More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2035 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2035  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 447 aa  892    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.200455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2010  MscS Mechanosensitive ion channel  99.33 
 
 		 447 aa  887    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3826  MscS Mechanosensitive ion channel  61.64 
 
 		 444 aa  549  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2215  small-conductance mechanosensitive channel-like  33.22 
 
 		 431 aa  192  8e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0212215  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2560  small-conductance mechanosensitive channel-like  32.57 
 
 		 440 aa  189  1e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  34.87 
 
 		 806 aa  179  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0145  MscS Mechanosensitive ion channel  39.46 
 
 		 795 aa  176  5e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  34.39 
 
 		 291 aa  169  6e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0168  potassium efflux protein KefA  40.34 
 
 		 1110 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  38.57 
 
 		 840 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  37.56 
 
 		 1144 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1587  MscS mechanosensitive ion channel  39.9 
 
 		 807 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370206  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00416  fused conserved protein  32.83 
 
 		 1120 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  32.83 
 
 		 1120 aa  162  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0555  potassium efflux protein KefA  32.83 
 
 		 1118 aa  162  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3151  potassium efflux protein KefA  32.83 
 
 		 1120 aa  162  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.800258  normal  0.703774 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  33.67 
 
 		 1111 aa  162  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0500  potassium efflux protein KefA  32.83 
 
 		 1120 aa  162  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527944  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0397  potassium efflux protein KefA  32.83 
 
 		 1120 aa  162  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0508  potassium efflux protein KefA  32.83 
 
 		 1120 aa  162  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000540502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0541  potassium efflux protein KefA  32.83 
 
 		 1120 aa  162  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00421  hypothetical protein  32.83 
 
 		 1120 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3172  MscS Mechanosensitive ion channel  38.57 
 
 		 784 aa  161  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  33.79 
 
 		 298 aa  161  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0528  potassium efflux protein KefA  32.83 
 
 		 1120 aa  161  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0519  potassium efflux protein KefA  32.83 
 
 		 1120 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0581  potassium efflux protein KefA  32.83 
 
 		 1118 aa  161  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.467495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0522  potassium efflux protein KefA  32.83 
 
 		 1118 aa  161  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0538  potassium efflux protein KefA  32.83 
 
 		 1118 aa  161  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  36.16 
 
 		 299 aa  160  5e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3304  MscS Mechanosensitive ion channel  37.44 
 
 		 1235 aa  159  9e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2257  MscS mechanosensitive ion channel  38.91 
 
 		 1110 aa  158  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371999  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  33.83 
 
 		 1115 aa  158  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5117  potassium efflux protein KefA  32.59 
 
 		 1102 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  38.86 
 
 		 685 aa  157  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0399  potassium efflux protein KefA  33.33 
 
 		 1102 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2151  MscS mechanosensitive ion channel  38.08 
 
 		 1158 aa  157  4e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  39.81 
 
 		 864 aa  157  4e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  39.6 
 
 		 981 aa  156  7e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5024  potassium efflux system protein KefA, putative  34 
 
 		 1134 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  37.55 
 
 		 830 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  33.72 
 
 		 796 aa  155  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0501  potassium efflux protein KefA  34 
 
 		 1134 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0445  potassium efflux protein KefA  31.56 
 
 		 1117 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.953711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3390  MscS mechanosensitive ion channel  36.87 
 
 		 861 aa  153  5e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5067  potassium efflux protein KefA  34.56 
 
 		 1102 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 435 aa  151  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45100  potassium efflux protein KefA  33.94 
 
 		 1117 aa  151  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.534635  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4940  potassium efflux protein KefA  34.56 
 
 		 1102 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1453  MscS mechanosensitive ion channel  36.4 
 
 		 1105 aa  150  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2646  MscS mechanosensitive ion channel  31.49 
 
 		 322 aa  150  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  31.01 
 
 		 637 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0384  mechanosensitive ion channel  39.56 
 
