More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0786 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0857  MscS mechanosensitive ion channel  99.29 
 
 		 840 aa  1610    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3656  MscS mechanosensitive ion channel  66.97 
 
 		 856 aa  954    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.570339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0786  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 840 aa  1623    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5470  MscS mechanosensitive ion channel  70.46 
 
 		 835 aa  1001    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4139  MscS Mechanosensitive ion channel  53.72 
 
 		 815 aa  694    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46240  hypothetical protein  39.75 
 
 		 807 aa  481  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.566889  normal  0.0303227 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3931  hypothetical protein  39.58 
 
 		 806 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.604151  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2215  MscS mechanosensitive ion channel  42.69 
 
 		 820 aa  473  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.311174 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1852  mechanosensitive ion channel family protein  37.66 
 
 		 804 aa  464  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0601787  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3549  MscS mechanosensitive ion channel  38.44 
 
 		 803 aa  458  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.566467  normal  0.27975 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0741  MscS mechanosensitive ion channel  37.21 
 
 		 803 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4476  MscS mechanosensitive ion channel  36.42 
 
 		 799 aa  452  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.878237 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0707  MscS mechanosensitive ion channel  37.2 
 
 		 855 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.441898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0740  MscS mechanosensitive ion channel  37.25 
 
 		 803 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1404  MscS Mechanosensitive ion channel  35.45 
 
 		 817 aa  419  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2869  MscS Mechanosensitive ion channel  36.2 
 
 		 815 aa  420  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266209  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0381  MscS mechanosensitive ion channel  35.83 
 
 		 815 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03384  small-conductance mechanosensitive channel  35.86 
 
 		 803 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.670806  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1293  MscS Mechanosensitive ion channel  35.44 
 
 		 814 aa  398  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5154  MscS mechanosensitive ion channel  35.09 
 
 		 814 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0457644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3452  MscS mechanosensitive ion channel  35.62 
 
 		 816 aa  393  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00203474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4629  MscS mechanosensitive ion channel  34.44 
 
 		 832 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5267  MscS mechanosensitive ion channel  35.96 
 
 		 820 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.269062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5006  MscS mechanosensitive ion channel  35.96 
 
 		 814 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3758  MscS Mechanosensitive ion channel  34.66 
 
 		 809 aa  389  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.992907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3100  MscS mechanosensitive ion channel  35.96 
 
 		 820 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.416731  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3482  MscS mechanosensitive ion channel  37.43 
 
 		 813 aa  382  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144458  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2392  MscS mechanosensitive ion channel  35.09 
 
 		 794 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.211304  hitchhiker  0.00331512 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4029  putative mechanosensitive ion channel  35.73 
 
 		 832 aa  375  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2528  MscS mechanosensitive ion channel  33.38 
 
 		 817 aa  372  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.290655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2070  mechanosensitive ion channel family protein  36.45 
 
 		 809 aa  357  6.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563687  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2316  mechanosensitive ion channel family protein  36.24 
 
 		 773 aa  356  8.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2125  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  36.31 
 
 		 809 aa  354  4e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0467602  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2264  mechanosensitive ion channel family protein  36.31 
 
 		 809 aa  354  4e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0986  mechanosensitive ion channel family protein  36.45 
 
 		 808 aa  350  6e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.722323  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4556  MscS Mechanosensitive ion channel  33.42 
 
 		 883 aa  331  4e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0198839  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3059  MscS mechanosensitive ion channel  33.89 
 
 		 879 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0365719  normal  0.0542576 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3222  MscS mechanosensitive ion channel  31.68 
 
 		 866 aa  322  1.9999999999999998e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0452  MscS Mechanosensitive ion channel  30.28 
 
 		 853 aa  296  1e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4343  MscS mechanosensitive ion channel  31.22 
 
 		 910 aa  291  3e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3407  MscS mechanosensitive ion channel  31.99 
 
 		 832 aa  289  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5300  MscS Mechanosensitive ion channel  32.61 
 
 		 909 aa  287  5e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4833  MscS mechanosensitive ion channel  32.61 
 
 		 947 aa  287  5e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.882104  normal  0.702316 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5378  MscS Mechanosensitive ion channel  31.44 
 
 		 909 aa  278  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.287309  normal  0.723398 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  29.82 
 
 		 874 aa  275  4.0000000000000004e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0935  MscS mechanosensitive ion channel  30.13 
 
