More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1518 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp1518  hypothetical protein  100 
 
 		 732 aa  1475    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1465  hypothetical protein  85.79 
 
 		 753 aa  1243    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0384  mechanosensitive ion channel  40.05 
 
 		 752 aa  281  3e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  33.68 
 
 		 840 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1461  MscS Mechanosensitive ion channel  31.25 
 
 		 785 aa  189  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1784  mechanosensitive ion channel family protein  31.25 
 
 		 891 aa  189  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  38.68 
 
 		 860 aa  188  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  36.7 
 
 		 796 aa  186  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  34.83 
 
 		 825 aa  184  3e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  31.64 
 
 		 867 aa  181  5.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  36.36 
 
 		 874 aa  180  9e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  36.39 
 
 		 830 aa  179  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  32.89 
 
 		 859 aa  173  7.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0452  MscS Mechanosensitive ion channel  31.97 
 
 		 853 aa  172  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0935  MscS mechanosensitive ion channel  34.01 
 
 		 845 aa  171  5e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  34.24 
 
 		 849 aa  171  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3407  MscS mechanosensitive ion channel  30.28 
 
 		 832 aa  167  9e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  34.41 
 
 		 843 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3222  MscS mechanosensitive ion channel  32.53 
 
 		 866 aa  166  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  35.04 
 
 		 847 aa  165  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  35.04 
 
 		 847 aa  165  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0145  MscS Mechanosensitive ion channel  33.66 
 
 		 795 aa  162  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5300  MscS Mechanosensitive ion channel  35.69 
 
 		 909 aa  160  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4833  MscS mechanosensitive ion channel  35.69 
 
 		 947 aa  159  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.882104  normal  0.702316 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  30.05 
 
 		 806 aa  158  4e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  29.33 
 
 		 844 aa  158  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275364 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5378  MscS Mechanosensitive ion channel  37.17 
 
 		 909 aa  157  6e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.287309  normal  0.723398 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3059  MscS mechanosensitive ion channel  34.53 
 
 		 879 aa  156  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0365719  normal  0.0542576 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2163  MscS Mechanosensitive ion channel  28.87 
 
 		 843 aa  156  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257742  normal  0.626494 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4343  MscS mechanosensitive ion channel  36.97 
 
 		 910 aa  155  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4556  MscS Mechanosensitive ion channel  37.31 
 
 		 883 aa  153  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0198839  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1608  MscS mechanosensitive ion channel  30.82 
 
 		 868 aa  152  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45100  potassium efflux protein KefA  27.11 
 
 		 1117 aa  152  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.534635  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2730  potassium efflux system KEFA  33.57 
 
 		 825 aa  151  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668875  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  37.84 
 
 		 299 aa  151  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  38.59 
 
 		 291 aa  150  8e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0399  potassium efflux protein KefA  29.17 
 
 		 1102 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  37.38 
 
 		 1111 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5117  potassium efflux protein KefA  27.23 
 
 		 1102 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0445  potassium efflux protein KefA  30.45 
 
 		 1117 aa  147  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.953711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  28.54 
 
 		 1115 aa  147  9e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00416  fused conserved protein  37.56 
 
 		 1120 aa  146  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  37.56 
 
 		 1120 aa  146  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3151  potassium efflux protein KefA  37.56 
 
 		 1120 aa  146  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.800258  normal  0.703774 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  38.25 
 
 		 636 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0581  potassium efflux protein KefA  37.86 
 
 		 1118 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.467495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0519  potassium efflux protein KefA  37.86 
 
 		 1120 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0397  potassium efflux protein KefA  37.56 
 
 		 1120 aa  146  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0508  potassium efflux protein KefA  37.56 
 
 		 1120 aa  146  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000540502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0541  potassium efflux protein KefA  37.56 
 
 		 1120 aa  146  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0528  potassium efflux protein KefA  37.86 
 
 		 1120 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0500  potassium efflux protein KefA  37.56 
 
 		 1120 aa  146  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527944  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0538  potassium efflux protein KefA  37.86 
 
 		 1118 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0522  potassium efflux protein KefA  37.86 
 
 		 1118 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97346  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3045  potassium efflux protein KefA  38.46 
 
 		 1133 aa  145  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0555  potassium efflux protein KefA  37.56 
 
 		 1118 aa  145  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00421  hypothetical protein  37.56 
 
 		 1120 aa  146  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  39.72 
 
 		 685 aa  145  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  42.39 
 
 		 636 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5024  potassium efflux system protein KefA, putative  36.89 
 
 		 1134 aa  144  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3204  potassium efflux protein KefA  26.13 
 
 		 1120 aa  144  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3064  potassium efflux protein KefA  26.13 
 
 		 1120 aa  144  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2883  potassium efflux protein KefA  26.13 
 
 		 1120 aa  144  7e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0991479 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0501  potassium efflux protein KefA  36.41 
 
 		 1134 aa  144  8e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1206  potassium efflux protein KefA  37.98 
 
 		 1098 aa  140  7.999999999999999e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1587  MscS mechanosensitive ion channel  39.67 
 
 		 807 aa  140  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2646  MscS mechanosensitive ion channel  31.85 
 
 		 322 aa  139  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  37.56 
 
 		 472 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3390  MscS mechanosensitive ion channel  35.12 
 
 		 861 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  29.97 
 
 		 842 aa  138  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1013  potassium efflux protein KefA  34.36 
 
 		 1128 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3447  mechanosensitive ion channel family protein  37.2 
 
 		 816 aa  137  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.597927  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1130  potassium efflux protein KefA  38.66 
 
 		 1130 aa  136  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000811569 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  36.82 
 
 		 1144 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  36.06 
 
 		 637 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  38.94 
 
 		 298 aa  134  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4940  potassium efflux protein KefA  29.43 
 
 		 1102 aa  134  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0168  potassium efflux protein KefA  35.92 
 
 		 1110 aa  134  6.999999999999999e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5067  potassium efflux protein KefA  29.43 
 
 		 1102 aa  134  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03384  small-conductance mechanosensitive channel  30.31 
 
 		 803 aa  133  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.670806  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2257  MscS mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 		 1110 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371999  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2052  MscS Mechanosensitive ion channel  33.88 
 
 		 810 aa  132  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3172  MscS Mechanosensitive ion channel  30.87 
 
 		 784 aa  132  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2829  MscS mechanosensitive ion channel  31.6 
 
 		 294 aa  131  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7380  mechanosensitive ion channel protein  37.75 
 
 		 439 aa  131  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  36.23 
 
 		 981 aa  131  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5154  MscS mechanosensitive ion channel  28.36 
 
 		 814 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0457644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1599  MscS Mechanosensitive ion channel  33.88 
 
 		 862 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3758  MscS Mechanosensitive ion channel  29.92 
 
 		 809 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.992907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0136  MscS mechanosensitive ion channel  30.89 
 
 		 451 aa  129  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3392  MscS Mechanosensitive ion channel  28.87 
 
 		 833 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4629  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 832 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  34.15 
 
 		 1127 aa  128  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2151  MscS mechanosensitive ion channel  31.58 
 
 		 1158 aa  127  5e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66400  potassium efflux protein KefA  27.78 
 
 		 1118 aa  127  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5759  potassium efflux protein KefA  31.71 
 
 		 1118 aa  127  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738971  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3826  MscS Mechanosensitive ion channel  37.62 
 
 		 444 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3910  hypothetical protein  32.05 
 
 		 301 aa  126  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5006  MscS mechanosensitive ion channel  31.07 
 
 		 814 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3482  MscS mechanosensitive ion channel  29.82 
 
 		 813 aa  125  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144458  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>