More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2148 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  99.65 
 
 		 847 aa  1672    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  83.33 
 
 		 849 aa  1333    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  100 
 
 		 847 aa  1678    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  49.59 
 
 		 840 aa  674    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  44.26 
 
 		 830 aa  613  9.999999999999999e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  43.31 
 
 		 796 aa  555  1e-156  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  31.61 
 
 		 825 aa  263  1e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  38.07 
 
 		 867 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  42.46 
 
 		 859 aa  240  6.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  41.01 
 
 		 874 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  40.57 
 
 		 844 aa  233  8.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275364 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2163  MscS Mechanosensitive ion channel  44.57 
 
 		 843 aa  231  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257742  normal  0.626494 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3407  MscS mechanosensitive ion channel  30.99 
 
 		 832 aa  228  4e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  41.07 
 
 		 860 aa  223  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1784  mechanosensitive ion channel family protein  40.43 
 
 		 891 aa  222  3e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1461  MscS Mechanosensitive ion channel  40.43 
 
 		 785 aa  222  3e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3059  MscS mechanosensitive ion channel  38.06 
 
 		 879 aa  219  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0365719  normal  0.0542576 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2730  potassium efflux system KEFA  41.11 
 
 		 825 aa  219  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.668875  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3222  MscS mechanosensitive ion channel  43.42 
 
 		 866 aa  216  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0935  MscS mechanosensitive ion channel  40.8 
 
 		 845 aa  215  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0452  MscS Mechanosensitive ion channel  44.06 
 
 		 853 aa  213  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5378  MscS Mechanosensitive ion channel  43.87 
 
 		 909 aa  209  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.287309  normal  0.723398 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4833  MscS mechanosensitive ion channel  42.12 
 
 		 947 aa  208  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.882104  normal  0.702316 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1608  MscS mechanosensitive ion channel  39.04 
 
 		 868 aa  208  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5300  MscS Mechanosensitive ion channel  42.12 
 
 		 909 aa  208  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  38.64 
 
 		 806 aa  206  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4343  MscS mechanosensitive ion channel  41.26 
 
 		 910 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0384  mechanosensitive ion channel  38.95 
 
 		 752 aa  191  5e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1632  MscS mechanosensitive ion channel  41.83 
 
 		 877 aa  186  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253181  normal  0.172693 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  38.61 
 
 		 299 aa  185  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3304  MscS Mechanosensitive ion channel  35.42 
 
 		 1235 aa  180  9e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3447  mechanosensitive ion channel family protein  37.69 
 
 		 816 aa  178  4e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.597927  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1465  hypothetical protein  33.89 
 
 		 753 aa  177  9e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1587  MscS mechanosensitive ion channel  42.92 
 
 		 807 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  38.6 
 
 		 472 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  37.26 
 
 		 842 aa  174  5e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03384  small-conductance mechanosensitive channel  36.72 
 
 		 803 aa  173  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.670806  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  40.57 
 
 		 864 aa  173  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  39.76 
 
 		 981 aa  172  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  35.69 
 
 		 843 aa  170  8e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1518  hypothetical protein  34.24 
 
 		 732 aa  170  9e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  34.28 
 
 		 1144 aa  170  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3758  MscS Mechanosensitive ion channel  36.94 
 
 		 809 aa  169  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.992907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  37.65 
 
 		 636 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3172  MscS Mechanosensitive ion channel  39.15 
 
 		 784 aa  169  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  37.65 
 
 		 636 aa  168  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0145  MscS Mechanosensitive ion channel  36.61 
 
 		 795 aa  168  5e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0522  potassium efflux protein KefA  36.69 
 
 		 1118 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0519  potassium efflux protein KefA  36.69 
 
 		 1120 aa  167  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  32.7 
 
 		 1115 aa  167  5.9999999999999996e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0528  potassium efflux protein KefA  36.69 
 
 		 1120 aa  167  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0538  potassium efflux protein KefA  36.69 
 
 		 1118 aa  167  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0581  potassium efflux protein KefA  33.66 
 
