More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0578 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0578  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 451 aa  891    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.605561  normal  0.183245 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3155  MscS Mechanosensitive ion channel  78.67 
 
 		 451 aa  719    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00105623  normal  0.0641339 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0811  small-conductance mechanosensitive channel protein  79.11 
 
 		 451 aa  703    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2555  MscS mechanosensitive ion channel  68.76 
 
 		 460 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2426  MscS mechanosensitive ion channel  68.31 
 
 		 460 aa  610  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610338  hitchhiker  0.0000133571 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0774  mechanosensitive ion channel family protein  70.11 
 
 		 450 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0975  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  71.13 
 
 		 450 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2238  mechanosensitive ion channel family protein  70.89 
 
 		 449 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1029  mechanosensitive ion channel family protein  70.89 
 
 		 450 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.165892  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1129  mechanosensitive ion channel family protein  70.89 
 
 		 449 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0971  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  70.89 
 
 		 450 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2654  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  70.89 
 
 		 450 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2108  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  70.89 
 
 		 450 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0787  MscS mechanosensitive ion channel  68.9 
 
 		 462 aa  568  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.0384222 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5840  MscS mechanosensitive ion channel  69.12 
 
 		 454 aa  555  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2533  MscS mechanosensitive ion channel  69.72 
 
 		 505 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.173747 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1897  MscS mechanosensitive ion channel  68.34 
 
 		 461 aa  542  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2508  MscS mechanosensitive ion channel  68.34 
 
 		 461 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38707  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2330  MscS Mechanosensitive ion channel  48.79 
 
 		 458 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194216  normal  0.152351 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2739  MscS mechanosensitive ion channel  50.23 
 
 		 457 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2719  MscS Mechanosensitive ion channel  49.33 
 
 		 457 aa  359  6e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2451  hypothetical protein  48.34 
 
 		 447 aa  349  7e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2876  MscS mechanosensitive ion channel  48.6 
 
 		 456 aa  348  1e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0307  MscS mechanosensitive ion channel  40.05 
 
 		 435 aa  298  9e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.381926  normal  0.0553472 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3158  MscS mechanosensitive ion channel  43.36 
 
 		 420 aa  296  6e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.633544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2389  MscS mechanosensitive ion channel  37.38 
 
 		 429 aa  266  4e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3144  MscS mechanosensitive ion channel  34.54 
 
 		 444 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2622  MscS mechanosensitive ion channel  38.26 
 
 		 412 aa  249  8e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1247  transmembrane protein  37.8 
 
 		 435 aa  248  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.072199  normal  0.308743 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2527  MscS mechanosensitive ion channel  41.77 
 
 		 427 aa  239  9e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1222  MscS mechanosensitive ion channel  42.66 
 
 		 451 aa  239  9e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.110808  normal  0.111103 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3375  MscS Mechanosensitive ion channel  35.75 
 
 		 426 aa  215  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.126679  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3066  MscS mechanosensitive ion channel  35.93 
 
 		 452 aa  213  3.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2167  MscS mechanosensitive ion channel  37.25 
 
 		 437 aa  210  4e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.880536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2595  hypothetical protein  37.23 
 
 		 422 aa  210  5e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0637117  normal  0.346925 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2300  MscS Mechanosensitive ion channel  36.94 
 
 		 427 aa  197  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2811  MscS mechanosensitive ion channel  36.55 
 
 		 427 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.231648 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2646  MscS mechanosensitive ion channel  37.55 
 
 		 322 aa  191  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0136  MscS mechanosensitive ion channel  30.86 
 
 		 451 aa  187  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1699  MscS mechanosensitive ion channel  32.61 
 
 		 456 aa  179  9e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.254155  normal  0.22429 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0757  MscS mechanosensitive ion channel  28.81 
 
 		 479 aa  168  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1816  mscS family protein  33.22 
 
 		 448 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.316092  normal  0.285124 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  36.48 
 
 		 435 aa  162  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0156  MscS mechanosensitive ion channel  33.22 
 
