More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0508 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00416  fused conserved protein  99.55 
 
 		 1120 aa  2273    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  99.55 
 
 		 1120 aa  2273    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5067  potassium efflux protein KefA  40.81 
 
 		 1102 aa  760    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3151  potassium efflux protein KefA  99.55 
 
 		 1120 aa  2273    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.800258  normal  0.703774 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0528  potassium efflux protein KefA  89.08 
 
 		 1120 aa  1972    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5024  potassium efflux system protein KefA, putative  40.5 
 
 		 1134 aa  731    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0519  potassium efflux protein KefA  89.17 
 
 		 1120 aa  1974    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3064  potassium efflux protein KefA  59.85 
 
 		 1120 aa  1323    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1013  potassium efflux protein KefA  60.04 
 
 		 1128 aa  1303    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0501  potassium efflux protein KefA  41.04 
 
 		 1134 aa  734    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4940  potassium efflux protein KefA  41.38 
 
 		 1102 aa  758    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  83.56 
 
 		 1115 aa  1907    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0168  potassium efflux protein KefA  40.49 
 
 		 1110 aa  672    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0445  potassium efflux protein KefA  42.48 
 
 		 1117 aa  777    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.953711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0522  potassium efflux protein KefA  88.79 
 
 		 1118 aa  1962    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  41.27 
 
 		 1111 aa  754    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2883  potassium efflux protein KefA  59.85 
 
 		 1120 aa  1323    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0991479 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1130  potassium efflux protein KefA  59.64 
 
 		 1130 aa  1289    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000811569 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3045  potassium efflux protein KefA  60.67 
 
 		 1133 aa  1327    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5759  potassium efflux protein KefA  39.3 
 
 		 1118 aa  699    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738971  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0538  potassium efflux protein KefA  88.97 
 
 		 1118 aa  1967    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0500  potassium efflux protein KefA  99.55 
 
 		 1120 aa  2272    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527944  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5117  potassium efflux protein KefA  40.98 
 
 		 1102 aa  770    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3204  potassium efflux protein KefA  59.85 
 
 		 1120 aa  1323    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1447  MscS mechanosensitive ion channel  38.68 
 
 		 1166 aa  641    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0397  potassium efflux protein KefA  99.64 
 
 		 1120 aa  2273    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0581  potassium efflux protein KefA  89.06 
 
 		 1118 aa  1968    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.467495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0541  potassium efflux protein KefA  99.55 
 
 		 1120 aa  2273    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1206  potassium efflux protein KefA  38.34 
 
 		 1098 aa  694    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0399  potassium efflux protein KefA  41.24 
 
 		 1102 aa  753    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45100  potassium efflux protein KefA  38.5 
 
 		 1117 aa  690    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.534635  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0508  potassium efflux protein KefA  100 
 
 		 1120 aa  2279    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000540502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66400  potassium efflux protein KefA  39.38 
 
 		 1118 aa  685    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0555  potassium efflux protein KefA  99.82 
 
 		 1118 aa  2272    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00421  hypothetical protein  99.55 
 
 		 1120 aa  2273    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2151  MscS mechanosensitive ion channel  29.11 
 
 		 1158 aa  427  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588  transporter, putative  30.3 
 
 		 1067 aa  395  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0786  MscS mechanosensitive ion channel  30.07 
 
 		 1066 aa  395  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.213544  hitchhiker  0.000495101 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0587  MscS mechanosensitive ion channel  31 
 
 		 1067 aa  396  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0226105 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3443  MscS mechanosensitive ion channel  30.7 
 
 		 1067 aa  396  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0586  MscS mechanosensitive ion channel  30.7 
 
 		 1067 aa  396  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0875624 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3904  MscS mechanosensitive ion channel  28.76 
 
 		 1072 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3721  MscS Mechanosensitive ion channel  28.76 
 
 		 1072 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3778  MscS mechanosensitive ion channel  28.76 
 
 		 1072 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3291  MscS mechanosensitive ion channel  28.91 
 
 		 1068 aa  387  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.563171  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4182  MscS mechanosensitive ion channel  31.14 
 
 		 1070 aa  387  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0547  MscS mechanosensitive ion channel  28.76 
 
 		 1067 aa  386  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3390  MscS mechanosensitive ion channel  34.65 
 
 		 861 aa  385  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3036  transporter, putative  30.59 
 
