More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2422 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2730  potassium efflux system KEFA  48.15 
 
 		 825 aa  739    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668875  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 844 aa  1687    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275364 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2163  MscS Mechanosensitive ion channel  90.15 
 
 		 843 aa  1494    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257742  normal  0.626494 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  54.63 
 
 		 859 aa  840    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  43.38 
 
 		 867 aa  657    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3407  MscS mechanosensitive ion channel  32.72 
 
 		 832 aa  337  7.999999999999999e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  31.25 
 
 		 874 aa  335  3e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  32.78 
 
 		 825 aa  331  4e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0935  MscS mechanosensitive ion channel  32.3 
 
 		 845 aa  329  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3222  MscS mechanosensitive ion channel  29.46 
 
 		 866 aa  298  4e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0452  MscS Mechanosensitive ion channel  30.54 
 
 		 853 aa  291  3e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  29.68 
 
 		 860 aa  276  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  32.04 
 
 		 840 aa  273  1e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4343  MscS mechanosensitive ion channel  30.86 
 
 		 910 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4556  MscS Mechanosensitive ion channel  28.87 
 
 		 883 aa  270  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0198839  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3059  MscS mechanosensitive ion channel  28.44 
 
 		 879 aa  265  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0365719  normal  0.0542576 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5378  MscS Mechanosensitive ion channel  30.83 
 
 		 909 aa  262  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.287309  normal  0.723398 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4833  MscS mechanosensitive ion channel  31.75 
 
 		 947 aa  253  7e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.882104  normal  0.702316 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5300  MscS Mechanosensitive ion channel  31.48 
 
 		 909 aa  253  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1608  MscS mechanosensitive ion channel  29.44 
 
 		 868 aa  247  6.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03384  small-conductance mechanosensitive channel  29.05 
 
 		 803 aa  244  7e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.670806  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  42.63 
 
 		 796 aa  243  7.999999999999999e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  41.1 
 
 		 830 aa  238  4e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  43.42 
 
 		 849 aa  231  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  44.61 
 
 		 847 aa  226  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  44.61 
 
 		 847 aa  226  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0381  MscS mechanosensitive ion channel  28.61 
 
 		 815 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2528  MscS mechanosensitive ion channel  27.72 
 
 		 817 aa  223  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.290655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46240  hypothetical protein  28.87 
 
 		 807 aa  217  8e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.566889  normal  0.0303227 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3931  hypothetical protein  28.89 
 
 		 806 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.604151  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5154  MscS mechanosensitive ion channel  28.71 
 
 		 814 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0457644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2869  MscS Mechanosensitive ion channel  26.63 
 
 		 815 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266209  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4629  MscS mechanosensitive ion channel  28.32 
 
 		 832 aa  213  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5006  MscS mechanosensitive ion channel  27.71 
 
 		 814 aa  210  9e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4476  MscS mechanosensitive ion channel  28.18 
 
 		 799 aa  204  7e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.878237 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3758  MscS Mechanosensitive ion channel  26.68 
 
 		 809 aa  203  9e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.992907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4029  putative mechanosensitive ion channel  28.13 
 
 		 832 aa  202  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1404  MscS Mechanosensitive ion channel  27.17 
 
 		 817 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  40.08 
 
 		 806 aa  200  7.999999999999999e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2215  MscS mechanosensitive ion channel  29.31 
 
 		 820 aa  199  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.311174 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0740  MscS mechanosensitive ion channel  27.85 
 
 		 803 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2392  MscS mechanosensitive ion channel  28.35 
 
 		 794 aa  198  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.211304  hitchhiker  0.00331512 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0741  MscS mechanosensitive ion channel  27.6 
 
 		 803 aa  197  6e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3452  MscS mechanosensitive ion channel  28.33 
 
 		 816 aa  195  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00203474  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0707  MscS mechanosensitive ion channel  27.76 
 
 		 855 aa  194  6e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.441898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2264  mechanosensitive ion channel family protein  27.98 
 
 		 809 aa  194  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2125  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  27.98 
 
 		 809 aa  194  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0467602  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2070  mechanosensitive ion channel family protein  27.98 
 