 		 1118 aa  167  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.467495  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00416  fused conserved protein  36.22 
 
 		 1120 aa  167  8e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  36.22 
 
 		 1120 aa  167  8e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3151  potassium efflux protein KefA  36.22 
 
 		 1120 aa  167  8e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.800258  normal  0.703774 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0541  potassium efflux protein KefA  36.22 
 
 		 1120 aa  167  8e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00421  hypothetical protein  36.22 
 
 		 1120 aa  167  8e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0397  potassium efflux protein KefA  36.22 
 
 		 1120 aa  167  9e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0500  potassium efflux protein KefA  36.22 
 
 		 1120 aa  167  9e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527944  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0508  potassium efflux protein KefA  36.22 
 
 		 1120 aa  167  9e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000540502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0555  potassium efflux protein KefA  36.22 
 
 		 1118 aa  167  9e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3931  hypothetical protein  36.03 
 
 		 806 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.604151  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5024  potassium efflux system protein KefA, putative  33.83 
 
 		 1134 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  34.75 
 
 		 1111 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0501  potassium efflux protein KefA  33.83 
 
 		 1134 aa  165  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0445  potassium efflux protein KefA  34.43 
 
 		 1117 aa  165  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.953711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2883  potassium efflux protein KefA  38.49 
 
 		 1120 aa  165  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0991479 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3204  potassium efflux protein KefA  38.49 
 
 		 1120 aa  165  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3064  potassium efflux protein KefA  38.49 
 
 		 1120 aa  165  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46240  hypothetical protein  35.66 
 
 		 807 aa  165  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.566889  normal  0.0303227 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1447  MscS mechanosensitive ion channel  30.87 
 
 		 1166 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  37.89 
 
 		 685 aa  164  6e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3045  potassium efflux protein KefA  34.87 
 
 		 1133 aa  163  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  37.88 
 
 		 291 aa  162  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  35.38 
 
 		 298 aa  160  8e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  36.12 
 
 		 637 aa  160  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0168  potassium efflux protein KefA  37.39 
 
 		 1110 aa  159  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2151  MscS mechanosensitive ion channel  35.68 
 
 		 1158 aa  159  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4139  MscS Mechanosensitive ion channel  29.25 
 
 		 815 aa  157  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1013  potassium efflux protein KefA  33.45 
 
 		 1128 aa  156  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1130  potassium efflux protein KefA  35.83 
 
 		 1130 aa  156  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000811569 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0399  potassium efflux protein KefA  32.79 
 
 		 1102 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2257  MscS mechanosensitive ion channel  34 
 
 		 1110 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371999  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5117  potassium efflux protein KefA  33.33 
 
 		 1102 aa  155  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0741  MscS mechanosensitive ion channel  34.3 
 
 		 803 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0707  MscS mechanosensitive ion channel  35.29 
 
 		 855 aa  154  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.441898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0740  MscS mechanosensitive ion channel  35.29 
 
 		 803 aa  153  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1206  potassium efflux protein KefA  33.85 
 
 		 1098 aa  152  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1903  MscS Mechanosensitive ion channel  37.74 
 
 		 303 aa  152  3e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  32.14 
 
 		 1127 aa  152  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45100  potassium efflux protein KefA  32.12 
 
 		 1117 aa  151  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.534635  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3390  MscS mechanosensitive ion channel  37.07 
 
 		 861 aa  151  6e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0555  MscS mechanosensitive ion channel  33.21 
 
 		 1060 aa  150  6e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0475901  normal  0.179203 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4476  MscS mechanosensitive ion channel  34.67 
 
 		 799 aa  151  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.878237 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2215  MscS mechanosensitive ion channel  33.68 
 
 		 820 aa  151  6e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.311174 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3036  transporter, putative  33.72 
 
 		 1080 aa  150  7e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0415629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3443  MscS mechanosensitive ion channel  32.22 
 
 		 1067 aa  150  8e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4892  MscS Mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 		 560 aa  150  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2646  MscS mechanosensitive ion channel  32.97 
 
 		 322 aa  150  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>