More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2215 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2215  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 820 aa  1592    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.311174 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4139  MscS Mechanosensitive ion channel  43.58 
 
 		 815 aa  492  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0786  MscS Mechanosensitive ion channel  42.67 
 
 		 840 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5470  MscS mechanosensitive ion channel  41.53 
 
 		 835 aa  468  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0857  MscS mechanosensitive ion channel  42.54 
 
 		 840 aa  466  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3656  MscS mechanosensitive ion channel  40.97 
 
 		 856 aa  465  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.570339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3931  hypothetical protein  39.79 
 
 		 806 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.604151  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46240  hypothetical protein  39.85 
 
 		 807 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.566889  normal  0.0303227 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4476  MscS mechanosensitive ion channel  37.71 
 
 		 799 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.878237 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1852  mechanosensitive ion channel family protein  36.96 
 
 		 804 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0601787  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0741  MscS mechanosensitive ion channel  36.59 
 
 		 803 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3549  MscS mechanosensitive ion channel  38.32 
 
 		 803 aa  395  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.566467  normal  0.27975 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0707  MscS mechanosensitive ion channel  37.06 
 
 		 855 aa  392  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.441898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2869  MscS Mechanosensitive ion channel  33.12 
 
 		 815 aa  392  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266209  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0740  MscS mechanosensitive ion channel  36.72 
 
 		 803 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1404  MscS Mechanosensitive ion channel  33.5 
 
 		 817 aa  392  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03384  small-conductance mechanosensitive channel  35.95 
 
 		 803 aa  387  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.670806  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0381  MscS mechanosensitive ion channel  34.23 
 
 		 815 aa  379  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3452  MscS mechanosensitive ion channel  36.31 
 
 		 816 aa  372  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00203474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5154  MscS mechanosensitive ion channel  34.22 
 
 		 814 aa  372  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0457644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1293  MscS Mechanosensitive ion channel  34.06 
 
 		 814 aa  369  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2070  mechanosensitive ion channel family protein  36.67 
 
 		 809 aa  369  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563687  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2264  mechanosensitive ion channel family protein  36.67 
 
 		 809 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2125  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  36.67 
 
 		 809 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0467602  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4629  MscS mechanosensitive ion channel  34.63 
 
 		 832 aa  369  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0986  mechanosensitive ion channel family protein  36.67 
 
 		 808 aa  363  7.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.722323  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2316  mechanosensitive ion channel family protein  36.23 
 
 		 773 aa  362  2e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5006  MscS mechanosensitive ion channel  34.84 
 
 		 814 aa  357  6.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5267  MscS mechanosensitive ion channel  34.51 
 
 		 820 aa  356  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.269062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3100  MscS mechanosensitive ion channel  34.51 
 
 		 820 aa  356  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.416731  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2528  MscS mechanosensitive ion channel  32.18 
 
 		 817 aa  355  2e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.290655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4029  putative mechanosensitive ion channel  35.59 
 
 		 832 aa  353  5.9999999999999994e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3758  MscS Mechanosensitive ion channel  36.08 
 
 		 809 aa  352  2e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.992907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3482  MscS mechanosensitive ion channel  36.44 
 
 		 813 aa  346  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144458  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2392  MscS mechanosensitive ion channel  33.38 
 
 		 794 aa  336  1e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.211304  hitchhiker  0.00331512 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5300  MscS Mechanosensitive ion channel  32.5 
 
 		 909 aa  306  7e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4833  MscS mechanosensitive ion channel  32.5 
 
 		 947 aa  306  9.000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.882104  normal  0.702316 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5378  MscS Mechanosensitive ion channel  32.85 
 
 		 909 aa  304  5.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.287309  normal  0.723398 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0452  MscS Mechanosensitive ion channel  30.54 
 
 		 853 aa  295  3e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3059  MscS mechanosensitive ion channel  31.41 
 
 		 879 aa  293  7e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0365719  normal  0.0542576 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4556  MscS Mechanosensitive ion channel  32.11 
 
 		 883 aa  292  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0198839  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4343  MscS mechanosensitive ion channel  31.2 
 
 		 910 aa  291  4e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3222  MscS mechanosensitive ion channel  30.46 
 
