More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1206 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00416  fused conserved protein  38.34 
 
 
1120 aa  698    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  38.34 
 
 
1120 aa  698    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3204  potassium efflux protein KefA  36.73 
 
 
1120 aa  654    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5067  potassium efflux protein KefA  37.05 
 
 
1102 aa  647    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1013  potassium efflux protein KefA  38.22 
 
 
1128 aa  660    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4940  potassium efflux protein KefA  37.4 
 
 
1102 aa  647    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310149  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0538  potassium efflux protein KefA  36.74 
 
 
1118 aa  661    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0508  potassium efflux protein KefA  38.34 
 
 
1120 aa  697    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000540502  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0519  potassium efflux protein KefA  36.74 
 
 
1120 aa  662    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2883  potassium efflux protein KefA  36.73 
 
 
1120 aa  654    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0991479 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0445  potassium efflux protein KefA  36.84 
 
 
1117 aa  642    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.953711  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00421  hypothetical protein  38.34 
 
 
1120 aa  698    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3045  potassium efflux protein KefA  36.79 
 
 
1133 aa  685    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3151  potassium efflux protein KefA  38.34 
 
 
1120 aa  698    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.800258  normal  0.703774 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5117  potassium efflux protein KefA  37.05 
 
 
1102 aa  668    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666166  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0500  potassium efflux protein KefA  38.34 
 
 
1120 aa  698    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527944  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0581  potassium efflux protein KefA  36.74 
 
 
1118 aa  661    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.467495  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  37.05 
 
 
1111 aa  647    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0555  potassium efflux protein KefA  38.34 
 
 
1118 aa  698    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364262  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0397  potassium efflux protein KefA  38.34 
 
 
1120 aa  697    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3064  potassium efflux protein KefA  36.73 
 
 
1120 aa  654    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  37.43 
 
 
1115 aa  677    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0522  potassium efflux protein KefA  36.74 
 
 
1118 aa  662    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97346  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1206  potassium efflux protein KefA  100 
 
 
1098 aa  2215    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0541  potassium efflux protein KefA  38.34 
 
 
1120 aa  698    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0528  potassium efflux protein KefA  36.74 
 
 
1120 aa  661    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0399  potassium efflux protein KefA  38.06 
 
 
1102 aa  654    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5024  potassium efflux system protein KefA, putative  35.34 
 
 
1134 aa  615  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0501  potassium efflux protein KefA  36.01 
 
 
1134 aa  615  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1130  potassium efflux protein KefA  35.44 
 
 
1130 aa  612  1e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000811569 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5759  potassium efflux protein KefA  36.94 
 
 
1118 aa  601  1e-170  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738971  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45100  potassium efflux protein KefA  35.83 
 
 
1117 aa  593  1e-168  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.534635  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66400  potassium efflux protein KefA  37.04 
 
 
1118 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0168  potassium efflux protein KefA  35.05 
 
 
1110 aa  535  1e-150  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1447  MscS mechanosensitive ion channel  32.85 
 
 
1166 aa  528  1e-148  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3390  MscS mechanosensitive ion channel  30.71 
 
 
861 aa  373  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  29.17 
 
 
1127 aa  362  2e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2257  MscS mechanosensitive ion channel  34.12 
 
 
1110 aa  362  2e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371999  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3036  transporter, putative  30.59 
 
 
1080 aa  351  5e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0415629  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2151  MscS mechanosensitive ion channel  27.14 
 
 
1158 aa  340  9.999999999999999e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0586  MscS mechanosensitive ion channel  29.74 
 
 
1067 aa  338  3.9999999999999995e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0875624 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  31.83 
 
 
1144 aa  337  7.999999999999999e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0587  MscS mechanosensitive ion channel  29.74 
 
 
1067 aa  335  4e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0226105 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3778  MscS mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 
1072 aa  334  6e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3904  MscS mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 
1072 aa  334  6e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3721  MscS Mechanosensitive ion channel  30.77 
 
 
1072 aa  334  7.000000000000001e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0421  hypothetical protein  26.59 
 
 
1115 aa  334  7.000000000000001e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.693078  hitchhiker  0.0000017841 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0547  MscS mechanosensitive ion channel  30.5 
 
 
1067 aa  333  8e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3443  MscS mechanosensitive ion channel  29.62 
 
