More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1784 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1461  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 785 aa  1593    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1784  mechanosensitive ion channel family protein  100 
 
 		 891 aa  1825    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0384  mechanosensitive ion channel  27.53 
 
 		 752 aa  247  6e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  40.07 
 
 		 849 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  40.43 
 
 		 847 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  40.21 
 
 		 847 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  34.02 
 
 		 840 aa  215  2.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1465  hypothetical protein  30.79 
 
 		 753 aa  201  3e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  28.7 
 
 		 859 aa  202  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  33.78 
 
 		 830 aa  201  5e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  39.79 
 
 		 874 aa  200  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  33.08 
 
 		 825 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  35.78 
 
 		 796 aa  192  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3059  MscS mechanosensitive ion channel  32.49 
 
 		 879 aa  191  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0365719  normal  0.0542576 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1518  hypothetical protein  31.25 
 
 		 732 aa  189  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4343  MscS mechanosensitive ion channel  39.29 
 
 		 910 aa  189  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4556  MscS Mechanosensitive ion channel  32.97 
 
 		 883 aa  189  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0198839  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  43.84 
 
 		 860 aa  188  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4833  MscS mechanosensitive ion channel  38.36 
 
 		 947 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.882104  normal  0.702316 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5300  MscS Mechanosensitive ion channel  38.36 
 
 		 909 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0935  MscS mechanosensitive ion channel  33.07 
 
 		 845 aa  184  8.000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3407  MscS mechanosensitive ion channel  36.95 
 
 		 832 aa  183  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5378  MscS Mechanosensitive ion channel  39.03 
 
 		 909 aa  182  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.287309  normal  0.723398 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0452  MscS Mechanosensitive ion channel  32.98 
 
 		 853 aa  183  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  38.46 
 
 		 806 aa  180  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 844 aa  180  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275364 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2163  MscS Mechanosensitive ion channel  33.08 
 
 		 843 aa  179  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257742  normal  0.626494 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  29.52 
 
 		 867 aa  175  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3758  MscS Mechanosensitive ion channel  35.56 
 
 		 809 aa  172  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.992907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0145  MscS Mechanosensitive ion channel  32.57 
 
 		 795 aa  168  4e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  32.01 
 
 		 685 aa  168  4e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  38.75 
 
 		 864 aa  166  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  39.91 
 
 		 291 aa  165  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  36.36 
 
 		 298 aa  165  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  33.82 
 
 		 1144 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3222  MscS mechanosensitive ion channel  37.08 
 
 		 866 aa  162  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2730  potassium efflux system KEFA  38.77 
 
 		 825 aa  163  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668875  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1608  MscS mechanosensitive ion channel  29.17 
 
 		 868 aa  161  4e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3447  mechanosensitive ion channel family protein  36.99 
 
 		 816 aa  161  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.597927  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  39.46 
 
 		 843 aa  160  8e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  36.78 
 
 		 1127 aa  157  7e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  34.39 
 
 		 1111 aa  157  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03384  small-conductance mechanosensitive channel  34.24 
 
 		 803 aa  157  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.670806  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1587  MscS mechanosensitive ion channel  40.3 
 
 		 807 aa  157  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66400  potassium efflux protein KefA  35.87 
 
 		 1118 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3304  MscS Mechanosensitive ion channel  35.27 
 
 		 1235 aa  154  5e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0399  potassium efflux protein KefA  33.86 
 
 		 1102 aa  153  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5117  potassium efflux protein KefA  33.07 
 
 		 1102 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5759  potassium efflux protein KefA  27.02 
 
 		 1118 aa  152  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738971  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  33.98 
 
 		 299 aa  151  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1447  MscS mechanosensitive ion channel  34.06 
 
 		 1166 aa  151  5e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0168  potassium efflux protein KefA  35.1 
 
 		 1110 aa  150  9e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  37.62 
 
 		 636 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3931  hypothetical protein  32.97 
 
 		 806 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.604151  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  37.62 
 