 		 866 aa  280  7e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3407  MscS mechanosensitive ion channel  32.37 
 
 		 832 aa  268  4e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  30.25 
 
 		 874 aa  264  4.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  32.56 
 
 		 860 aa  264  6.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0935  MscS mechanosensitive ion channel  31.37 
 
 		 845 aa  260  7e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  30.29 
 
 		 859 aa  248  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  26.64 
 
 		 867 aa  232  3e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2730  potassium efflux system KEFA  26.76 
 
 		 825 aa  216  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668875  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2163  MscS Mechanosensitive ion channel  28.97 
 
 		 843 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257742  normal  0.626494 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  29.12 
 
 		 844 aa  211  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275364 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  29.2 
 
 		 825 aa  204  6e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  38.73 
 
 		 830 aa  184  5.0000000000000004e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  35.05 
 
 		 840 aa  175  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1608  MscS mechanosensitive ion channel  29.23 
 
 		 868 aa  173  9e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  38.19 
 
 		 796 aa  167  9e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 849 aa  155  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  34.1 
 
 		 847 aa  154  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  34.1 
 
 		 847 aa  153  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1784  mechanosensitive ion channel family protein  32.06 
 
 		 891 aa  146  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1461  MscS Mechanosensitive ion channel  32.06 
 
 		 785 aa  146  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1465  hypothetical protein  26.65 
 
 		 753 aa  144  6e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  32.44 
 
 		 298 aa  139  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  33.2 
 
 		 291 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  32.82 
 
 		 806 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0384  mechanosensitive ion channel  28.98 
 
 		 752 aa  134  5e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  32.84 
 
 		 842 aa  133  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  33.21 
 
 		 1127 aa  132  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  30.38 
 
 		 299 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0168  potassium efflux protein KefA  37.5 
 
 		 1110 aa  128  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  32.92 
 
 		 1144 aa  127  6e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1599  MscS Mechanosensitive ion channel  34.23 
 
 		 862 aa  127  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1518  hypothetical protein  27.03 
 
 		 732 aa  127  7e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2151  MscS mechanosensitive ion channel  34.96 
 
 		 1158 aa  126  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0421  hypothetical protein  32.68 
 
 		 1115 aa  126  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.693078  hitchhiker  0.0000017841 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  28.78 
 
 		 843 aa  125  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45100  potassium efflux protein KefA  32.28 
 
 		 1117 aa  125  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.534635  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  30.95 
 
 		 636 aa  125  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0145  MscS Mechanosensitive ion channel  34.95 
 
 		 795 aa  125  4e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  31.42 
 
 		 637 aa  125  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0445  potassium efflux protein KefA  34.3 
 
 		 1117 aa  124  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.953711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  31.9 
 
 		 981 aa  124  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  32.97 
 
 		 685 aa  124  9e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3934  hypothetical protein  33.17 
 
 		 1107 aa  124  9e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3756  hypothetical protein  31.71 
 
 		 1107 aa  124  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5759  potassium efflux protein KefA  35.18 
 
 		 1118 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738971  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3304  MscS Mechanosensitive ion channel  33.02 
 
 		 1235 aa  122  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0384  hypothetical protein  32.93 
 
 		 1107 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.207125  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66400  potassium efflux protein KefA  35.18 
 
 		 1118 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5024  potassium efflux system protein KefA, putative  38.46 
 
 		 1134 aa  122  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  35.53 
 
 		 1111 aa  122  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  29.96 
 
 		 636 aa  122  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0501  potassium efflux protein KefA  38.46 
 
 		 1134 aa  122  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1447  MscS mechanosensitive ion channel  33.48 
 
 		 1166 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0555  MscS mechanosensitive ion channel  30.92 
 
 		 1060 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0475901  normal  0.179203 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0156  MscS mechanosensitive ion channel  30.21 
 
 		 437 aa  121  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0421972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3291  MscS mechanosensitive ion channel  30.92 
 
 		 1068 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.563171  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0786  MscS mechanosensitive ion channel  30.92 
 
 		 1066 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.213544  hitchhiker  0.000495101 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2883  potassium efflux protein KefA  39.29 
 
 		 1120 aa  119  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0991479 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>