More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4630 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04029  predicted mechanosensitive channel  99.55 
 
 		 1107 aa  2230    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.475668  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3831  MscS Mechanosensitive ion channel  99.55 
 
 		 1107 aa  2230    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.915765  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3851  hypothetical protein  99.46 
 
 		 1107 aa  2229    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332968 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4616  hypothetical protein  89.08 
 
 		 1108 aa  1973    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.115019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3811  hypothetical protein  69.1 
 
 		 1113 aa  1456    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.408276  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0473  hypothetical protein  66.4 
 
 		 1104 aa  1428    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4625  hypothetical protein  89.08 
 
 		 1108 aa  1973    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.288253  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4708  hypothetical protein  89.08 
 
 		 1108 aa  1973    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.749013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0384  hypothetical protein  67.36 
 
 		 1107 aa  1453    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.207125  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4401  hypothetical protein  99.46 
 
 		 1107 aa  2228    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.199255  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4691  hypothetical protein  99.28 
 
 		 1107 aa  2226    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00421616  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0421  hypothetical protein  68.81 
 
 		 1115 aa  1525    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.693078  hitchhiker  0.0000017841 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4630  hypothetical protein  100 
 
 		 1107 aa  2238    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.250026  normal  0.0442574 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0711  hypothetical protein  68.92 
 
 		 1113 aa  1452    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.871081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5675  hypothetical protein  99.64 
 
 		 1107 aa  2231    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00234961  normal  0.548719 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3934  hypothetical protein  68.95 
 
 		 1107 aa  1505    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0345  hypothetical protein  87.71 
 
 		 1103 aa  1951    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.742298  unclonable  0.00000473028 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3664  hypothetical protein  69.1 
 
 		 1113 aa  1456    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.907056  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4765  hypothetical protein  89.08 
 
 		 1108 aa  1973    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.514219  normal  0.17769 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4716  hypothetical protein  99.55 
 
 		 1107 aa  2230    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00612141  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3756  hypothetical protein  69.85 
 
 		 1107 aa  1501    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03991  hypothetical protein  99.55 
 
 		 1107 aa  2230    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.391275  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4744  hypothetical protein  89.08 
 
 		 1108 aa  1973    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3036  transporter, putative  38.28 
 
 		 1080 aa  567  1e-160  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0415629  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588  transporter, putative  36.17 
 
 		 1067 aa  536  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0587  MscS mechanosensitive ion channel  36.39 
 
 		 1067 aa  538  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0226105 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0586  MscS mechanosensitive ion channel  37.61 
 
 		 1067 aa  533  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0875624 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3443  MscS mechanosensitive ion channel  36.29 
 
 		 1067 aa  535  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4182  MscS mechanosensitive ion channel  35.73 
 
 		 1070 aa  530  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0547  MscS mechanosensitive ion channel  35.96 
 
 		 1067 aa  521  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3721  MscS Mechanosensitive ion channel  36.06 
 
 		 1072 aa  522  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3778  MscS mechanosensitive ion channel  36.06 
 
 		 1072 aa  521  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3904  MscS mechanosensitive ion channel  36.06 
 
 		 1072 aa  521  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3321  MscS mechanosensitive ion channel  35.93 
 
 		 1078 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.660513  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0786  MscS mechanosensitive ion channel  34.6 
 
 		 1066 aa  509  9.999999999999999e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.213544  hitchhiker  0.000495101 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0555  MscS mechanosensitive ion channel  35.03 
 
 		 1060 aa  503  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0475901  normal  0.179203 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3291  MscS mechanosensitive ion channel  36.88 
 
 		 1068 aa  499  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.563171  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3551  MscS mechanosensitive ion channel  35.53 
 
 		 1062 aa  474  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  30.78 
 
 		 1111 aa  388  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3045  potassium efflux protein KefA  29.93 
 
 		 1133 aa  379  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0445  potassium efflux protein KefA  28.58 
 
 		 1117 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.953711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2151  MscS mechanosensitive ion channel  29.59 
 
 		 1158 aa  369  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3204  potassium efflux protein KefA  29.68 
 
 		 1120 aa  363  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3064  potassium efflux protein KefA  29.68 
 
 		 1120 aa  363  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2883  potassium efflux protein KefA  29.68 
 
 		 1120 aa  363  1e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0991479 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5117  potassium efflux protein KefA  28.7 
 
 		 1102 aa  360  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1013  potassium efflux protein KefA  30.59 
 
 		 1128 aa  358  3.9999999999999996e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  28.15 
 
 		 1115 aa  355  4e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5067  potassium efflux protein KefA  28.8 
 
