More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0209 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 685 aa  1387    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  41.08 
 
 		 636 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  41.08 
 
 		 636 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4892  MscS Mechanosensitive ion channel  41.22 
 
 		 560 aa  340  5.9999999999999996e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0812  MscS mechanosensitive ion channel  33.28 
 
 		 643 aa  337  5.999999999999999e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.459246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  46.34 
 
 		 637 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  40.35 
 
 		 299 aa  225  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  47.73 
 
 		 806 aa  218  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  42.8 
 
 		 840 aa  208  3e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  44.68 
 
 		 291 aa  204  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  41.83 
 
 		 843 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  36.52 
 
 		 825 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  42.58 
 
 		 298 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1903  MscS Mechanosensitive ion channel  40.71 
 
 		 303 aa  195  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3447  mechanosensitive ion channel family protein  44.59 
 
 		 816 aa  192  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.597927  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  42.41 
 
 		 874 aa  189  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 		 796 aa  189  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  41.18 
 
 		 472 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0101  putative AefA  44.67 
 
 		 338 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.0000000159695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0664  cyclic nucleotide-binding  44.75 
 
 		 449 aa  186  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0101822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2151  MscS mechanosensitive ion channel  39.08 
 
 		 1158 aa  186  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  36.27 
 
 		 842 aa  185  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  40.27 
 
 		 981 aa  184  6e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1587  MscS mechanosensitive ion channel  43.84 
 
 		 807 aa  179  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  33.1 
 
 		 1111 aa  178  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3172  MscS Mechanosensitive ion channel  41.44 
 
 		 784 aa  178  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0384  mechanosensitive ion channel  37.17 
 
 		 752 aa  178  4e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3910  hypothetical protein  43.64 
 
 		 301 aa  178  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2646  MscS mechanosensitive ion channel  40 
 
 		 322 aa  176  9e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0145  MscS Mechanosensitive ion channel  39.64 
 
 		 795 aa  176  9e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.584574 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00416  fused conserved protein  32.46 
 
 		 1120 aa  174  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0555  potassium efflux protein KefA  32.46 
 
 		 1118 aa  174  5e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364262  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  32.46 
 
 		 1120 aa  174  5e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0508  potassium efflux protein KefA  32.46 
 
 		 1120 aa  174  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000540502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0500  potassium efflux protein KefA  32.46 
 
 		 1120 aa  174  5e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527944  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0397  potassium efflux protein KefA  32.46 
 
 		 1120 aa  174  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00421  hypothetical protein  32.46 
 
 		 1120 aa  174  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0541  potassium efflux protein KefA  32.46 
 
 		 1120 aa  174  5e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3151  potassium efflux protein KefA  32.46 
 
 		 1120 aa  174  5e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.800258  normal  0.703774 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0581  potassium efflux protein KefA  32.46 
 
 		 1118 aa  173  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.467495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0538  potassium efflux protein KefA  32.46 
 
 		 1118 aa  173  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0519  potassium efflux protein KefA  32.46 
 
 		 1120 aa  173  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  41.41 
 
 		 864 aa  173  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0528  potassium efflux protein KefA  32.46 
 
 		 1120 aa  173  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0522  potassium efflux protein KefA  32.46 
 
 		 1118 aa  173  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97346  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45100  potassium efflux protein KefA  34.57 
 
 		 1117 aa  172  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.534635  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  32.46 
 
 		 1115 aa  172  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1784  mechanosensitive ion channel family protein  32.01 
 
 		 891 aa  169  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  31.91 
 
 		 867 aa  169  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0445  potassium efflux protein KefA  34.62 
 
 		 1117 aa  167  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.953711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1461  MscS Mechanosensitive ion channel  32.01 
 
 		 785 aa  167  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3012  MscS mechanosensitive ion channel  41.41 
 
 		 297 aa  167  5e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1453  MscS mechanosensitive ion channel  38.99 
 
 		 1105 aa  167  5e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1447  MscS mechanosensitive ion channel  32.26 
 
