More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1632 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1632  mechanosensitive ion channel family protein  100 
 
 		 782 aa  1567    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274059  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2829  MscS mechanosensitive ion channel  41.98 
 
 		 294 aa  218  2.9999999999999998e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1934  mechanosensitive ion channel family protein  38.91 
 
 		 287 aa  207  6e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117079  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3012  MscS mechanosensitive ion channel  44.74 
 
 		 297 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1606  MscS mechanosensitive ion channel  41.81 
 
 		 307 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.696801  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3172  MscS Mechanosensitive ion channel  42.5 
 
 		 784 aa  179  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1712  MscS mechanosensitive ion channel  41.78 
 
 		 291 aa  179  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  44.44 
 
 		 843 aa  178  4e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0145  MscS Mechanosensitive ion channel  39.3 
 
 		 795 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  40.39 
 
 		 864 aa  174  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  35.04 
 
 		 685 aa  171  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1587  MscS mechanosensitive ion channel  40.78 
 
 		 807 aa  169  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  34.41 
 
 		 806 aa  169  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3447  mechanosensitive ion channel family protein  40.69 
 
 		 816 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.597927  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  37 
 
 		 637 aa  163  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  35.74 
 
 		 840 aa  161  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  35.54 
 
 		 472 aa  160  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  38.24 
 
 		 981 aa  159  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2151  MscS mechanosensitive ion channel  38.24 
 
 		 1158 aa  159  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1453  MscS mechanosensitive ion channel  33.23 
 
 		 1105 aa  156  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  34.53 
 
 		 796 aa  155  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  37.44 
 
 		 299 aa  154  7e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2646  MscS mechanosensitive ion channel  33.6 
 
 		 322 aa  154  8e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  40.31 
 
 		 636 aa  151  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  40.31 
 
 		 636 aa  151  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4892  MscS Mechanosensitive ion channel  39.46 
 
 		 560 aa  151  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  33.87 
 
 		 842 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3390  MscS mechanosensitive ion channel  35.32 
 
 		 861 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2257  MscS mechanosensitive ion channel  41.08 
 
 		 1110 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371999  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2010  MscS Mechanosensitive ion channel  37.26 
 
 		 447 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1222  MscS mechanosensitive ion channel  37.68 
 
 		 451 aa  148  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.110808  normal  0.111103 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08271  hypothetical protein  36.19 
 
 		 329 aa  148  4.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2035  MscS Mechanosensitive ion channel  36.79 
 
 		 447 aa  147  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.200455  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  35.74 
 
 		 291 aa  147  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  38 
 
 		 874 aa  146  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3304  MscS Mechanosensitive ion channel  33.65 
 
 		 1235 aa  146  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0168  potassium efflux protein KefA  34.67 
 
 		 1110 aa  144  5e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  34.82 
 
 		 1111 aa  144  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  30.62 
 
 		 867 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  30.24 
 
 		 1115 aa  142  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3144  MscS mechanosensitive ion channel  36.71 
 
 		 444 aa  140  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3910  hypothetical protein  31.82 
 
 		 301 aa  140  7.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3407  MscS mechanosensitive ion channel  35.11 
 
 		 832 aa  140  7.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0501  potassium efflux protein KefA  29.6 
 
 		 1134 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0935  MscS mechanosensitive ion channel  34.45 
 
 		 845 aa  140  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3826  MscS Mechanosensitive ion channel  34.63 
 
 		 444 aa  140  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5024  potassium efflux system protein KefA, putative  29.24 
 
 		 1134 aa  139  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  32.52 
 
 		 847 aa  139  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  32.52 
 
 		 847 aa  139  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3343  mechanosensitive ion channel protein  35.71 
 
 		 813 aa  138  4e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.183155 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0445  potassium efflux protein KefA  27.58 
 
 		 1117 aa  137  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.953711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  36.14 
 
 		 1127 aa  138  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0522  potassium efflux protein KefA  28.05 
 
