More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3407 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0935  MscS mechanosensitive ion channel  83.01 
 
 		 845 aa  1288    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3407  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 832 aa  1630    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  48.81 
 
 		 874 aa  730    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4556  MscS Mechanosensitive ion channel  34.95 
 
 		 883 aa  391  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0198839  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3059  MscS mechanosensitive ion channel  34.34 
 
 		 879 aa  388  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0365719  normal  0.0542576 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4343  MscS mechanosensitive ion channel  34.49 
 
 		 910 aa  379  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5378  MscS Mechanosensitive ion channel  35.39 
 
 		 909 aa  362  1e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.287309  normal  0.723398 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5300  MscS Mechanosensitive ion channel  34.59 
 
 		 909 aa  360  8e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4833  MscS mechanosensitive ion channel  34.59 
 
 		 947 aa  360  8e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.882104  normal  0.702316 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  32.62 
 
 		 859 aa  356  1e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3222  MscS mechanosensitive ion channel  32.86 
 
 		 866 aa  353  7e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  32.74 
 
 		 844 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275364 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2163  MscS Mechanosensitive ion channel  31.31 
 
 		 843 aa  335  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257742  normal  0.626494 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 		 867 aa  334  3e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0452  MscS Mechanosensitive ion channel  33.64 
 
 		 853 aa  332  2e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  32.44 
 
 		 825 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  31.73 
 
 		 860 aa  311  5e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2730  potassium efflux system KEFA  30.26 
 
 		 825 aa  300  7e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668875  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  31.18 
 
 		 840 aa  282  2e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3931  hypothetical protein  31.28 
 
 		 806 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.604151  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46240  hypothetical protein  31.44 
 
 		 807 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.566889  normal  0.0303227 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5470  MscS mechanosensitive ion channel  29.54 
 
 		 835 aa  266  8.999999999999999e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2392  MscS mechanosensitive ion channel  30.17 
 
 		 794 aa  266  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.211304  hitchhiker  0.00331512 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4476  MscS mechanosensitive ion channel  29.84 
 
 		 799 aa  265  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.878237 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0707  MscS mechanosensitive ion channel  30.35 
 
 		 855 aa  264  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.441898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03384  small-conductance mechanosensitive channel  29.31 
 
 		 803 aa  263  1e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.670806  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0786  MscS Mechanosensitive ion channel  29.76 
 
 		 840 aa  262  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0857  MscS mechanosensitive ion channel  29.91 
 
 		 840 aa  261  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0740  MscS mechanosensitive ion channel  30.12 
 
 		 803 aa  260  7e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0741  MscS mechanosensitive ion channel  29.79 
 
 		 803 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2215  MscS mechanosensitive ion channel  31.16 
 
 		 820 aa  256  8e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.311174 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2528  MscS mechanosensitive ion channel  28.46 
 
 		 817 aa  250  7e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.290655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3758  MscS Mechanosensitive ion channel  29.49 
 
 		 809 aa  249  1e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.992907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3656  MscS mechanosensitive ion channel  28.85 
 
 		 856 aa  249  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.570339  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1852  mechanosensitive ion channel family protein  29.38 
 
 		 804 aa  243  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0601787  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4139  MscS Mechanosensitive ion channel  29.83 
 
 		 815 aa  240  8e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5267  MscS mechanosensitive ion channel  31.05 
 
 		 820 aa  239  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.269062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3100  MscS mechanosensitive ion channel  31.05 
 
 		 820 aa  239  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.416731  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5006  MscS mechanosensitive ion channel  31 
 
 		 814 aa  239  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5154  MscS mechanosensitive ion channel  30.51 
 
 		 814 aa  238  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0457644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3549  MscS mechanosensitive ion channel  29.51 
 
 		 803 aa  238  4e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.566467  normal  0.27975 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1293  MscS Mechanosensitive ion channel  28.75 
 
 		 814 aa  238  5.0000000000000005e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0986  mechanosensitive ion channel family protein  32.23 
 
 		 808 aa  237  6e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.722323  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2070  mechanosensitive ion channel family protein  32.18 
 
 		 809 aa  237  6e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563687  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2264  mechanosensitive ion channel family protein  32.18 
 
