More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3804 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3804  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 495 aa  987    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  38.89 
 
 		 472 aa  345  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  37.01 
 
 		 637 aa  310  5e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0736  MscS Mechanosensitive ion channel  38.36 
 
 		 484 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0765  MscS Mechanosensitive ion channel  38.16 
 
 		 484 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0664  cyclic nucleotide-binding  35.58 
 
 		 449 aa  230  6e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0101822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  36.68 
 
 		 299 aa  187  4e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  35.16 
 
 		 291 aa  183  7e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  35.9 
 
 		 806 aa  177  5e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4892  MscS Mechanosensitive ion channel  42.92 
 
 		 560 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  35.23 
 
 		 840 aa  170  7e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  33.45 
 
 		 298 aa  169  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  36.24 
 
 		 636 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  41.28 
 
 		 636 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  33.44 
 
 		 685 aa  166  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0384  mechanosensitive ion channel  36.36 
 
 		 752 aa  162  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1247  transmembrane protein  34.83 
 
 		 435 aa  160  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.072199  normal  0.308743 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  32.06 
 
 		 825 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3144  MscS mechanosensitive ion channel  32.97 
 
 		 444 aa  157  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1222  MscS mechanosensitive ion channel  31.46 
 
 		 451 aa  157  5.0000000000000005e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.110808  normal  0.111103 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2151  MscS mechanosensitive ion channel  32.52 
 
 		 1158 aa  153  8e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  31.8 
 
 		 843 aa  151  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0307  MscS mechanosensitive ion channel  27.96 
 
 		 435 aa  152  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.381926  normal  0.0553472 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  32.47 
 
 		 796 aa  149  8e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2330  MscS Mechanosensitive ion channel  31.29 
 
 		 458 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194216  normal  0.152351 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1632  mechanosensitive ion channel family protein  34.31 
 
 		 782 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274059  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  35.87 
 
 		 981 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2646  MscS mechanosensitive ion channel  31.23 
 
 		 322 aa  148  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 859 aa  148  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2719  MscS Mechanosensitive ion channel  30.13 
 
 		 457 aa  148  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  33.71 
 
 		 842 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2527  MscS mechanosensitive ion channel  32.26 
 
 		 427 aa  147  5e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3447  mechanosensitive ion channel family protein  35.83 
 
 		 816 aa  147  6e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.597927  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  34.59 
 
 		 844 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275364 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2829  MscS mechanosensitive ion channel  31.74 
 
 		 294 aa  145  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2163  MscS Mechanosensitive ion channel  32.98 
 
 		 843 aa  144  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257742  normal  0.626494 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1903  MscS Mechanosensitive ion channel  35.49 
 
 		 303 aa  143  6e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  31.41 
 
 		 847 aa  143  9e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4343  MscS mechanosensitive ion channel  32.81 
 
 		 910 aa  143  9e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  31.41 
 
 		 847 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3059  MscS mechanosensitive ion channel  35.39 
 
 		 879 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0365719  normal  0.0542576 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2389  MscS mechanosensitive ion channel  33.45 
 
 		 429 aa  142  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1465  hypothetical protein  37.33 
 
 		 753 aa  141  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3407  MscS mechanosensitive ion channel  32.83 
 
 		 832 aa  140  7e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3066  MscS mechanosensitive ion channel  33.56 
 
 		 452 aa  140  7.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3910  hypothetical protein  31.46 
 
 		 301 aa  139  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0101  putative AefA  36.15 
 
 		 338 aa  138  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.0000000159695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2883  potassium efflux protein KefA  30.1 
 
 		 1120 aa  138  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0991479 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3064  potassium efflux protein KefA  30.1 
 
 		 1120 aa  138  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3204  potassium efflux protein KefA  30.1 
 
 		 1120 aa  138  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0975  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  30.4 
 
 		 450 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2238  mechanosensitive ion channel family protein  30.4 
 