 		 1118 aa  138  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0528  potassium efflux protein KefA  28.05 
 
 		 1120 aa  138  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0581  potassium efflux protein KefA  28.05 
 
 		 1118 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.467495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0538  potassium efflux protein KefA  28.05 
 
 		 1118 aa  138  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0519  potassium efflux protein KefA  28.05 
 
 		 1120 aa  137  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  33.79 
 
 		 435 aa  137  6.0000000000000005e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  39.06 
 
 		 298 aa  137  8e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00416  fused conserved protein  28.08 
 
 		 1120 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  28.08 
 
 		 1120 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0508  potassium efflux protein KefA  28.08 
 
 		 1120 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000540502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3151  potassium efflux protein KefA  28.08 
 
 		 1120 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.800258  normal  0.703774 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0541  potassium efflux protein KefA  28.08 
 
 		 1120 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0397  potassium efflux protein KefA  28.08 
 
 		 1120 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00421  hypothetical protein  28.08 
 
 		 1120 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0555  potassium efflux protein KefA  28.08 
 
 		 1118 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0500  potassium efflux protein KefA  28.08 
 
 		 1120 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527944  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3427  MscS mechanosensitive ion channel  34.67 
 
 		 428 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.259375  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1465  hypothetical protein  35.6 
 
 		 753 aa  135  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0399  potassium efflux protein KefA  26.52 
 
 		 1102 aa  135  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  33.2 
 
 		 859 aa  135  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  33.07 
 
 		 830 aa  134  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  31.71 
 
 		 849 aa  134  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0384  mechanosensitive ion channel  38.54 
 
 		 752 aa  134  5e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0578  MscS mechanosensitive ion channel  32.13 
 
 		 451 aa  134  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.605561  normal  0.183245 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  29.57 
 
 		 1144 aa  134  6e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3064  potassium efflux protein KefA  28.99 
 
 		 1120 aa  134  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1599  MscS Mechanosensitive ion channel  30.46 
 
 		 862 aa  134  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3204  potassium efflux protein KefA  28.99 
 
 		 1120 aa  134  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2883  potassium efflux protein KefA  28.99 
 
 		 1120 aa  134  6.999999999999999e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0991479 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0757  MscS mechanosensitive ion channel  29.93 
 
 		 479 aa  134  7.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5117  potassium efflux protein KefA  28.06 
 
 		 1102 aa  134  9e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3155  MscS Mechanosensitive ion channel  34.02 
 
 		 451 aa  134  9e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00105623  normal  0.0641339 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0811  small-conductance mechanosensitive channel protein  34.02 
 
 		 451 aa  134  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  32.05 
 
 		 825 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45100  potassium efflux protein KefA  34.48 
 
 		 1117 aa  133  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.534635  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2389  MscS mechanosensitive ion channel  32.03 
 
 		 429 aa  132  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1632  MscS mechanosensitive ion channel  39.42 
 
 		 877 aa  132  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253181  normal  0.172693 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3392  MscS Mechanosensitive ion channel  35.79 
 
 		 833 aa  130  8.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3804  MscS Mechanosensitive ion channel  34.67 
 
 		 495 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1699  MscS mechanosensitive ion channel  32.53 
 
 		 456 aa  129  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.254155  normal  0.22429 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1013  potassium efflux protein KefA  34.01 
 
 		 1128 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2527  MscS mechanosensitive ion channel  32.46 
 
 		 427 aa  129  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2162  periplasmic binding protein; mechanosensitive ion channel component  32.02 
 
 		 794 aa  128  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1130  potassium efflux protein KefA  34.52 
 
 		 1130 aa  128  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000811569 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5067  potassium efflux protein KefA  28.06 
 
 		 1102 aa  127  7e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2426  MscS mechanosensitive ion channel  34.39 
 
 		 460 aa  127  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610338  hitchhiker  0.0000133571 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4940  potassium efflux protein KefA  28.06 
 
 		 1102 aa  127  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  32.8 
 
 		 844 aa  127  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275364 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>