 		 752 aa  150  6e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3447  mechanosensitive ion channel family protein  37.5 
 
 		 816 aa  149  8e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.597927  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  36.4 
 
 		 842 aa  149  8e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3045  potassium efflux protein KefA  34.5 
 
 		 1133 aa  149  9e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1206  potassium efflux protein KefA  36.44 
 
 		 1098 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  36.49 
 
 		 1127 aa  148  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  36.77 
 
 		 874 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  34.82 
 
 		 825 aa  145  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  37.13 
 
 		 636 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  33.91 
 
 		 843 aa  145  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  37.13 
 
 		 636 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2389  MscS mechanosensitive ion channel  29.43 
 
 		 429 aa  144  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1130  potassium efflux protein KefA  34.9 
 
 		 1130 aa  143  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000811569 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0307  MscS mechanosensitive ion channel  31.92 
 
 		 435 aa  143  5e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.381926  normal  0.0553472 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  36.28 
 
 		 844 aa  143  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275364 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1447  MscS mechanosensitive ion channel  35.54 
 
 		 1166 aa  143  8e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1632  mechanosensitive ion channel family protein  38.07 
 
 		 782 aa  142  9e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274059  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5759  potassium efflux protein KefA  34.36 
 
 		 1118 aa  142  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738971  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1903  MscS Mechanosensitive ion channel  37.39 
 
 		 303 aa  142  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1222  MscS mechanosensitive ion channel  37.56 
 
 		 451 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.110808  normal  0.111103 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3407  MscS mechanosensitive ion channel  30.8 
 
 		 832 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66400  potassium efflux protein KefA  34.36 
 
 		 1118 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3204  potassium efflux protein KefA  30.41 
 
 		 1120 aa  142  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2883  potassium efflux protein KefA  30.41 
 
 		 1120 aa  142  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0991479 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3064  potassium efflux protein KefA  30.41 
 
 		 1120 aa  142  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0579  MscS mechanosensitive ion channel  31.1 
 
 		 440 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0872803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1699  MscS mechanosensitive ion channel  30.92 
 
 		 456 aa  140  3.9999999999999997e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.254155  normal  0.22429 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2163  MscS Mechanosensitive ion channel  33.92 
 
 		 843 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257742  normal  0.626494 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  34.74 
 
 		 860 aa  139  7.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7380  mechanosensitive ion channel protein  31.58 
 
 		 439 aa  139  7.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0136  MscS mechanosensitive ion channel  29.93 
 
 		 451 aa  139  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3144  MscS mechanosensitive ion channel  36.19 
 
 		 444 aa  139  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588  transporter, putative  30.45 
 
 		 1067 aa  138  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1465  hypothetical protein  39.41 
 
 		 753 aa  138  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3443  MscS mechanosensitive ion channel  30.45 
 
 		 1067 aa  138  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0935  MscS mechanosensitive ion channel  31.56 
 
 		 845 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0587  MscS mechanosensitive ion channel  30.04 
 
 		 1067 aa  136  8e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0226105 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3721  MscS Mechanosensitive ion channel  30.04 
 
 		 1072 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  35.29 
 
 		 472 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3904  MscS mechanosensitive ion channel  30.04 
 
 		 1072 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3778  MscS mechanosensitive ion channel  30.04 
 
 		 1072 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0547  MscS mechanosensitive ion channel  30.04 
 
 		 1067 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3291  MscS mechanosensitive ion channel  30.45 
 
 		 1068 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.563171  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3155  MscS Mechanosensitive ion channel  27.63 
 
 		 451 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00105623  normal  0.0641339 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0586  MscS mechanosensitive ion channel  29.63 
 
 		 1067 aa  134  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0875624 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0757  MscS mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 479 aa  134  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  35.27 
 
 		 847 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1013  potassium efflux protein KefA  34.5 
 
 		 1128 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>