 		 636 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 472 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  36.53 
 
 		 981 aa  149  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0519  potassium efflux protein KefA  35.84 
 
 		 1120 aa  147  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3172  MscS Mechanosensitive ion channel  35.17 
 
 		 784 aa  147  6e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0522  potassium efflux protein KefA  35.84 
 
 		 1118 aa  148  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0528  potassium efflux protein KefA  35.84 
 
 		 1120 aa  147  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0581  potassium efflux protein KefA  35.84 
 
 		 1118 aa  147  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.467495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46240  hypothetical protein  33.85 
 
 		 807 aa  148  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.566889  normal  0.0303227 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0538  potassium efflux protein KefA  35.84 
 
 		 1118 aa  147  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1206  potassium efflux protein KefA  37.61 
 
 		 1098 aa  147  7.0000000000000006e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  34.96 
 
 		 1115 aa  147  8.000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1453  MscS mechanosensitive ion channel  34.15 
 
 		 1105 aa  147  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3656  MscS mechanosensitive ion channel  33.46 
 
 		 856 aa  147  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.570339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4139  MscS Mechanosensitive ion channel  34.51 
 
 		 815 aa  145  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0445  potassium efflux protein KefA  31.23 
 
 		 1117 aa  145  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.953711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5470  MscS mechanosensitive ion channel  36.49 
 
 		 835 aa  145  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3045  potassium efflux protein KefA  34.51 
 
 		 1133 aa  145  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00416  fused conserved protein  35.56 
 
 		 1120 aa  144  5e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  35.56 
 
 		 1120 aa  144  5e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3151  potassium efflux protein KefA  35.56 
 
 		 1120 aa  144  5e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.800258  normal  0.703774 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0541  potassium efflux protein KefA  35.56 
 
 		 1120 aa  144  5e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00421  hypothetical protein  35.56 
 
 		 1120 aa  144  5e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0397  potassium efflux protein KefA  35.56 
 
 		 1120 aa  144  6e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0500  potassium efflux protein KefA  35.56 
 
 		 1120 aa  144  6e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527944  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0555  potassium efflux protein KefA  33.04 
 
 		 1118 aa  144  6e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0508  potassium efflux protein KefA  35.56 
 
 		 1120 aa  144  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000540502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1632  MscS mechanosensitive ion channel  32.29 
 
 		 877 aa  144  8e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253181  normal  0.172693 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0707  MscS mechanosensitive ion channel  33.21 
 
 		 855 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.441898  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5024  potassium efflux system protein KefA, putative  31.69 
 
 		 1134 aa  144  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3910  hypothetical protein  33.58 
 
 		 301 aa  144  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2646  MscS mechanosensitive ion channel  29.1 
 
 		 322 aa  143  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3204  potassium efflux protein KefA  35.84 
 
 		 1120 aa  143  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2883  potassium efflux protein KefA  35.84 
 
 		 1120 aa  143  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0991479 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0857  MscS mechanosensitive ion channel  32.95 
 
 		 840 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3064  potassium efflux protein KefA  35.84 
 
 		 1120 aa  143  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0786  MscS Mechanosensitive ion channel  32.95 
 
 		 840 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2151  MscS mechanosensitive ion channel  31.36 
 
 		 1158 aa  142  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0740  MscS mechanosensitive ion channel  33.09 
 
 		 803 aa  141  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0741  MscS mechanosensitive ion channel  33.21 
 
 		 803 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5067  potassium efflux protein KefA  32.96 
 
 		 1102 aa  140  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0812  MscS mechanosensitive ion channel  37.22 
 
 		 643 aa  140  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.459246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3390  MscS mechanosensitive ion channel  35.24 
 
 		 861 aa  140  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4940  potassium efflux protein KefA  32.96 
 
 		 1102 aa  140  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1130  potassium efflux protein KefA  35.84 
 
 		 1130 aa  139  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000811569 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2215  MscS mechanosensitive ion channel  32.06 
 
 		 820 aa  139  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.311174 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>