 		 809 aa  194  8e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563687  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3100  MscS mechanosensitive ion channel  26.78 
 
 		 820 aa  193  9e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.416731  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5267  MscS mechanosensitive ion channel  26.78 
 
 		 820 aa  193  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.269062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4139  MscS Mechanosensitive ion channel  28.78 
 
 		 815 aa  192  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0986  mechanosensitive ion channel family protein  28.02 
 
 		 808 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.722323  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5470  MscS mechanosensitive ion channel  28.23 
 
 		 835 aa  191  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0145  MscS Mechanosensitive ion channel  37.99 
 
 		 795 aa  189  3e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1293  MscS Mechanosensitive ion channel  26.43 
 
 		 814 aa  187  5e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  39.15 
 
 		 298 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  39.62 
 
 		 842 aa  186  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  38.58 
 
 		 299 aa  184  7e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  39.7 
 
 		 291 aa  184  8.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3482  MscS mechanosensitive ion channel  35.48 
 
 		 813 aa  183  9.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144458  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1632  MscS mechanosensitive ion channel  38.19 
 
 		 877 aa  180  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253181  normal  0.172693 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1784  mechanosensitive ion channel family protein  32.42 
 
 		 891 aa  179  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1461  MscS Mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 785 aa  178  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2316  mechanosensitive ion channel family protein  29.77 
 
 		 773 aa  177  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3304  MscS Mechanosensitive ion channel  36.54 
 
 		 1235 aa  177  6e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0857  MscS mechanosensitive ion channel  25.48 
 
 		 840 aa  176  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  32.44 
 
 		 843 aa  174  5.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0168  potassium efflux protein KefA  41.23 
 
 		 1110 aa  174  6.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3172  MscS Mechanosensitive ion channel  39.47 
 
 		 784 aa  174  6.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0786  MscS Mechanosensitive ion channel  25.35 
 
 		 840 aa  172  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0384  mechanosensitive ion channel  34.15 
 
 		 752 aa  172  3e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  39.92 
 
 		 1144 aa  171  4e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3447  mechanosensitive ion channel family protein  37.2 
 
 		 816 aa  171  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.597927  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  34.18 
 
 		 864 aa  170  9e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  39.42 
 
 		 636 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3204  potassium efflux protein KefA  35.98 
 
 		 1120 aa  168  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2883  potassium efflux protein KefA  35.98 
 
 		 1120 aa  168  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0991479 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  36.92 
 
 		 981 aa  167  5e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3064  potassium efflux protein KefA  35.98 
 
 		 1120 aa  168  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1453  MscS mechanosensitive ion channel  38.37 
 
 		 1105 aa  167  6.9999999999999995e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  36.33 
 
 		 472 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  39.92 
 
 		 636 aa  165  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  42.15 
 
 		 685 aa  163  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1587  MscS mechanosensitive ion channel  39.45 
 
 		 807 aa  163  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0445  potassium efflux protein KefA  30.6 
 
 		 1117 aa  162  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.953711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  36.19 
 
 		 1111 aa  161  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1465  hypothetical protein  31.27 
 
 		 753 aa  161  5e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  35.16 
 
 		 1127 aa  160  6e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1903  MscS Mechanosensitive ion channel  37.93 
 
 		 303 aa  160  9e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3045  potassium efflux protein KefA  34.36 
 
 		 1133 aa  159  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  36.36 
 
 		 637 aa  158  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1518  hypothetical protein  29.33 
 
 		 732 aa  158  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1852  mechanosensitive ion channel family protein  27.24 
 
 		 804 aa  157  9e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0601787  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2151  MscS mechanosensitive ion channel  36.92 
 
 		 1158 aa  157  9e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3656  MscS mechanosensitive ion channel  31.03 
 
 		 856 aa  157  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.570339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3036  transporter, putative  32.95 
 
 		 1080 aa  155  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0415629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0581  potassium efflux protein KefA  33.7 
 
 		 1118 aa  155  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.467495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0538  potassium efflux protein KefA  33.7 
 
 		 1118 aa  155  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5117  potassium efflux protein KefA  35.91 
 
 		 1102 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0522  potassium efflux protein KefA  33.7 
 
 		 1118 aa  155  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97346  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>