 		 1080 aa  378  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0415629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0555  MscS mechanosensitive ion channel  28.94 
 
 		 1060 aa  378  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0475901  normal  0.179203 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2257  MscS mechanosensitive ion channel  28.72 
 
 		 1110 aa  370  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371999  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3321  MscS mechanosensitive ion channel  29.22 
 
 		 1078 aa  357  5e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.660513  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04029  predicted mechanosensitive channel  28.49 
 
 		 1107 aa  357  6.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.475668  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3831  MscS Mechanosensitive ion channel  28.49 
 
 		 1107 aa  357  6.999999999999999e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.915765  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5675  hypothetical protein  28.81 
 
 		 1107 aa  357  6.999999999999999e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00234961  normal  0.548719 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03991  hypothetical protein  28.49 
 
 		 1107 aa  357  6.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.391275  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4401  hypothetical protein  28.49 
 
 		 1107 aa  357  6.999999999999999e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.199255  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4716  hypothetical protein  28.49 
 
 		 1107 aa  357  6.999999999999999e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00612141  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4691  hypothetical protein  28.49 
 
 		 1107 aa  357  7.999999999999999e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00421616  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3851  hypothetical protein  28.49 
 
 		 1107 aa  357  8.999999999999999e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332968 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4630  hypothetical protein  28.71 
 
 		 1107 aa  354  4e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.250026  normal  0.0442574 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0421  hypothetical protein  28.79 
 
 		 1115 aa  349  2e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.693078  hitchhiker  0.0000017841 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0345  hypothetical protein  28.89 
 
 		 1103 aa  348  4e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.742298  unclonable  0.00000473028 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3551  MscS mechanosensitive ion channel  28.83 
 
 		 1062 aa  347  5e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  32.97 
 
 		 1144 aa  343  7e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4765  hypothetical protein  27.96 
 
 		 1108 aa  338  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.514219  normal  0.17769 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4616  hypothetical protein  27.96 
 
 		 1108 aa  338  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.115019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4744  hypothetical protein  27.96 
 
 		 1108 aa  338  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4625  hypothetical protein  27.96 
 
 		 1108 aa  338  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.288253  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4708  hypothetical protein  27.96 
 
 		 1108 aa  338  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.749013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0384  hypothetical protein  27.46 
 
 		 1107 aa  332  2e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.207125  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3934  hypothetical protein  26.44 
 
 		 1107 aa  329  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3756  hypothetical protein  26.86 
 
 		 1107 aa  324  5e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0473  hypothetical protein  26.53 
 
 		 1104 aa  323  9.999999999999999e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  28.84 
 
 		 1127 aa  319  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1453  MscS mechanosensitive ion channel  26.37 
 
 		 1105 aa  315  1.9999999999999998e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3304  MscS Mechanosensitive ion channel  27.58 
 
 		 1235 aa  306  2.0000000000000002e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3811  hypothetical protein  28.65 
 
 		 1113 aa  303  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.408276  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3664  hypothetical protein  28.65 
 
 		 1113 aa  303  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.907056  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0711  hypothetical protein  28.38 
 
 		 1113 aa  302  2e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.871081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  40.21 
 
 		 806 aa  212  4e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  42.6 
 
 		 864 aa  209  2e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  41.11 
 
 		 843 aa  191  5.999999999999999e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  40.64 
 
 		 299 aa  187  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1587  MscS mechanosensitive ion channel  42.99 
 
 		 807 aa  185  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3447  mechanosensitive ion channel family protein  42.27 
 
 		 816 aa  182  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.597927  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  39.42 
 
 		 636 aa  178  7e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  39.42 
 
 		 636 aa  177  8e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  32.46 
 
 		 685 aa  174  6.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  34.38 
 
 		 825 aa  174  9e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  36 
 
 		 840 aa  173  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  38.52 
 
 		 291 aa  171  6e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0820  MscS mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 		 849 aa  170  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0343003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0145  MscS Mechanosensitive ion channel  35.69 
 
 		 795 aa  169  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  36.82 
 
 		 842 aa  169  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  40.76 
 
 		 981 aa  170  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  35.91 
 
 		 796 aa  169  4e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  34.31 
 
 		 874 aa  168  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3172  MscS Mechanosensitive ion channel  36.64 
 
 		 784 aa  167  8e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  36.69 
 
 		 847 aa  167  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>