More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3826 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3826  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 444 aa  882    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2035  MscS Mechanosensitive ion channel  61.64 
 
 		 447 aa  549  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.200455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2010  MscS Mechanosensitive ion channel  61.64 
 
 		 447 aa  547  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2215  small-conductance mechanosensitive channel-like  33.42 
 
 		 431 aa  189  8e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0212215  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2560  small-conductance mechanosensitive channel-like  34.63 
 
 		 440 aa  188  2e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  39.13 
 
 		 806 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  39.59 
 
 		 291 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0145  MscS Mechanosensitive ion channel  40.39 
 
 		 795 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  38.95 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  36.01 
 
 		 299 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  45.28 
 
 		 864 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1587  MscS mechanosensitive ion channel  38.82 
 
 		 807 aa  169  6e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  37.75 
 
 		 842 aa  168  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  39.56 
 
 		 1144 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  34.83 
 
 		 825 aa  166  5e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  42.45 
 
 		 685 aa  166  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0168  potassium efflux protein KefA  40.66 
 
 		 1110 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3447  mechanosensitive ion channel family protein  41.51 
 
 		 816 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.597927  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  38.52 
 
 		 1111 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  35.98 
 
 		 796 aa  163  6e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  38.02 
 
 		 840 aa  163  7e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  42.08 
 
 		 981 aa  161  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0522  potassium efflux protein KefA  36.5 
 
 		 1118 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0528  potassium efflux protein KefA  36.5 
 
 		 1120 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0519  potassium efflux protein KefA  36.5 
 
 		 1120 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0538  potassium efflux protein KefA  36.5 
 
 		 1118 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0581  potassium efflux protein KefA  36.5 
 
 		 1118 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.467495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  36.5 
 
 		 1115 aa  159  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0399  potassium efflux protein KefA  36.36 
 
 		 1102 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00416  fused conserved protein  35.74 
 
 		 1120 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  35.74 
 
 		 1120 aa  157  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0508  potassium efflux protein KefA  35.74 
 
 		 1120 aa  157  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000540502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0541  potassium efflux protein KefA  35.74 
 
 		 1120 aa  157  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0555  potassium efflux protein KefA  35.74 
 
 		 1118 aa  157  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0397  potassium efflux protein KefA  35.74 
 
 		 1120 aa  157  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3151  potassium efflux protein KefA  35.74 
 
 		 1120 aa  157  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.800258  normal  0.703774 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3045  potassium efflux protein KefA  37.88 
 
 		 1133 aa  157  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00421  hypothetical protein  35.74 
 
 		 1120 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0500  potassium efflux protein KefA  35.74 
 
 		 1120 aa  157  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527944  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  33.81 
 
 		 843 aa  156  6e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3204  potassium efflux protein KefA  36.02 
 
 		 1120 aa  156  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3064  potassium efflux protein KefA  36.02 
 
 		 1120 aa  156  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5117  potassium efflux protein KefA  36.26 
 
 		 1102 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2883  potassium efflux protein KefA  36.02 
 
 		 1120 aa  156  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0991479 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3304  MscS Mechanosensitive ion channel  36.74 
 
 		 1235 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0445  potassium efflux protein KefA  34.81 
 
 		 1117 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.953711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2163  MscS Mechanosensitive ion channel  31.65 
 
 		 843 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257742  normal  0.626494 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45100  potassium efflux protein KefA  34.44 
 
 		 1117 aa  154  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.534635  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1130  potassium efflux protein KefA  37.07 
 
 		 1130 aa  152  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000811569 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5024  potassium efflux system protein KefA, putative  36.47 
 
 		 1134 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0501  potassium efflux protein KefA  36.47 
 
 		 1134 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3390  MscS mechanosensitive ion channel  38.64 
 
 		 861 aa  152  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1934  mechanosensitive ion channel family protein  34.15 
 
 		 287 aa  151  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117079  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  30.46 
 
 		 844 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275364 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66400  potassium efflux protein KefA  34.57 
 
 		 1118 aa  150  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5759  potassium efflux protein KefA  34.2 
 
 		 1118 aa  149  9e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738971  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5067  potassium efflux protein KefA  35.88 
 
 		 1102 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4940  potassium efflux protein KefA  35.88 
 
 		 1102 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3172  MscS Mechanosensitive ion channel  36.52 
 
 		 784 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1903  MscS Mechanosensitive ion channel  36.82 
 
 		 303 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  36.52 
 
 		 637 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  33.04 
 
 		 435 aa  147  5e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1222  MscS mechanosensitive ion channel  36.36 
 
 		 451 aa  146  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.110808  normal  0.111103 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2151  MscS mechanosensitive ion channel  35.43 
 
 		 1158 aa  146  9e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  41.75 
 
 		 636 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  41.75 
 
 		 636 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1447  MscS mechanosensitive ion channel  34.17 
 
 		 1166 aa  145  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  36.21 
 
 		 874 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1206  potassium efflux protein KefA  38.21 
 
 		 1098 aa  145  2e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2389  MscS mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 		 429 aa  144  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1465  hypothetical protein  41.9 
 
 		 753 aa  144  4e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2829  MscS mechanosensitive ion channel  33.06 
 
 		 294 aa  144  4e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0384  mechanosensitive ion channel  43.88 
 
 		 752 aa  144  4e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  37.83 
 
 		 830 aa  143  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2257  MscS mechanosensitive ion channel  38.91 
 
 		 1110 aa  143  6e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371999  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  36.36 
 
 		 859 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2646  MscS mechanosensitive ion channel  33.59 
 
 		 322 aa  142  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1013  potassium efflux protein KefA  37.5 
 
 		 1128 aa  140  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3144  MscS mechanosensitive ion channel  35.41 
 
 		 444 aa  141  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1699  MscS mechanosensitive ion channel  27.93 
 
 		 456 aa  140  3.9999999999999997e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.254155  normal  0.22429 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1453  MscS mechanosensitive ion channel  32.04 
 
 		 1105 aa  140  6e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0136  MscS mechanosensitive ion channel  29.34 
 
 		 451 aa  139  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0935  MscS mechanosensitive ion channel  30.37 
 
 		 845 aa  138  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3407  MscS mechanosensitive ion channel  30.71 
 
 		 832 aa  138  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1632  mechanosensitive ion channel family protein  36.27 
 
 		 782 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274059  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  34.91 
 
 		 1127 aa  136  7.000000000000001e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3036  transporter, putative  30.92 
 
 		 1080 aa  136  9e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0415629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0307  MscS mechanosensitive ion channel  30.08 
 
 		 435 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.381926  normal  0.0553472 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0757  MscS mechanosensitive ion channel  26.98 
 
 		 479 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1816  mscS family protein  33.5 
 
 		 448 aa  134  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.316092  normal  0.285124 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0452  MscS Mechanosensitive ion channel  33.85 
 
 		 853 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0101  putative AefA  35.25 
 
 		 338 aa  133  5e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.0000000159695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0579  MscS mechanosensitive ion channel  31.13 
 
 		 440 aa  133  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0872803  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588  transporter, putative  29.85 
 
 		 1067 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3778  MscS mechanosensitive ion channel  28.95 
 
 		 1072 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3904  MscS mechanosensitive ion channel  28.95 
 
 		 1072 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3721  MscS Mechanosensitive ion channel  29.48 
 
 		 1072 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0547  MscS mechanosensitive ion channel  29.48 
 
 		 1067 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3155  MscS Mechanosensitive ion channel  26.84 
 
 		 451 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00105623  normal  0.0641339 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1461  MscS Mechanosensitive ion channel  30.37 
 
 		 785 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>