 		 449 aa  137  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1129  mechanosensitive ion channel family protein  30.4 
 
 		 449 aa  137  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0971  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  30.4 
 
 		 450 aa  137  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2654  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  30.4 
 
 		 450 aa  137  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2108  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  30.4 
 
 		 450 aa  137  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5378  MscS Mechanosensitive ion channel  31.17 
 
 		 909 aa  137  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.287309  normal  0.723398 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1029  mechanosensitive ion channel family protein  30.4 
 
 		 450 aa  137  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.165892  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  33.06 
 
 		 874 aa  137  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2451  hypothetical protein  31.03 
 
 		 447 aa  136  8e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  31.23 
 
 		 860 aa  136  8e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4556  MscS Mechanosensitive ion channel  34.57 
 
 		 883 aa  136  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0198839  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1934  mechanosensitive ion channel family protein  34.11 
 
 		 287 aa  136  9e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117079  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  34.07 
 
 		 864 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2426  MscS mechanosensitive ion channel  30.04 
 
 		 460 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610338  hitchhiker  0.0000133571 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0445  potassium efflux protein KefA  32.67 
 
 		 1117 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.953711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1447  MscS mechanosensitive ion channel  27.3 
 
 		 1166 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  32.96 
 
 		 849 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2555  MscS mechanosensitive ion channel  29.67 
 
 		 460 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0774  mechanosensitive ion channel family protein  29.79 
 
 		 450 aa  134  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5024  potassium efflux system protein KefA, putative  29.52 
 
 		 1134 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0501  potassium efflux protein KefA  29.52 
 
 		 1134 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4833  MscS mechanosensitive ion channel  30.5 
 
 		 947 aa  134  5e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.882104  normal  0.702316 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0812  MscS mechanosensitive ion channel  31 
 
 		 643 aa  134  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.459246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1587  MscS mechanosensitive ion channel  31.42 
 
 		 807 aa  133  6e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3155  MscS Mechanosensitive ion channel  27.94 
 
 		 451 aa  133  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00105623  normal  0.0641339 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0935  MscS mechanosensitive ion channel  32.08 
 
 		 845 aa  133  6.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3390  MscS mechanosensitive ion channel  34.53 
 
 		 861 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1206  potassium efflux protein KefA  32.55 
 
 		 1098 aa  133  9e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  28.46 
 
 		 867 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3158  MscS mechanosensitive ion channel  30.26 
 
 		 420 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.633544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0145  MscS Mechanosensitive ion channel  31.72 
 
 		 795 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2257  MscS mechanosensitive ion channel  29.03 
 
 		 1110 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371999  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5300  MscS Mechanosensitive ion channel  30.21 
 
 		 909 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  30.5 
 
 		 1111 aa  131  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3826  MscS Mechanosensitive ion channel  35.55 
 
 		 444 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3172  MscS Mechanosensitive ion channel  31.82 
 
 		 784 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  29.34 
 
 		 1144 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  28.22 
 
 		 1115 aa  129  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1699  MscS mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 456 aa  129  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.254155  normal  0.22429 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3375  MscS Mechanosensitive ion channel  34.07 
 
 		 426 aa  129  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.126679  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1632  MscS mechanosensitive ion channel  34.38 
 
 		 877 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253181  normal  0.172693 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  28.22 
 
 		 1120 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3427  MscS mechanosensitive ion channel  29.72 
 
 		 428 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.259375  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3012  MscS mechanosensitive ion channel  35.57 
 
 		 297 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0500  potassium efflux protein KefA  28.22 
 
 		 1120 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527944  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0541  potassium efflux protein KefA  28.22 
 
 		 1120 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  29.96 
 
 		 435 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3151  potassium efflux protein KefA  28.22 
 
 		 1120 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.800258  normal  0.703774 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0555  potassium efflux protein KefA  28.22 
 
 		 1118 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364262  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>