 		 1166 aa  167  6.9999999999999995e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3826  MscS Mechanosensitive ion channel  42.45 
 
 		 444 aa  166  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2257  MscS mechanosensitive ion channel  38.46 
 
 		 1110 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371999  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3390  MscS mechanosensitive ion channel  38.97 
 
 		 861 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1632  MscS mechanosensitive ion channel  39.33 
 
 		 877 aa  166  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253181  normal  0.172693 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3304  MscS Mechanosensitive ion channel  33.59 
 
 		 1235 aa  166  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1934  mechanosensitive ion channel family protein  32.98 
 
 		 287 aa  166  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117079  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1206  potassium efflux protein KefA  38.12 
 
 		 1098 aa  166  2.0000000000000002e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1465  hypothetical protein  40 
 
 		 753 aa  165  3e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  37.89 
 
 		 847 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3045  potassium efflux protein KefA  32.87 
 
 		 1133 aa  164  5.0000000000000005e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  40.5 
 
 		 847 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3204  potassium efflux protein KefA  36.82 
 
 		 1120 aa  164  7e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2163  MscS Mechanosensitive ion channel  41.3 
 
 		 843 aa  164  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257742  normal  0.626494 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  42.15 
 
 		 844 aa  164  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275364 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2883  potassium efflux protein KefA  36.82 
 
 		 1120 aa  164  7e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0991479 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3064  potassium efflux protein KefA  36.82 
 
 		 1120 aa  164  7e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  35.25 
 
 		 830 aa  163  8.000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0168  potassium efflux protein KefA  36.92 
 
 		 1110 aa  163  9e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1632  mechanosensitive ion channel family protein  39.38 
 
 		 782 aa  162  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274059  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1130  potassium efflux protein KefA  38.18 
 
 		 1130 aa  163  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000811569 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  38.57 
 
 		 849 aa  162  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3407  MscS mechanosensitive ion channel  35.54 
 
 		 832 aa  161  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  34.19 
 
 		 1144 aa  161  4e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5024  potassium efflux system protein KefA, putative  35.87 
 
 		 1134 aa  160  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0501  potassium efflux protein KefA  35.87 
 
 		 1134 aa  160  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66400  potassium efflux protein KefA  33.73 
 
 		 1118 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3551  MscS mechanosensitive ion channel  33.64 
 
 		 1062 aa  159  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0935  MscS mechanosensitive ion channel  35.78 
 
 		 845 aa  158  3e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5759  potassium efflux protein KefA  34.78 
 
 		 1118 aa  158  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738971  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2035  MscS Mechanosensitive ion channel  38.86 
 
 		 447 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.200455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2829  MscS mechanosensitive ion channel  38.61 
 
 		 294 aa  157  6e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0786  MscS mechanosensitive ion channel  32.87 
 
 		 1066 aa  157  6e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.213544  hitchhiker  0.000495101 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0399  potassium efflux protein KefA  36.53 
 
 		 1102 aa  157  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  33.19 
 
 		 1127 aa  157  7e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5117  potassium efflux protein KefA  36.32 
 
 		 1102 aa  157  8e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1013  potassium efflux protein KefA  39.06 
 
 		 1128 aa  156  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0586  MscS mechanosensitive ion channel  31.39 
 
 		 1067 aa  156  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0875624 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  37.75 
 
 		 435 aa  155  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0587  MscS mechanosensitive ion channel  32.24 
 
 		 1067 aa  155  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0226105 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588  transporter, putative  31.78 
 
 		 1067 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2010  MscS Mechanosensitive ion channel  38.39 
 
 		 447 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3443  MscS mechanosensitive ion channel  31.78 
 
 		 1067 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0555  MscS mechanosensitive ion channel  31.65 
 
 		 1060 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0475901  normal  0.179203 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3144  MscS mechanosensitive ion channel  30.65 
 
 		 444 aa  154  7e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  34 
 
 		 859 aa  153  8.999999999999999e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3778  MscS mechanosensitive ion channel  30.84 
 
 		 1072 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>