 
1067 aa  332  2e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588  transporter, putative  32.18 
 
 
1067 aa  331  4e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3291  MscS mechanosensitive ion channel  29.73 
 
 
1068 aa  331  6e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.563171  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3934  hypothetical protein  26.93 
 
 
1107 aa  330  1.0000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3321  MscS mechanosensitive ion channel  27.9 
 
 
1078 aa  324  5e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.660513  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0786  MscS mechanosensitive ion channel  29.73 
 
 
1066 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.213544  hitchhiker  0.000495101 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3756  hypothetical protein  27.27 
 
 
1107 aa  322  3e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0555  MscS mechanosensitive ion channel  28.37 
 
 
1060 aa  319  2e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0475901  normal  0.179203 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4182  MscS mechanosensitive ion channel  37.2 
 
 
1070 aa  315  2.9999999999999996e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0345  hypothetical protein  25.67 
 
 
1103 aa  308  3e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.742298  unclonable  0.00000473028 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3851  hypothetical protein  26.79 
 
 
1107 aa  308  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332968 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5675  hypothetical protein  25.84 
 
 
1107 aa  308  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00234961  normal  0.548719 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04029  predicted mechanosensitive channel  26.79 
 
 
1107 aa  308  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.475668  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3831  MscS Mechanosensitive ion channel  26.79 
 
 
1107 aa  308  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.915765  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4630  hypothetical protein  26.79 
 
 
1107 aa  308  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.250026  normal  0.0442574 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4691  hypothetical protein  25.21 
 
 
1107 aa  308  5.0000000000000004e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00421616  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03991  hypothetical protein  26.79 
 
 
1107 aa  308  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.391275  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4716  hypothetical protein  26.79 
 
 
1107 aa  308  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00612141  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4401  hypothetical protein  26.79 
 
 
1107 aa  308  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.199255  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4625  hypothetical protein  26.17 
 
 
1108 aa  303  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.288253  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4708  hypothetical protein  26.17 
 
 
1108 aa  303  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.749013  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4616  hypothetical protein  26.17 
 
 
1108 aa  303  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.115019  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4765  hypothetical protein  26.17 
 
 
1108 aa  303  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.514219  normal  0.17769 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4744  hypothetical protein  26.17 
 
 
1108 aa  303  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3551  MscS mechanosensitive ion channel  32.66 
 
 
1062 aa  301  5e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0473  hypothetical protein  26.03 
 
 
1104 aa  300  7e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0384  hypothetical protein  25.93 
 
 
1107 aa  295  4e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.207125  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0711  hypothetical protein  26.85 
 
 
1113 aa  286  2.0000000000000002e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.871081  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3664  hypothetical protein  26.86 
 
 
1113 aa  284  7.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.907056  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3811  hypothetical protein  26.86 
 
 
1113 aa  284  7.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.408276  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3304  MscS Mechanosensitive ion channel  35.65 
 
 
1235 aa  275  5.000000000000001e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1453  MscS mechanosensitive ion channel  28.53 
 
 
1105 aa  269  2e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  42.22 
 
 
806 aa  207  6e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  38.46 
 
 
796 aa  179  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  37.55 
 
 
843 aa  173  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  37.35 
 
 
840 aa  171  5e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  42.47 
 
 
864 aa  170  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  35.16 
 
 
685 aa  168  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  35.11 
 
 
299 aa  167  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  39.16 
 
 
291 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  37.36 
 
 
842 aa  165  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  35.44 
 
 
637 aa  162  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1465  hypothetical protein  31.01 
 
 
753 aa  162  4e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  36.6 
 
 
298 aa  160  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  32.09 
 
 
849 aa  159  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3447  mechanosensitive ion channel family protein  37.44 
 
 
816 aa  159  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.597927  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  33.7 
 
 
847 aa  158  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2148  small conductance mechanosensitive Ion channel  33.7 
 
 
847 aa  158  7e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.667496  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  36.16 
 
 
472 aa  155  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1587  MscS mechanosensitive ion channel  36.36 
 
 
807 aa  155  5e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370206  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  32.27 
 
 
844 aa  153  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.275364 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1632  MscS mechanosensitive ion channel  36.11 
 
 
877 aa  152  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253181  normal  0.172693 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>