066 aa  368  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.213544  hitchhiker  0.000495101 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4616  hypothetical protein  28.71 
 
 
1108 aa  366  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.115019  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4708  hypothetical protein  28.71 
 
 
1108 aa  366  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.749013  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4625  hypothetical protein  28.71 
 
 
1108 aa  366  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.288253  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4744  hypothetical protein  28.71 
 
 
1108 aa  366  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4765  hypothetical protein  28.71 
 
 
1108 aa  366  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.514219  normal  0.17769 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0421  hypothetical protein  28.34 
 
 
1115 aa  364  5.0000000000000005e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.693078  hitchhiker  0.0000017841 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3291  MscS mechanosensitive ion channel  29.43 
 
 
1068 aa  363  8e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.563171  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3934  hypothetical protein  28.81 
 
 
1107 aa  353  1e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3321  MscS mechanosensitive ion channel  30.04 
 
 
1078 aa  353  1e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.660513  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0384  hypothetical protein  28.1 
 
 
1107 aa  352  3e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.207125  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3756  hypothetical protein  29.34 
 
 
1107 aa  348  2e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3390  MscS mechanosensitive ion channel  32.51 
 
 
861 aa  349  2e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1453  MscS mechanosensitive ion channel  28.25 
 
 
1105 aa  338  3.9999999999999995e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0473  hypothetical protein  28.35 
 
 
1104 aa  337  5.999999999999999e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3551  MscS mechanosensitive ion channel  34.24 
 
 
1062 aa  331  5.0000000000000004e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3811  hypothetical protein  29.25 
 
 
1113 aa  316  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.408276  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3664  hypothetical protein  29.25 
 
 
1113 aa  316  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.907056  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0711  hypothetical protein  29.16 
 
 
1113 aa  315  3.9999999999999997e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.871081  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  27.74 
 
 
1127 aa  307  9.000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3304  MscS Mechanosensitive ion channel  27.35 
 
 
1235 aa  297  9e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  40.97 
 
 
806 aa  217  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  41.72 
 
 
864 aa  208  5e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  41.54 
 
 
843 aa  191  5.999999999999999e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  36.01 
 
 
796 aa  190  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  35.82 
 
 
840 aa  188  6e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1587  MscS mechanosensitive ion channel  44.39 
 
 
807 aa  184  8.000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370206  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3447  mechanosensitive ion channel family protein  42.54 
 
 
816 aa  180  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.597927  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  44.5 
 
 
299 aa  178  7e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  35.16 
 
 
825 aa  177  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  37.93 
 
 
981 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0145  MscS Mechanosensitive ion channel  36.06 
 
 
795 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  36.47 
 
 
842 aa  173  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  37.74 
 
 
874 aa  171  6e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  40.5 
 
 
636 aa  171  6e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  39.56 
 
 
291 aa  171  9e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  40.5 
 
 
636 aa  170  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  35.98 
 
 
844 aa  168  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.275364 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  36.4 
 
 
849 aa  167  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1632  MscS mechanosensitive ion channel  37 
 
 
877 aa  166  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253181  normal  0.172693 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  38.49 
 
 
847 aa  166  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>