 		 809 aa  237  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2125  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  32.18 
 
 		 809 aa  237  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0467602  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4629  MscS mechanosensitive ion channel  30.63 
 
 		 832 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0381  MscS mechanosensitive ion channel  29.77 
 
 		 815 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  28.73 
 
 		 830 aa  234  4.0000000000000004e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2316  mechanosensitive ion channel family protein  31.8 
 
 		 773 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1608  MscS mechanosensitive ion channel  30.04 
 
 		 868 aa  233  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2869  MscS Mechanosensitive ion channel  27.99 
 
 		 815 aa  229  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266209  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1404  MscS Mechanosensitive ion channel  27.79 
 
 		 817 aa  226  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  39.23 
 
 		 796 aa  226  1e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3452  MscS mechanosensitive ion channel  30.52 
 
 		 816 aa  225  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00203474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3482  MscS mechanosensitive ion channel  31.71 
 
 		 813 aa  223  8e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144458  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4029  putative mechanosensitive ion channel  28.54 
 
 		 832 aa  220  8.999999999999998e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  40.13 
 
 		 849 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  42.09 
 
 		 847 aa  214  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  42.09 
 
 		 847 aa  214  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  37.54 
 
 		 806 aa  210  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  40.84 
 
 		 299 aa  204  5e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1632  MscS mechanosensitive ion channel  38.36 
 
 		 877 aa  201  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253181  normal  0.172693 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0145  MscS Mechanosensitive ion channel  38.46 
 
 		 795 aa  196  2e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  38.38 
 
 		 843 aa  191  4e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0384  mechanosensitive ion channel  30.39 
 
 		 752 aa  189  3e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1465  hypothetical protein  31.35 
 
 		 753 aa  187  8e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3172  MscS Mechanosensitive ion channel  39.41 
 
 		 784 aa  185  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1461  MscS Mechanosensitive ion channel  36.95 
 
 		 785 aa  184  5.0000000000000004e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1784  mechanosensitive ion channel family protein  36.95 
 
 		 891 aa  184  6e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  39.09 
 
 		 981 aa  179  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1587  MscS mechanosensitive ion channel  35.25 
 
 		 807 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  36.36 
 
 		 842 aa  176  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3447  mechanosensitive ion channel family protein  40.47 
 
 		 816 aa  173  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.597927  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  31.67 
 
 		 864 aa  170  9e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  36.6 
 
 		 472 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0101  putative AefA  41.98 
 
 		 338 aa  167  5.9999999999999996e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.0000000159695  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1518  hypothetical protein  30.28 
 
 		 732 aa  167  8e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  35.27 
 
 		 1144 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1903  MscS Mechanosensitive ion channel  39.62 
 
 		 303 aa  164  6e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  34.93 
 
 		 1111 aa  164  7e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0168  potassium efflux protein KefA  37.14 
 
 		 1110 aa  161  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  35.54 
 
 		 685 aa  161  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  35.69 
 
 		 1127 aa  161  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  34.7 
 
 		 291 aa  160  7e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  35.47 
 
 		 298 aa  159  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  31.86 
 
 		 637 aa  160  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2646  MscS mechanosensitive ion channel  31.65 
 
 		 322 aa  159  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1453  MscS mechanosensitive ion channel  37.21 
 
 		 1105 aa  159  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66400  potassium efflux protein KefA  34.1 
 
 		 1118 aa  158  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5759  potassium efflux protein KefA  33.09 
 
 		 1118 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738971  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0156  MscS mechanosensitive ion channel  33.83 
 
 		 437 aa  157  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0421972  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3304  MscS Mechanosensitive ion channel  34.13 
 
 		 1235 aa  156  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1599  MscS Mechanosensitive ion channel  35.34 
 
 		 862 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7380  mechanosensitive ion channel protein  30.97 
 
 		 439 aa  156  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3390  MscS mechanosensitive ion channel  33.77 
 
 		 861 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0445  potassium efflux protein KefA  31.61 
 
 		 1117 aa  155  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.953711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0579  MscS mechanosensitive ion channel  30.87 
 
 		 440 aa  154  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0872803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  36.02 
 
 		 636 aa  152  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0501  potassium efflux protein KefA  33.46 
 
 		 1134 aa  152  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>