 		 437 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0421972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0057  MscS mechanosensitive ion channel  33.11 
 
 		 437 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2555  MscS mechanosensitive ion channel  35.77 
 
 		 321 aa  161  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6436  MscS Mechanosensitive ion channel  38.82 
 
 		 432 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.227593 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0579  MscS mechanosensitive ion channel  33.55 
 
 		 440 aa  160  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0872803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3427  MscS mechanosensitive ion channel  33.78 
 
 		 428 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.259375  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2507  MscS mechanosensitive ion channel  35.12 
 
 		 475 aa  155  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7380  mechanosensitive ion channel protein  30.56 
 
 		 439 aa  149  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2163  MscS Mechanosensitive ion channel  29.47 
 
 		 843 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257742  normal  0.626494 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  32.04 
 
 		 291 aa  147  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  39.22 
 
 		 298 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  32.41 
 
 		 840 aa  143  6e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  30.51 
 
 		 844 aa  142  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275364 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4436  MscS mechanosensitive ion channel  32.65 
 
 		 432 aa  141  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506103  normal  0.992693 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1934  mechanosensitive ion channel family protein  30.53 
 
 		 287 aa  140  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117079  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01467  mechanosensitive ion channel family protein  29.76 
 
 		 441 aa  140  4.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.619169  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  28.78 
 
 		 299 aa  139  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2010  MscS Mechanosensitive ion channel  28.94 
 
 		 447 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  31.72 
 
 		 825 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  30.14 
 
 		 806 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0935  MscS mechanosensitive ion channel  32.07 
 
 		 845 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  30.48 
 
 		 859 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2035  MscS Mechanosensitive ion channel  28.47 
 
 		 447 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.200455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  30.28 
 
 		 637 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2829  MscS mechanosensitive ion channel  29.96 
 
 		 294 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  34.68 
 
 		 864 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  34.07 
 
 		 860 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  38.69 
 
 		 843 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  31.85 
 
 		 830 aa  130  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0168  potassium efflux protein KefA  36.13 
 
 		 1110 aa  129  7.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3826  MscS Mechanosensitive ion channel  29.17 
 
 		 444 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  32.34 
 
 		 362 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  33.96 
 
 		 796 aa  129  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3172  MscS Mechanosensitive ion channel  29.57 
 
 		 784 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  35.5 
 
 		 1115 aa  129  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1606  MscS mechanosensitive ion channel  28.38 
 
 		 307 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.696801  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3407  MscS mechanosensitive ion channel  32.07 
 
 		 832 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1712  MscS mechanosensitive ion channel  29.24 
 
 		 291 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1587  MscS mechanosensitive ion channel  33.64 
 
 		 807 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  31.07 
 
 		 1144 aa  126  6e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1632  mechanosensitive ion channel family protein  32.13 
 
 		 782 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274059  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588  transporter, putative  30.65 
 
 		 1067 aa  125  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3778  MscS mechanosensitive ion channel  30.27 
 
 		 1072 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3904  MscS mechanosensitive ion channel  30.27 
 
 		 1072 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3721  MscS Mechanosensitive ion channel  30.27 
 
 		 1072 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3443  MscS mechanosensitive ion channel  30.65 
 
 		 1067 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0547  MscS mechanosensitive ion channel  30.27 
 
 		 1067 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  32.46 
 
 		 472 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3291  MscS mechanosensitive ion channel  30.65 
 
 		 1068 aa  124  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.563171  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1013  potassium efflux protein KefA  35.32 
 
 		 1128 aa  124  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0586  MscS mechanosensitive ion channel  30.27 
 
 		 1067 aa  123  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0875624 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0587  MscS mechanosensitive ion channel  30.27 
 
 		 1067 aa  124  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0226105 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3036  transporter, putative  31.3 
 
 		 1080 aa  124  5e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0415629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2065  MscS mechanosensitive ion channel  31.44 
 
 		 359 aa  123  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1447  MscS mechanosensitive ion channel  32.05 
 
 		 1166 aa  123  9e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  35 
 
 		 1120 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  30.92 
 
 		 847 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>