 		 1102 aa  351  5e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0399  potassium efflux protein KefA  28.36 
 
 		 1102 aa  350  9e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3390  MscS mechanosensitive ion channel  30.7 
 
 		 861 aa  350  1e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0501  potassium efflux protein KefA  29.21 
 
 		 1134 aa  349  2e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2257  MscS mechanosensitive ion channel  29.16 
 
 		 1110 aa  349  2e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371999  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4940  potassium efflux protein KefA  29.23 
 
 		 1102 aa  348  4e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.310149  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5024  potassium efflux system protein KefA, putative  28.85 
 
 		 1134 aa  345  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00416  fused conserved protein  28.9 
 
 		 1120 aa  342  2e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  28.9 
 
 		 1120 aa  342  2e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3151  potassium efflux protein KefA  28.9 
 
 		 1120 aa  342  2e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.800258  normal  0.703774 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00421  hypothetical protein  28.9 
 
 		 1120 aa  342  2e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0541  potassium efflux protein KefA  28.9 
 
 		 1120 aa  342  2e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0397  potassium efflux protein KefA  28.9 
 
 		 1120 aa  342  2e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0555  potassium efflux protein KefA  29.13 
 
 		 1118 aa  342  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0500  potassium efflux protein KefA  28.9 
 
 		 1120 aa  342  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527944  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0508  potassium efflux protein KefA  29.13 
 
 		 1120 aa  341  4e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000540502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1130  potassium efflux protein KefA  28.94 
 
 		 1130 aa  337  5.999999999999999e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000811569 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1447  MscS mechanosensitive ion channel  30.3 
 
 		 1166 aa  336  1e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0581  potassium efflux protein KefA  28.21 
 
 		 1118 aa  328  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.467495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0528  potassium efflux protein KefA  28.21 
 
 		 1120 aa  328  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0538  potassium efflux protein KefA  28.21 
 
 		 1118 aa  328  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0522  potassium efflux protein KefA  28.21 
 
 		 1118 aa  327  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0519  potassium efflux protein KefA  28.43 
 
 		 1120 aa  327  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  31.74 
 
 		 1127 aa  325  3e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45100  potassium efflux protein KefA  30.02 
 
 		 1117 aa  317  9.999999999999999e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.534635  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  28.59 
 
 		 1144 aa  313  1e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5759  potassium efflux protein KefA  27.87 
 
 		 1118 aa  312  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738971  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66400  potassium efflux protein KefA  27.25 
 
 		 1118 aa  310  6.999999999999999e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1453  MscS mechanosensitive ion channel  24.23 
 
 		 1105 aa  304  6.000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0168  potassium efflux protein KefA  30.84 
 
 		 1110 aa  296  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1206  potassium efflux protein KefA  26.98 
 
 		 1098 aa  289  2e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3304  MscS Mechanosensitive ion channel  25.41 
 
 		 1235 aa  288  2.9999999999999996e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  32.22 
 
 		 806 aa  158  6e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  35.14 
 
 		 860 aa  154  8.999999999999999e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  35.29 
 
 		 299 aa  152  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1632  MscS mechanosensitive ion channel  31.6 
 
 		 877 aa  148  5e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.253181  normal  0.172693 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2422  MscS Mechanosensitive ion channel  25.26 
 
 		 844 aa  145  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275364 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4139  MscS Mechanosensitive ion channel  38.07 
 
 		 815 aa  143  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0452  MscS Mechanosensitive ion channel  30.58 
 
 		 853 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.372575 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  31.87 
 
 		 843 aa  143  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  34.67 
 
 		 637 aa  143  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2163  MscS Mechanosensitive ion channel  35.06 
 
 		 843 aa  143  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.257742  normal  0.626494 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5470  MscS mechanosensitive ion channel  33.88 
 
 		 835 aa  141  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0786  MscS Mechanosensitive ion channel  33.88 
 
 		 840 aa  141  6e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0857  MscS mechanosensitive ion channel  33.88 
 
 		 840 aa  141  6e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  29.34 
 
 		 840 aa  141  8.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0914  MscS mechanosensitive ion channel  30.47 
 
 		 842 aa  140  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707445 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  28.37 
 
 		 867 aa  140  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03384  small-conductance mechanosensitive channel  36.33 
 
 		 803 aa  139  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.670806  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1994  MscS mechanosensitive ion channel  32.26 
 
 		 796 aa  138  7.000000000000001e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.952395 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3407  MscS mechanosensitive ion channel  32.43 
 
 		 832 aa  138  7.000000000000001e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2316  mechanosensitive ion channel family protein  35.09 
 
 		 773 aa  137  8e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>