 		 845 aa  261  3e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  27.33 
 
 		 867 aa  250  8e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  28.97 
 
 		 859 aa  250  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  31.16 
 
 		 860 aa  247  8e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  29.55 
 
 		 825 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2730  potassium efflux system KEFA  26.85 
 
 		 825 aa  227  8e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668875  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  26.84 
 
 		 844 aa  195  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275364 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  34.08 
 
 		 830 aa  194  8e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2163  MscS Mechanosensitive ion channel  25.12 
 
 		 843 aa  187  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257742  normal  0.626494 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  26.61 
 
 		 840 aa  187  7e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1608  MscS mechanosensitive ion channel  26.28 
 
 		 868 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  37.35 
 
 		 796 aa  174  6.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  32.99 
 
 		 849 aa  157  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  34.25 
 
 		 806 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  33.08 
 
 		 847 aa  154  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  33.08 
 
 		 847 aa  154  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1784  mechanosensitive ion channel family protein  32.95 
 
 		 891 aa  152  4e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1461  MscS Mechanosensitive ion channel  32.95 
 
 		 785 aa  151  5e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2151  MscS mechanosensitive ion channel  39.25 
 
 		 1158 aa  150  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0421  hypothetical protein  33.88 
 
 		 1115 aa  148  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.693078  hitchhiker  0.0000017841 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3756  hypothetical protein  36.57 
 
 		 1107 aa  146  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3934  hypothetical protein  36.11 
 
 		 1107 aa  145  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0384  mechanosensitive ion channel  33.59 
 
 		 752 aa  144  7e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0384  hypothetical protein  34.73 
 
 		 1107 aa  144  9e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.207125  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04029  predicted mechanosensitive channel  35.65 
 
 		 1107 aa  143  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.475668  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3831  MscS Mechanosensitive ion channel  35.65 
 
 		 1107 aa  143  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.915765  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4630  hypothetical protein  35.65 
 
 		 1107 aa  143  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.250026  normal  0.0442574 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4401  hypothetical protein  35.65 
 
 		 1107 aa  143  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.199255  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4716  hypothetical protein  35.65 
 
 		 1107 aa  143  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00612141  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5675  hypothetical protein  35.65 
 
 		 1107 aa  143  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00234961  normal  0.548719 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4691  hypothetical protein  33.88 
 
 		 1107 aa  143  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00421616  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03991  hypothetical protein  35.65 
 
 		 1107 aa  143  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.391275  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3851  hypothetical protein  35.65 
 
 		 1107 aa  143  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332968 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2883  potassium efflux protein KefA  33.74 
 
 		 1120 aa  142  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0991479 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3064  potassium efflux protein KefA  33.74 
 
 		 1120 aa  142  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3204  potassium efflux protein KefA  33.74 
 
 		 1120 aa  142  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4708  hypothetical protein  35.21 
 
 		 1108 aa  142  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.749013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4765  hypothetical protein  35.21 
 
 		 1108 aa  142  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.514219  normal  0.17769 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0473  hypothetical protein  36.11 
 
 		 1104 aa  142  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4744  hypothetical protein  35.21 
 
 		 1108 aa  142  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4625  hypothetical protein  35.21 
 
 		 1108 aa  142  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.288253  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4616  hypothetical protein  35.21 
 
 		 1108 aa  142  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.115019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  36.32 
 
 		 1115 aa  140  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45100  potassium efflux protein KefA  36.79 
 
 		 1117 aa  139  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.534635  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0345  hypothetical protein  34.27 
 
 		 1103 aa  138  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.742298  unclonable  0.00000473028 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3304  MscS Mechanosensitive ion channel  31.3 
 
 		 1235 aa  138  5e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0522  potassium efflux protein KefA  30.12 
 
 		 1118 aa  138  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0538  potassium efflux protein KefA  30.12 
 
 		 1118 aa  137  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1465  hypothetical protein  27.64 
 
 		 753 aa  137  9e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0581  potassium efflux protein KefA  29.82 
 
 		 1118 aa  136  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.467495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0528  potassium efflux protein KefA  29.82 
 
 		 1120 aa  136  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00416  fused conserved protein  32.45 
 
 		 1120 aa  136  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0500  potassium efflux protein KefA  32.45 
 
 		 1120 aa  136  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527944  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5759  potassium efflux protein KefA  33.89 
 
 		 1118 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738971  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3151  potassium efflux protein KefA  32.45 
 
 		 1120 aa  136  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.800258  normal  0.703774 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>